明清時歸化縣均隸屬於汀州府。
民國時期先後屬西路觀察使署、汀漳道、省直屬、龍漳省、第八、第七、第九、第六行政督察區,並於民國22年(1933年)4月,因縣名與綏遠省歸化城同名而改為明溪縣。1949年10月24日,明溪解放,屬永安專員公署管轄。1956年7月,明溪縣與三元縣合併,稱三明縣,改屬南平專署管轄。
1961年11月,明溪恢復縣級建制,仍稱三明縣,隸屬省轄三明市。1964年4月恢復為原明溪縣名,屬三明專署管轄。
1978年3月,明溪縣屬三明地區行政公署管轄。
1983年4月,明溪縣隸屬三明市。