組織機構
檢徽溫州出入境檢驗檢疫局內設辦公室、政工處、綜合業務處、法制與稽查處、衛生與食品檢驗檢疫處、動植物檢驗檢疫處、機電檢驗處、輕紡檢驗處、化礦檢驗處、港口檢疫與鑑定處、檢務處、財務處等12個科級機構，下設鰲江辦事處、機場辦事處、樂清辦事處、瑞安辦事處（籌）四個副處級分支機構。下屬事業單位有溫州出入境檢驗檢疫局綜合技術服務中心、溫州出入境檢驗檢疫技術中心和浙江國際旅行衛生保健中心溫州分中心（溫州國際旅行衛生保健中心）。
全局目前共有正式在編人員 145人，包括行政編制97人，事業編制48人，其中大學本科以上學歷113人（碩士研究生27人，博士研究生1人），占總人數的77.40 %；中級職稱以上技術人員57人，占總人數的39.04%。我局的國家級低壓電器檢測重點實驗室（浙江）【浙江省檢驗檢疫科學技術研究院低壓電器實驗室（溫州）、溫州檢驗檢疫技術中心電器產品檢測實驗室】，溫州檢驗檢疫技術中心理化生物檢測實驗室（理化、微生物檢測室）、機械輕工產品檢測實驗室（打火機檢測室、鞋類檢測室、玩具檢測室）、綜合檢測實驗室壓力容器檢測室（鰲江）和溫州國際旅行衛生保健中心實驗室均已通過中國合格評定國家認可委員會（CNAS）實驗室認可和計量認證，具備對農畜、食品、化工、機電、家電、輕工、紡織、服裝、紡織原料等多種大類商品的質量檢測能力；對進出口商品的數量、重量、包裝、殘損鑑定和外商投資財產價值鑑定的能力；對動植物檢疫和衛生檢疫能力；對出入境人員傳染病監測和動植物疫病檢測的能力。
工作業績
一直以來，溫州出入境檢驗檢疫局按照國家質檢總局、省局和溫州市委、市政府的要求，一方面嚴格履行為國把關的神聖職責，一方面積極服務溫州外向型經濟發展，寓監管於服務中，在服務中體現監管，不斷提高工作質量。2009年，溫州檢驗檢疫局共檢驗檢疫出入境貨物181732批，總貨值54.87億美元；共截獲各類動物疫情62批次，植物疫情262批，醫學媒介生物95批次。
溫州出入境檢驗檢疫局大力開展精神文明創建工作，並取得了較好的成績，先後獲得：全國文明單位、全國質檢系統先進集體、省級文明單位、全國青年文明號（報檢廳）、浙江省青年文明號十年成就獎（報檢廳）、溫州市政府外向型經濟優良服務單位等榮譽。
四，機構職責
（一）貫徹執行出入境衛生檢疫、動植物檢疫和進出口商品檢驗法律、法規和政策規定的實施細則、辦法及工作規程，負責所轄區域的出入境檢驗檢疫、鑑定、認證和日常監管等行政執法工作。
（二）負責實施所轄區域出入境衛生檢疫、傳染病監測和衛生監督，負責口岸傳染病的預防與控制工作，負責出入境人員的預防接種和傳染病監測體檢等工作。
（三）負責實施所轄區域出入境動植物及其產品和其他檢疫物的檢驗檢疫與日常監管工作，負責動植物疫情監測、調查和匯總報告等工作，實施動植物疫情的緊急預防措施。
（四）負責實施所轄區域進出口商品（含食品）的法定檢驗和日常監管工作，負責實施一般包裝和出口危險品貨物包裝檢驗，負責進出口商品鑑定管理工作，負責實施外商投資財產鑑定，辦理進出口商品復驗工作。
（五）負責實施與所轄區域進出口食品、動植物及其產品等的生產（養殖、種植）、加工和存放等單位衛生、檢驗註冊有關的宣貫、受理、考核及日常監管，負責實施與進口安全質量許可制度相關的日常監管，負責實施與出口質量許可制度相關的宣貫、受理、考核及日常監管，負責實施產品和體系認證工作。
（六）負責實施所轄區域國家實行進口許可制度的民用商品的入境驗證，負責出口、轉口商品的有關出境驗證。
（七）負責實施所轄區域出入境交通運載工具和貨櫃及容器的衛生監督、檢疫監督和有關的適載檢驗、鑑定，負責出入境交通運載工具、貨櫃、包裝物及鋪墊材料和貨物的衛生除害處理等工作。
（八）負責執行國家、國務院有關部門和國家質量監督檢驗檢疫總局簽署的有關檢疫、檢驗的國際協定、協定和議定書等，負責技術性貿易壁壘協定和檢疫協定的具體實施工作。
