機構設定主要出口產品為竹木製品、工礦產品（樟腦粉、鞋類）、食品（味素、香菇、水煮筍、茶葉）等，主要出口市場是日本、歐盟、美國、東南亞、中東。內設“一室三科一中心”，即辦公室、旅檢科、檢疫查驗科、檢驗監管科、保健分中心。現有工作人員34人，其中在編16人（大專以上學歷占93.8%，黨員占62.5%）。目前建有茶葉檢驗室、生物媒介實驗室、生物媒介展藏室和愛滋病抗體篩查實驗室、視頻監控中心、檢疫犬馴養中心、植物檢疫綜合實驗室。
