汗馬保護區保持著原始的,完整的生態系統,具有典型的寒溫帶明亮針葉林特徵,生態系統結構完整,功能健全,特點突出。保護區植物有88科222屬468種,其中地衣植物6科7屬14種,蕨類植物有8科9屬16種,苔蘚植物17科18屬24種,裸子植物2科4屬5種,雙子葉植物43科139屬342種,單子葉植物12科35屬67種。汗馬保護區有國家二級重點保護野生植物4種,即鑽天柳、黃芪、草蓯蓉、大花勺蘭;自治區級保護植物有樟子松、興安翠雀花、東方五福花、 手掌參、芍藥、興安升麻、細葉百合、篤斯越桔、北極花等9種。
由於汗馬自然保護區地理位置偏遠、遠離居民區、未受過任何人為干擾。最原始的土壤和植被中充滿了野生動物的氣息,是野生動物的重要棲息地,保護區內有脊椎動物174種,其中魚類5目8科26種,兩棲類2目4科6種,爬行類2目3科6種,鳥類12目28科106種,獸類6目12科30種。在106種鳥類中。在保護區所見的106種鳥類種中,有留鳥32種,夏候鳥71種,冬候鳥3種。保護區具有國家重點保護野生動物26種,其中國家一級重點保護物種4種,國家二級重點保護野生動物22種,國家一級重點保護動物有鳥類中的細嘴松雞和獸類中的紫貂、原麝、貂熊;國家二級重點保護動物有小天鵝、鳶、蒼鷹、灰臉鷹、燕隼、紅隼、花尾榛雞等鳥類、以及棕熊、猞猁、馬鹿、駝鹿、雪兔等獸類。
保護區有河流濕地、湖泊濕地和沼澤濕地三大類型濕地,濕地總面積22724公頃,是激流河的主要發源地之一。保護區濕地對於水資源調控、水質淨化、減少水旱災害、防止水土流失、保持激流河流域甚至整個黑龍江流域生態安全都具有重要的意義。
汗馬保護區在2006年成立管理局,下設辦公室、保護管理科、科研監測科、科普宣教中心、四個管理站和一個公安派出所。2006年汗馬保護區被國家林業局評選為“示範保護區”,2007年汗馬保護區成為中國生物圈保護區網路成員。保護區自成立以來,在國家林業局,內蒙古自治區,大興安嶺林管局的支持下,先後完成了一、二期基礎工程建設項目,逐步建立了自身的管理體系和運作機制,積極開展了基礎設施建設和野生動植物資源保護工作,深入進行了有關基礎科學調查研究,加強了對擴大公眾的宣傳教育等工作,為今後的生態保護,構建生態文明,促進社會和諧發展發揮更大的作用。
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