泛美波多黎各大學最享有盛譽的是法律學院和眼科學院。但該校作為一所綜合性大學,設有從準學士、學士到碩士、博士等的各學位,課程設制也豐富多樣。
準學士學位專業有:會計、視聽傳播技術、商業管理、化學技術、計算機學、基礎學校教育、保險管理、室內裝潢與設計、法制、市場管理與銷售、護理、無線電技術和秘書學等。
學士學位專業有:會計、航空科學、考古學、藝術、視聽技術、生物學、商業管理、管理信息系統、電子工程技術、財經、家庭經濟學、工業關係學、保險、市場學、醫學技術、政治學、心理學、宗教學、社會學、法律、音樂、地理、歷史、保健、體育教育與聯繫、教育學和英語、德語、拉丁語、西班牙語等語種。
碩士學位專業有:商業管理與管理學、商務教育、犯罪審理、經濟學、教育學、基礎教育、指導與諮詢、特殊教育、勞工關係、圖書館信息學、語言學、醫學技術、心理學、社會研究和西班牙語等。
博士學位專業有:教育學、課程設定與指導、教育管理等。