昆明市疾病預防控制中心於2002年3月成立,由原昆明市衛生防疫站、昆明市皮膚病防治院、昆明市結核病防治所合併組建而成,是集疾病預防控制、衛生檢驗、監測與評價、健康教育、信息管理和業務培訓與指導為一體的疾病預防控制機構。中心現有人員編制323名,內設34個業務科室和行政職能科室;業務用房8215平方米,有各種監測、檢驗及診療設備720餘台(件)、總價值600萬元,能夠開展微生物、理化和臨床檢驗等200餘項。
昆明市疾病預防控制中心貫徹“預防為主”的衛生工作方針,為適應社會經濟發展要求、醫學模式轉變和人民民眾不斷增長的預防保健需求,將不斷提高業務技術水平和疾病預防控制綜合能力,為全市人民的身體健康服務,為社會主義現代化建設服務。