主要研究方向
1）環境微生物多樣性；
2）微生物與碳氮生物地球化學循環；
3）土壤微生物元基因組學與元蛋白質組學。
科研項目
1) 國家自然科學基金面上項目：紅壤中氮素代謝微生物多樣性與相關土壤酶來源的生物信息學解析，主持
2) 國家自然科學基金面上項目：水熱條件和土壤類型對硝化微生物群落演變的影響，第一參加人
3) 土壤與農業可持續發展國家重點實驗室基金項目：土壤氮素代謝微生物多樣性與相關土壤酶來源的生物解析，主持
4) 國家科技支撐計畫：城郊區環保型特色農業支撐技術研究與示範
5) 國家科技支撐計畫：紅壤退化的阻控和定向修復與高效優質生態農業，子課題主持
6) 國家水體污染控制與治理科技重大專項：低濃度面源污水微生物脫氮除磷的影響因素與參數最佳化，子課題主持
7) 公益性行業（農業）科研專項經費項目：鉀肥高效利用與替代技術研究，子課題主持，
發表論文
滕齊輝， 曹慧*，崔中利，王英，孫波，郝紅濤，李順鵬. 太湖地區典型菜地土壤微生物16S rDNA的PCR-RFLP分析. 生物多樣性
黃婷婷，崔中利，張璐， 曹慧*，李順鵬. 江西典型紅壤區土壤細菌基因組文庫構建與功能初步分析. 土壤學報
陳磊，汪峰，張祥志，高國慶，劉標，陳良燕，崔中利， 曹慧*. 轉基因抗蟲棉對莖部內生細菌多樣性的影響. 土壤
汪峰，曲浩麗，丁玉芳，孫波，崔中利， 曹慧*. 三種農田土壤中氨氧化細菌 amoA基因多樣性比較分析. 土壤學報
劉文乾， 曹慧，樊建波，何園球. 紅壤花生根際溶磷真菌的分離、鑑定及溶磷能力的研究. 土壤學報，
劉文乾，何園球，張坤，樊建波， 曹慧*. 一株紅壤溶磷菌的分離、鑑定及溶磷特性. 微生物學報
李婧，陳廣波，張坤，崔中利， 曹慧*. 花生連作土壤芽孢桿菌的群落多樣性及其生防效果研究. 土壤
浦傳亮，梁晉剛，高金玉，吳存祥，張明榮，張正光，崔中利， 曹慧*. 轉胱硫醚-γ-合成酶基因高蛋氨酸大豆對土壤細菌群落結構的影響. 南京農業大學學報
劉文乾，吳雲，崔中利，何園球，林先貴， 曹慧*. 元蛋白質組學學在土壤微生物生態功能研究中的套用. 土壤學報
王萍，崔中利，劉標，孫波， 曹慧*. 培養方法對土壤可培養細菌多樣性的影響. 土壤學報
曹慧，崔中利，李順鵬. 中國土壤生物學研究的回顧與展望. 土壤學報
王英，滕齊輝，崔中利，孫波， 曹慧*，胡鋒. 免耕水稻土壤中細菌多樣性及其空間分布的研究. 土壤學報
