植物特徵
水韭根莖短，塊狀，不分枝，底部2-4淺裂；小型或中型蕨類，多為水生或沼地生。莖粗短，塊狀或伸長而分枝，具原生中柱，下部生根，有根托。葉螺旋狀排呈叢生狀，一型，狹長線形或鑽形，基部擴大，腹面有葉舌；內部有分隔的氣室及葉脈1條；葉內有1條維管束和4條縱向具橫隔的通氣道。孢子囊單生在葉基部腹面的穴內，橢圓形，外有蓋膜覆蓋，二型，大孢子囊生在外部的葉基，小孢子囊生在內部的葉基。孢子二型，大孢子球狀四面形，小孢子腎狀二面形。配子體有雌雄之分，退化；精子有多數鞭毛。染色體基數x=11。
分子生物學證據顯示中國的4種水韭與澳大利亞的I. brevicula和紐西蘭的1.kirkii處於系統樹的同一分化支，而高寒水韭I. hypsophila處於這一分化支的基部。但要揭示中國水韭種類的起源與演化歷史還有待於進一步研究。
屬模式種
水韭屬屬的模式: Isoetes lacustris L.
下轄物種
| 描述 | 中文名 | 拉丁名 |
| 中型水生或沼生蕨類；葉長(10)15厘米以上。 | ||
| 沼地生植物，葉長15-30厘米，寬1-2毫米，孢子囊具白色膜質蓋。 | 中華水韭 | Isoetes sinensis Palmer |
| 水生或沼地生草本，葉寬5-10毫米，孢子囊無膜質蓋。 | ||
| 沉水生草本，葉長20-30厘米；大孢子表面具網脊不平的不規則網狀紋飾。 | 雲貴水韭 | Isoetes yunguiensis Wang Q. F. & W. C. Taylor |
| 淺水生或沼地生草本，葉長10-25厘米；大孢子表面具皺紋狀一網狀紋。 | 台灣水韭 | Isoetes taiwanensis De Vol |
| 小型沼生蕨類；葉長3-4.5厘米，寬約1毫米；大孢子表面光滑無紋飾。 | 高寒水韭 | Isoetes hypsophila Hand.-Mazz. |
