學院下設4個教研室(針灸教研室、推拿教研室、醫學康復教研室、醫學美容教研室)和針灸推拿研究所下屬的4個實驗室(實驗針灸實驗室、電生理實驗室、針灸免疫實驗室、推拿手法測試室),以及行政辦公室和學生工作辦公室。有一家直屬的以針灸推拿為特色的浙江中醫藥大學附屬第三醫院(又名浙江省針灸推拿醫院),是本專業的主要實踐基地。
學院建有高標準的、全國同類專業一流的針灸示教室,推拿示教室,練功房,體能訓練室,功法和推拿手法測試室,針灸實驗室,學生針灸推拿和醫學美容兩個模擬診室,康復醫學示教室等。本院現有教職工43人,其中正高職稱13人,副高職稱13人,中級職稱17人,其中博士學位6人,碩士學位17人。十餘年來,共培養針灸、推拿專業等本、專科學生1400餘人,碩士研究生32人。現有本科學生408人,碩士研究生40人。同時培養了一大批成教學生、國外進修生和留學生。主要承擔本科課程和5門研究生課程的教學。
目前承擔國家973計畫項目1項,子課題1項,“十一五”國家科技支撐計畫子課題1項,國家自然基金課題2項,省自然基金3項,其它省部級課題4項。近五年獲省科技進步三等獎2項,國家教育部科學技術獎自然科學一等獎1項,中華中醫藥學會科學技術獎二等獎1項,廳級科技創新獎6項,發表科研論文61篇,論著8部。近五年獲省教學名師1人,衛生部教學課件二等獎1項,中華中醫學會科普著作一等獎2項,現有教育廳教改課題2項,校級9項,省精品課程3項,校級精品課程1項,出版教材和教學參考書21本,發表教學論文28篇。
浙江中醫藥大學附屬第三醫院是學院直屬臨床教學基地,是浙江省目前規模最大的集臨床、教學、科研一體的針灸推拿專科性醫院。核定病床200張,:“浙江名中醫館”也設在醫院三樓,名中醫優勢享譽省內外。醫院建有中醫腦病治療中心、風濕病治療中心、脊柱及骨關節病治療中心。有針灸科、推拿科、中醫骨傷科、康復科、醫學美容科,以及中西醫內科、中西醫內科、中西醫婦科等臨床科室,具有鮮明的中醫、針灸、推拿、骨傷、康復治療特色,為本院學生後期臨床教學提供了有力的保障。