內設科室
中心於2004 年3月正式組建成立，內設綜合管理科、藥品生產認證科、藥品經營認證科、藥品註冊審評科、醫療器械審評認證科5個職能科。因中心現有人員較少，基本上沒有按照科室運行的模式進行管理。
人員編制
現有工作人員8 名，其中省局行政編制人員2 名（主任和副主任）、省局工勤編制人員1 名( 負責行政後勤和出納工作)、中心事業編制人員5名( 負責相關業務工作)。
主要職能
2004年5月，省局推行行政審批制度改革工作，省局成立了行政審批服務中心，負責行政許可事項的統一受理、統一發證、統一告知；藥品審評認證中心負責行政許可事項的技術審查及現場檢查；省局有關業務處室負責行政許可事項的綜合審核。省局對中心的職責進行了明確，其主要職能為：負責藥品、醫療器械、保健食品、藥包材、醫療機構製劑的技術審查及現場核查；負責藥品、醫療器械生產、經營許可證和醫療機構製劑許可證的技術審查及現場檢查；負責藥品GMP 、GSP 認證和飛行檢查的技術審查及現場檢查；負責藥品、醫療器械、保健食品廣告的技術審查及日常監測。目前中心在省局辦公，沒有獨立出來，基本上按省局的一個內設處室管理。
發展
中心組建三年多來，不斷探索藥品審評認證工作機制，建立了相關規章制度和工作程式，設立了認證檢查員庫和技術審評專家庫，積極依靠社會力量開展審評認證工作。
