規劃
根據規劃，泉州市植物園將分兩期建設。近期為2011年—2014年，規劃建設目標為：基本完成基礎設施建設，大力開展引種馴化工作，進行主要專類園的建設，建成初具規模的省內知名植物園，有效連線西側俞大猷公園和東側仙公山森林公園，形成帶狀生態保護區。遠期為2015年—2020年，規劃建設目標為：按總體規劃要求，採用高新技術手段和配備現代化設施，完成引種規劃目標，完善各功能分區及專類園的建設；加強科研科普隊伍建設，最佳化強化管理機制，不斷提高科研成果，建成省內一流、國內知名的現代化植物園。計畫到2020年完成引種馴化熱帶和部分亞熱帶植物7500種。
近期的規劃建設目標，包括完成一級車行道、二級車行道、步游道、停車場、入口管理服務區建設等基礎設施建設，重點建設引種馴化區及植物展示區的主要植物專類園（閩台植物園、南洋植物區、盆景園、水生植物區、藥用植物園、草本花卉園、藤本植物區、茶園）；同時，有效聯結西側俞大猷公園和東側仙公山森林公園，形成帶狀生態保護區 。
遠期建設將採用高新技術、現代化設施建設實驗苗圃區並完善各功能分區。按規劃完成其他植物專類園（刺桐園、灌木彩葉植物區、大花喬木區、岩生植物區、竹類植物區、果木園）建設。生態保育區完成林相改造並形成良好生態景觀。
泉州植物園據了解，泉州市植物園規劃建設觀賞植物專區、文化植物專區、經濟植物專區和生態科普專區四大區塊。其中，觀賞植物專區包括了大花喬木園、藤本灌木園、草本花卉園、濕生園、絢秋園、姜目園、蔭生園、竹類園、鑲嵌園共九個專類園；文化植物專區包括了市樹市花園、南洋園、同根園、佛文化園、盆景園共五個專類園；經濟植物專區包括了農耕園、園藝花園、茶園、香花保健園、果木園共五個專類園；生態科普專區包括了引種馴化園、鄉土群落園、招鳥園、生態觀光廊道、生態撫育林共五個專類園。?
十六園分類
引種馴化區：植物引種馴化的基本任務之一是通過引進其他地區的植物品種，經隔離試種、馴化，採用高新技術對有價值的材料進行快速繁殖並推廣到生產部門。通過引種馴化，培育出觀賞植物和園林植物的新品種，為城市綠化提供新的植栽品種，提高城市綠化和美化的品位和檔次，為城市建設做出貢獻。
實驗苗圃區：將引種馴化選育出的新品種在實驗苗圃地進行栽培實驗，總結栽培經驗。本區還可通過種子和無性繁殖、組織培養等生物技術，對珍稀瀕危植物進行保護性開發利用。 生態保育區：對山體林相進行相應改造，豐富色彩變化，形成群落型景山林。嚴禁採石，對林中的採石坑需恢復植被，形成水土保持良好的山林生態。 閩台植物區：閩台兩地植物區系的相識性程度很高，植物園設閩台植物區，可以顯示閩台綠地植被的地帶性特徵，挖掘地帶性南亞熱帶園林植物資源。本區展示台灣、金門適種於泉州的植物為主。 南洋植物區：本區以棕櫚科植物具熱帶風情，有很高的觀賞價值。廣布世界熱帶、亞熱帶地區種類達3000餘種，有喬木，也有灌木及藤本類型。 盆景區：盆景園內設賞石館，陳列賞石及岩石標本，也可結合裸露岩石種植岩生植物，布置成天然大盆景。 水生植物區：水生植物園是根據植物在不同環境下的生長特徵及其對水動、靜、深、淺的不同要求，進行科學合理的配置而形成的園林景觀。 竹類植物區：規劃收集多品種竹子，選擇南坡地形，形成一定規模的竹海。 灌木、彩葉植物區：收集多品種灌木，形成色彩斑斕的植物景觀。 萌生植物區：萌生植物主要指雖陽光不足也能正常生長的綠色植物。 大花喬木區：大花喬木是園林綠化的重要品種，很值得研究和推廣套用。 岩生植物區：根據園區的一些自然岩石，在其旁配植各種適合泉州生長的岩生植物。 藥用植物園：即百草園，培植藥用植物，讓中醫藥學發揚光大。可根據植物的習性，因地制宜依山就勢種植各種藥用植物。 草本花卉園：本區含切花生產示範及草本花卉展示部分。 刺桐園：本專類園收集各種刺桐屬植物。 茶園：泉州茶文化早已名滿天下。結合自然山勢地形規劃茶園，形成層層梯田的茶園風景。 果木園：主要種植閩南的各種果樹。
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植物園功能
國際上通常認為，一個文明程度較高的大城市，都必須擁有自己的植物園、歌劇院、博物館。植物園為專用綠地，與一般的景區、公園有著本質的區別。它有三大功能：一是物種多樣性保護；二是向人們普及植物學知識和園藝學知識；三是引種馴化等遷地保護的科學研究工作。
根據規劃，泉州市植物園將建設成以優美的熱帶、亞熱帶植物群落構成主體專類園，以令人沉醉的園林景觀和自然野趣為特色，以科研和植物引種馴化為根本，兼備科普教育、觀光遊覽、旅遊休閒、健身養生等多種功能的區域性綜合植物園。（朝暉 輯）
