人物經歷
2000年,於中國科學院大連化學物理研究所獲博士學位,並於同年8月進入美國新墨西哥大學做了一年博士後研究。
2001年至2003年,在威斯康星大學-麥迪遜分校(University of Wisconsin - Madison)做理論與計算生物物理/化學方面的研究工作。
2004年1月-2006年3月,在哈佛大學醫學院(Harvard University/Harvard Medical School)與實驗工作者合作從事膜蛋白結構預測方面的研究工作。
2006年3月,開始在國際著名的生物製藥公司(Biogen Idec Inc.)從事小分子藥物與蛋白質工程設計方面的研發工作。
2009年3月,回所工作。
主要研究
針對分子模擬的理論計算方法與程式進行發展和套用。主要研究工作發表在與物理、化學和生物相關的國外核心期刊上,相關的計算程式被收錄到著名的分子模擬軟體包CHARMM中,並被世界各地的科學家廣泛使用。
在理論計算方法方面,發展了一套新的理論和程式,使得對於任意生物分子體系,使用很少的計算資源就可以對它進行振動柔性分析,研究生物分子體系的構象變化。同時對於生物酶催化反應機理的研究方面也提出了新理論,使得利用量子力學與分子力學混合方法能夠更準確地計算反應自由能。
在基礎套用方面,利用本人發展的理論計算方法對生物中重要的超大分子體系,Ribosome, F1-ATPase, Calcium pump 等進行了柔性分析和構象變化的研究。與實驗工作者合作,結合試驗數據,利用蛋白質結構預測的方法對重要的細胞間粘附分子Integrin的跨膜區進行了結構預測,使得對這一重要的分子體系進行細緻而又完整的研究成為現實;針對與膽固醇代謝相關的氧化酶,利用新發展的理論計算方法詳細分析了催化反應的機理,為下一步酶的工程改造提供了指導建議。
在工業化套用方面,使用計算化學、計算生物學和計算機輔助分子設計的工具和方法,針對兩個重要的疾病靶標進行的藥物篩選和改造,發現和設計了有效的藥物先導化合物。在蛋白質工程方面,結合計算生物學和生物信息學的方法,改善了抗體的物理化學特性,為下一步進入臨床前奠定了基礎。
研究方向
1. 分子模擬的理論計算方法及其電腦程式的發展與實現
2. 與基礎生物、生物能源和製藥以及生物技術相關的生物分子體系的模擬與改造
3. 藥物分子,包括有機分子(傳統藥物)和小肽(疫苗)的篩選、改造和設計
4. 與催化相關的液相中分子體系的模擬以及催化劑的最佳化設計