（九）負責簽發所轄區域出入境檢驗檢疫證單和標識、封識，並進行監督管理，負責出口商品普惠制原產地證和一般原產地證的簽證工作。
（十）負責所轄區域的出入境檢驗檢疫業務統計，調查和收集國外傳染病疫情、動植物疫情和國際貿易商品質量狀況，提供有關信息。
（十一）承擔對所轄區域內各類涉外檢驗檢疫、鑑定和認證機構（包括中外合資、合作機構）以及衛生除害處理機構的監督管理。
（十二）負責所轄區域出入境檢驗檢疫科技、標準化和信息化工作的具體實施，承擔省局下達的各項科研製標任務。
（十三）負責本局人事管理、教育培訓、外事、財務、基建、物資管理、紀檢監察、審計、精神文明建設和思想政治工作。
（十四）負責下屬單位的各項管理工作。
（十五）承辦浙江出入境檢驗檢疫局交辦的其他工作。
機構設定
一、辦公室
職能：負責協調機關日常工作和重要事項的督查督辦，組織重要會議；負責秘書、機要、保密、文印、檔案、辦公自動化、政務信息、宣傳以及情報資料和標準化工作；負責行政管理和接待工作，負責安全保衛管理工作；負責全局綜合績效管理體系運行工作。
負責人：陳先訓
辦公地址：溫州市學院中路315號
二、法制與稽查處
職能：負責法律法規宣傳教育、檢驗檢疫執法稽查和業務工作質量檢查；負責行政處罰工作；負責檢驗檢疫行政執法人員行政執法行為的監督檢查工作；負責目錄外商品和市場流通領域進口商品的監督抽查工作；配合有關部門做好打擊走私等活動的組織協調工作。
負責人：南勝強
辦公地址：溫州市學院中路315號
三、綜合業務處
職能：負責檢驗檢疫業務綜合、協調和業務統計、分析工作；負責質量許可、衛生註冊登記（備案）和對外註冊等的協調管理工作；負責認證認可監督管理工作；負責科技管理工作；負責大通關工作的協調管理，組織開展檢驗檢疫電子監管工作；負責檢驗檢疫監管模式改革管理工作；負責計算機信息系統的管理和日常維護工作；負責出入境檢驗檢疫質量等問題的追溯調查管理工作。
負責人：王 敏
辦公地址：溫州市學院中路315號
四、衛生檢疫處
職能：歸口管理出入境衛生檢疫、傳染病監測和口岸衛生監督和突發公共衛生事件防控工作；負責出入境人員健康體檢與預防接種的監督管理工作；收集、分析和通報國內外有關傳染病疫情信息；歸口管理各海港口岸的檢疫與鑑定工作；負責甌江南岸港區和狀元岙港區出入境人員、運載工具、貨物、裝載容器等的衛生及動植物檢疫、鑑定工作；負責管轄港區內的疫情監測工作；組織對管轄區內的有關質量事故調查工作；負責局所屬衛生除害處理企業的直接管理工作。
負責人：周德亮
辦公地址：溫州市學院中路315號
五、動植物檢驗檢疫處
職能：負責出入境動物、非食用動物產品（含寵物用品、皮張等）的檢驗檢疫監管工作；負責出入境植物、植物產品（含木質包裝）的檢驗檢疫監管工作；負責國際郵包、快件的檢驗檢疫監管工作；收集、分析和通報動植物疫情信息，實施動植物疫情的緊急預防措施；組織對出入境動植物及其產品質量事故調查；負責衛生除害處理及其機構的監督管理；配合做好分管商品的質量許可、衛生檢疫註冊登記的考核和監督檢查。
負責人：王成炬
辦公地址：溫州市學院中路315號
六、食品檢驗檢疫處
職能：負責進出口食品（包括肉類、水產品等食用性動植物產品）的衛生、質量檢驗和日常監管；負責進出口化妝品的檢驗監管工作；負責進口食品、化妝品的後續監管工作；收集、分析和通報進出口食品、化妝品質量信息；組織開展進出口食品、化妝品質量事故調查；配合做好分管商品的衛生註冊登記的考核和監督審核工作。
負責人：鄭文陸
辦公地址：溫州市學院中路315號
七、機電檢驗處
職能：負責進出口機電儀商品（包括單件商品、醫療器械等）、成套設備及其零配件、車輛、遊樂設施的檢驗監管；負責外商投資財產的鑑定工作；負責對重要進口設備的裝運前預檢驗、鑑定、監造或監裝；收集、分析和通報相關產品質量信息；組織對相關進出口產品的質量事故調查；配合做好分管商品的進出口安全質量許可的考核和監督檢查。
