起因
杜賈爾村案2005年7月16日，伊拉克特別法庭主審法官拉伊德·朱希宣布即將審判薩達姆。8月23日，薩達姆·海珊證實除了一位伊拉克律師杜萊米之外他已解僱了整個國際律師辯護團。8月28日，伊拉克總統賈拉勒·塔拉巴尼表示，如果薩達姆·海珊被判死刑，他不會在薩達姆·海珊的死刑執行令上籤字，塔拉巴尼在兩周前簽署了自薩達姆·海珊政權倒台之後的首份死刑執行令，而有更多的死刑執行令尚未簽署。一旦杜賈爾村屠殺案的指控得以成立的話，薩達姆·海珊將有可能面臨死刑判決。伊拉克過渡政府發言人庫貝於9月4日證實對薩達姆·海珊就杜賈爾村屠殺什葉派居民一案的第一次審判將從10月19日開始，而10月15日將就新憲法舉行全民公決。與薩達姆·海珊一起受審的還有七名前政權高官。9月6日來自伊拉克臨時政府的訊息，審訊薩達姆·海珊獲得重要證據，並且薩達姆·海珊已經在證詞上籤字，包括像“親自下達處決令”發動1987年至1988年的安法爾戰役這樣的口供，但薩達姆·海珊堅稱自己的行為在他的統治期間合法。10月18日，英國《泰晤士報》報導，參加審判伊拉克前領導人薩達姆·海珊一案的有關法官近幾個月在英國接受了秘密培訓。
過程
一審
審判於10月19日當地時間午後不久正式開始。法庭是前復興社會黨全國指揮部內的一個房間。伊拉克特別法庭以反人類罪正式對薩達姆進行審判。薩達姆拒絕說明身份，並拒絕承認有罪。薩達姆反問法庭的合法性：“你們是誰？這個法庭想怎樣？”“我仍保有身為伊拉克總統的憲法權利,我不承認授權你們的組織…以不公正為基礎的就是不正當…我不會回答這個所謂的法庭及其所有相關人士的問題。”法庭宣布對前總統薩達姆的審判已經結束，將休庭至11月28日再次開始。伊拉克特別法庭審判長阿明表示，推遲對伊前總統薩達姆審判的主要原因是許多證人由於過於害怕不願出庭作證。伊拉克警方10月20日稱，一名薩達姆及7名前政權高官辯護律師團成員薩阿敦·薩吉爾·賈納比在巴格達辦公室中被武裝人員綁架。伊拉克律師協會一名官員10月21日說，遭綁架的薩達姆案辯護律師賈納比已被殺害，警方已經找到了他的屍體。英國《星期日快報》10月23日報導，負責審訊薩達姆的5名法官和主要檢舉律師目前已與美英政府達成一項“台下交易”：一旦審薩工作完成，他們與其家人將被獲準移民美英兩國重新開始“新生”。11月8日，辯護律師團的又一名律師在巴格達乘坐的汽車裡被槍手開槍打死。同車的另一名律師中彈受傷。死亡的律師名叫祖拜迪，他負責替前副總統拉馬丹辯護。二審
11月28日，法庭在巴格達重新開庭，薩達姆向法官發難，譴責法庭對他的“非人待遇”。12月5日，辯護律師杜萊米對審判薩達姆的特別法庭的合法性提出質疑，但首席法官堅持繼續進行審判程式。辯護律師們走出法庭表示抗議，審判不得不再次休庭。一個多小時以後，律師們重新返回法庭，審判恢復。第一位證人艾哈邁德·哈桑·默罕默德也在法庭上露面，他描述了杜傑勒大屠殺的情況。12月6日，一位女證人在幕後作證，出於安全考慮，她的聲音經過處理。後來因技術原因，法庭下令暫時休庭。這時，薩達姆大喊“我再不到這個沒有公正的法庭來啦，你們都給我見鬼去吧”。12月7日，由於薩達姆拒絕出庭接受審判，審訊曾經中斷幾個小時。後來，法庭在薩達姆缺席的情況之下繼續進行審判。 12月21日，薩達姆在審判他的巴格達法庭上指稱，美國人毆打和折磨他。美國白宮發言人嚴詞否認薩達姆的這一說法。負責審訊的雷德法官表示，薩達姆聲稱曾被虐待的指稱沒有證據。三審
