1964年,楊有賡首次在貴州錦屏等地發現我國苗侗民族著名文獻遺產“清水江文書”(又稱“錦屏文書”),並最早對其開展一系列整理研究。1988年執筆主編並出版國家民委民族問題五種叢書之一《侗族社會歷史調查》,首次系統介紹清水江文書概貌。1995年獲日本國際學術交流基金會資助,應邀赴日講學,以“外國人研究員”身份在東京外國語大學國立亞非語言文化研究所從事合作研究。2001-2003年,陸續在東京外國語大學出版《貴州苗族林業契約文書彙編》三大冊,首次將清水江文書推向國際學術舞台。楊有賡是學術界公認的清水江文書發現者和整理研究開拓者,是國際知名、目前全國首屈一指的苗侗民族契約文書專家。