機構設定
（一）辦公室
起草和審核有關檔案和報告；負責會議組織、秘書事務、信息綜合、文電處理、文書檔案管理和機要保密工作；負責局機關的基本建設工作；制定機關內部規章制度；協調全縣各醫療衛生單位的經費調撥、審核、監督使用；負責本局信訪工作；指導本縣醫療衛生方面的對外交流與合作；負責新聞宣傳工作；承擔全縣藥品集中招標採購工作，組織實施國家基本藥物採購、配送、使用的政策措施； 擬定全縣衛生事業發展規劃，指導全縣區域衛生規劃工作，統籌規劃與協調全縣衛生資源配置；協調有關部門監管所屬事業單位的非經營性國有資產；負責全縣大型醫用設備配置規劃的制定和配置管理；負責衛生統計工作。
（二）人事崗
負責局機關及所屬事業單位的機構編制、人事管理、黨群和老幹部服務工作；負責本系統的教育培訓工作。
（三）醫政崗
指導全縣醫療機構改革。擬定醫療機構設定規劃、醫療機構醫療技術套用、醫療質量和服務、采供血機構管理等有關政策、規範、標準，並組織指導實施；制定醫務人員執業標準和服務規範；指導醫院藥事、臨床重點專科建設、醫院感染控制、醫療急救體系建設、臨床實驗室管理等有關工作；承擔醫療機構醫療服務的監管工作，組織開展醫療機構醫療質量評價和監督工作。協助縣政府和有關部門對重大人員傷亡事件組織緊急救；組織實施醫學科技成果的推廣套用和衛生科學知識普及工作；組織開展衛生專業技術崗位的培訓、鄉村醫生培訓工作；負責畢業後醫學教育、繼續醫學教育的組織管理工作；指導和管理各類中醫醫療保健機構；負責中醫宣傳教育、技術交流工作；指導全縣農村衛生服務體系建設和鄉村醫生相關管理工作；監督指導農村衛生政策的落實；依法受理並限時辦結行政審批事項；配合縣行政服務中心或其他相關部門完成有關聯審、聯辦事項；受理有關許可政策法規、辦件諮詢；完成縣衛生局和縣行政服務中心交辦的其它工作。
（四）疾控崗
擬定傳染病、地方病、慢性非傳染性疾病及與公共衛生相關疾病的防治規劃和措施，組織對傳染病、地方病、慢性非傳染病的監測、報告和綜合防治；參與對重大突發疫情、病情實施緊急處置；制定衛生應急預案和措施，負責突發公共衛生事件監測預警和風險評估，指導實施突發公共衛生事件預防控制與應急處置；承擔食品安全綜合協調、組織查處食品安全重大事故的工作，負責食品及相關產品的安全風險評估、預警工作；承擔縣愛滋病性病防治工作聯席會議具體工作。
（五）婦社崗
擬定全縣社區衛生、婦幼衛生、健康教育的發展規劃和服務標準並指導實施；擬定婦幼衛生政策措施和母嬰保健服務技術標準並監督實施；指導全縣婦女保健、兒童保健業務，監督母嬰保健專項技術的實施。
機構職能
（一）貫徹執行黨和國家有關衛生工作的方針政策、法律法規規章；推進醫藥衛生體制改革；依法擬定並組織實施全縣衛生工作的政策法規規章和發展規劃、計畫。
（二）實施國家基本藥物採購、配送、使用的政策措施，提出國家基本藥物價格政策的建議。 （三）承擔食品安全綜合協調、組織查處食品安全重大事故的工作，組織實施食品安全標準，負責食品及相關產品的安全風險評估、預警工作。 （四）擬定本縣區域衛生規劃；統籌規劃與協調全縣衛生資源配置，制定社區衛生服務發展規劃和服務標準，指導衛生規劃的實施。
（五）擬定本縣農村衛生、婦幼衛生工作規劃和政策措施，指導初級衛生保健規劃和婦幼保健專項技術的實施。組織制定並實施全縣農村衛生髮展規劃和政策措施，負責新型農村合作醫療的綜合管理。
（六）貫徹預防為主方針，開展全民健康教育。擬定並組織實施嚴重危害人群健康疾病防治的實施辦法；組織對重大疾病的綜合防治；組織、指導全縣傳染病的防治工作。
（七）負責衛生應急工作，制定衛生應急預案和措施，負責突發公共衛生事件監測預警和風險評估，指導實施突發公共衛生事件預防控制與應急處置。
（八）貫徹中西醫並重的方針，制訂、實施全縣中醫藥事業發展規劃；管理和指導全縣中醫和中西醫結合工作。
（九）指導規範衛生行政執法工作，監督管理全縣傳染病防治及職業、環境、放射和學校衛生工作，負責公共場所和飲用水的衛生安全監督管理。
（十）負責醫療機構（含企業醫療機構）醫療服務的全行業監督管理，組織實施國家和省關於醫療機構醫療質量標準、服務規範、職業道德規範和采供血機構的管理標準，建立醫療機構醫療服務評價和監督體系。
（十一）擬定本縣重點醫學科技教育發展規劃,組織開展繼續醫學教育工作。
（十二）擬定本縣衛生人才發展規劃，對衛生人員職業道德規範的執行情況實施監督，參與全縣衛生系統專業技術資格考試和職稱評聘工作；負責全縣衛生系統工作人員的教育培訓；指導全縣衛生隊伍建設；指導本縣醫療衛生方面的交流活動。
（十三） 負責本縣重要會議和重大活動的醫療衛生保障工作。
（十四）承擔縣愛滋病性病防治工作聯席會議具體工作。
（十五）負責對所屬事業單位貫徹執行黨和國家的方針政策、法律法規規章的檢查監督，協同有關部門監管其非經營性國有資產。
（十六）承辦縣政府和上級部門交辦的工作。
人員編制
昌江黎族自治縣衛生局行政編制10名。其中：局長1名（兼任黨委書記），副局長3名，黨委專職副書記1名。
機關工勤人員財政預算撥款事業編制1名。