負責人：汪 波
辦公地址：溫州市學院中路315號
八、輕紡檢驗處
職能：負責進出口鞋類、紡織品、服裝等商品的檢驗和日常監管工作；收集、分析和通報相關產品質量信息；組織對相關進出口產品的質量事故調查；配合做好分管商品的進出口安全質量許可的考核和監督檢查。
負責人：宋益國
辦公地址：溫州市學院中路315號
九、化礦檢驗處
職能：負責進出口化工產品（包括合成革等），礦產品，金屬材料及其製品（包括鎖具、鉗類等五金製品），塑膠及其製品，橡膠及其製品，陶瓷產品，玻璃及其製品和可利用廢物等貨物的檢驗監管工作；負責進出口危險品及其包裝（包括打火機、點火槍和煙花爆竹等）的檢驗鑑定工作；負責進出口食品包裝及材料和普通包裝的檢驗監管工作；收集、分析和通報相關產品質量信息；組織對相關進出口產品的質量事故調查；配合做好分管商品的進出口質量許可的考核和監督檢查。
負責人：吳海
辦公地址：溫州市學院中路315號
十、檢務處
職能：歸口管理全局檢務工作，負責局本部檢驗檢疫報檢、計費、簽證、放行、歸檔等工作；負責全局出入境檢驗檢疫的流程管理；負責檢驗檢疫標誌和封識管理；負責普惠制原產地證、一般原產地證和區域性原產地證的簽發和管理；負責全局檢驗檢疫證單和業務用印鑑的管理；負責報檢單位及產地證申領企業的註冊登記和備案管理；負責報檢員和產地證申領員的培訓和管理；負責原產地地理標誌管理工作。
負責人：黃 華
辦公地址：溫州市學院中路315號
十一、政工處
職能：負責人事管理、勞動工資、教育培訓、出國（境）人員管理和老幹部工作；負責思想政治、精神文明建設、機關黨務、工會、群團工作；負責紀檢監察、信訪工作；負責計畫生育管理工作；負責國檢文化建設工作。
負責人：鄧軍
辦公地址：溫州市學院中路315號
十二、財務處
職能：負責局本部和下屬單位的財務會計、計畫預算、基本建設、專項資金管理，負責全局收費管理工作，負責政府採購的組織和儀器設備的管理工作，負責對下屬單位的財務監督檢查和內部審計工作。
負責人：谷慧敏
辦公地址：溫州市學院中路315號
十三、綜合技術服務中心
職能：負責機關後勤保障和安全保衛工作，負責全局車輛管理工作，管理所屬經營服務性企事業單位，負責全局資產管理工作。
負責人：劉家新
辦公地址：溫州市學院中路315號
十四、溫州出入境檢驗檢疫技術中心（浙江檢驗檢疫科學技術研究院溫州分院）
職能：承擔出入境檢驗檢疫的實驗室檢測、研究諮詢與檢疫風險分析；承擔科研與技術開發、服務，提供技術指導，開展有關檢驗檢疫方法和標準的制、修訂工作；按照有關規定，承擔委託檢驗、鑑定和非法定檢驗檢疫、鑑定和檢測。
負責人：黃雲樞
辦公地址：溫州市學院中路315號
十五、溫州國際旅行衛生保健中心（浙江國際旅行衛生保健中心溫州分中心）
職能：開展出入境傳染病監測與健康體檢，國際旅行預防接種、衛生保健諮詢和宣傳，醫療保健門診、衛生檢疫技術科研開發與服務等工作。
負責人：周振達
辦公地址：溫州市黎明西路307弄24號
十六、溫州出入境檢驗檢疫局鰲江辦事處
職能：負責平陽、蒼南、文成和泰順縣區域內的出入境檢驗檢疫工作。
負責人：周國芳
辦公地址：平陽縣鰲江鎮興鰲路檢驗檢疫大樓
十七、溫州出入境檢驗檢疫局機場辦事處
職能：負責溫州永強機場範圍內的出入境檢驗檢疫工作。
負責人：何獻武
辦公地址：溫州市機場路1號
十八、溫州出入境檢驗檢疫局樂清辦事處
職能：負責樂清市、永嘉縣烏牛鎮和甌江北岸港區的出入境檢驗檢疫工作。
負責人：龔平
辦公地址：樂清市柳市鎮柳江大道檢驗檢疫大樓
十九、溫州出入境檢驗檢疫局瑞安辦事處
職能：負責瑞安市區域內的出入境檢驗檢疫工作
負責人：董士華
辦公地址：瑞安市經濟開發區集賢路699號