2006年1月15日，伊拉克高等法庭發表聲明，證實主審法官阿明由於“個人原因”提出辭呈。1月23日，審訊薩達姆的特別法庭發言人表示，法庭決定任命拉烏夫·阿卜杜勒-拉赫曼為主審法官。1月29日，薩達姆案複審後不久，薩達姆辯護團、薩達姆本人以及其他幾名被告便離庭抗議特別法庭的程式問題。2月1日，伊拉克高等法庭對薩達姆的審判再次開始，但薩達姆本人及其聘請的辯護律師團沒有出席庭審。2月13日，薩達姆出庭再受審，高呼打倒布希口號。2月14日， 薩達姆在法庭上宣稱，為抗議主審法官以及其上司開展的“不公正審判”，自己同其他三名被告開始“絕食”。 2月27日，薩達姆的首席辯護律師杜拉米透露，由於健康原因，薩達姆已於一周前停止了堅持11天的絕食鬥爭。3月1日，薩達姆在法庭上承認，杜賈爾村事件後，他親自下令對村民進行報復。3月15日，薩達姆首次出庭直接作證，他稱對自己的審判是一場“鬧劇”。4月5日，薩達姆出庭受審時猛烈抨擊伊拉克內政部殺害了數千名伊拉克人，並要求由國際機構對檢察官出示的有關檔案上他的簽名進行鑑定。4月17日，薩達姆及7名同案被告再次出庭受審。法官宣讀了一份刑事專家的報告，稱當初與杜賈爾村村民被判死刑的有關檔案上的薩達姆簽名是真實的。 薩達姆的辯護律師說，這些鑑定專家是內政部成員，“由於他們和內政部的關係，他們無法做到獨立”。他要求法庭指定其他專家重新對簽名進行鑑定。5月31日，薩達姆的辯護律師庭審中指控控方證人海德里作偽證，要求法庭對所有控方證人證詞的可靠性進行調查。
6月21日，薩達姆的主要辯護律師之一哈米斯·奧貝迪遭武裝分子綁架後被殺害。薩達姆和其他7名被告開始絕食，以抗議奧貝迪被槍殺。6月23日，駐伊美軍說，薩達姆已經結束絕食活動。7月11日，薩達姆和他的律師再次拒絕出席庭審，以此對奧貝迪遇害表示抗議。7月23日，薩達姆因絕食多日被送入醫院治療。7月26日，薩達姆出現在庭審現場，他稱自己是被強行帶到法庭的。他還表示，如果被判死刑，希望被槍決，而不是絞死。
最終判決
11月5日，伊拉克高等法庭宣布對杜賈爾村案的判決結果，薩達姆被判絞刑，罪名是謀殺和反人類罪。具體過程
杜賈爾村案1982年7月8日，伊拉克前總統薩達姆前往巴格達以北約90公里的杜賈爾村，拜會當地的部族長老。那裡是什葉派達瓦黨的大本營，他們當時經常在伊拉克境內製造襲擊事件，給薩達姆政權製造混亂，暗中策應當時正和伊拉克交戰的伊朗。 當薩達姆的車隊駛進杜賈爾村時，埋伏在棗椰林中的達瓦黨槍手向車隊開火。薩達姆的保鏢隨後進行還擊，激烈的槍戰持續了數小時之久。伊拉克軍隊最後出動了武裝直升機和步兵團將薩達姆救出戰場。死裡逃生的薩達姆當時曾表示，自己不會對這次暗殺行動進行報復。但是，按照這次起訴薩達姆的檢控方的說法，大規模的報復行動很快展開。伊拉克秘密警察包圍了整座村莊，將所有房屋夷為平地，並且殘忍地殺害了143名村民。其他1500名村民都被投進監獄，其中許多人受到拷打折磨，最後悲慘死去。
