木瀆第二高級中學創建於1958年8月,時名金山農業中學,一九七二年尚名金山中學,九一年更名為木瀆第三中學。二00六年七月定名為木瀆第二高級中學,是蘇州市重點高級中學。
學校堅持貫徹理性化辦學思想,經美術為特色教育,以爭創省一流學校為辦學目標,以全面提高學生綜合素質為培養目標,嚴格要求,科學管理。50年的風雨歷程,學校逐漸形成了愛國、求實、團結、創新的校風,嚴謹、善導、愛生、奉獻的教風,尊師、守紀、勤學、善思的學風。
木瀆第二高級中學長期堅持和發揚艱苦創業、從嚴治校的優良傳統,全面紮實推進素質教育,本科上線率在同類學校中遙遙領先,多名學生考入國美、華師大、南師、南藝等國內名牌大學。
今天的木瀆第二高級中學已是一所師資優良、管理完善、環境優美的普通高級中學,學校於2009年成功創建為江蘇省三星級高中 。