曾受業新會陳白沙先生門下，學問大進，24歲中舉人,27歲弘治庚戌科（1490年）中進士。初任永嘉縣知縣，適遇天大旱，林廷獻反對求神禱雨，倡率民眾興修水利,灌溉農田，解除旱患。每遇災年，則開倉賑濟。重視文教，開拓學宮,文風大振。升任蘇州同知時，永嘉人民挽留拜送，井建生飼，奉祀追思。蘇州同成任務。奉命監造夏周二公伺，僅花極少費用，不到兩個月就完成滿竣工，奉命清理崇明沙田丈量工作，革除舊習，頒發新規。並嚴厲革除織造陋規，大大減輕民眾負擔。在任三月，因母喪丁憂在家。後補建昌同知，公正廉明，精兵簡政，成績昭著。離職後,當地百姓建立生詞敬祀。
林廷獻生平勤學守信，淡視功名富貴。其精通理學，深受陳白沙器重，親筆寫了“擊玉又敲金,思君對我吟,江門臨水坐，明月二更深”中堂一幅贈與林廷獻。清代翰林陳蘭彬曾在其上加記題跋，現在複製木刻橫幅留存。晚年著有《南峰詩集》木刻本，現已失存。
