辦學條件
日本的高等教育機構根據設立主體的不同，可以分為國立、公立、私立三種。國公立大學中，國立大學總數為86所、公立大學91所，基本上都是一流大學。國公立大學與私立大學不能設定碩士學位點和博士學位點不同，國公立大學都設有碩士和博士學位點 。國公立大學由日本政府設立，學費較私立更低廉（50%），同時國公立大學有數量少、招生嚴格等特點，考取難度較私立大學難度更大、世界學術排名和知名度更高。
在2016交大日本大學排行榜中前10位中均為國立和公立大學。
2012年TIMES世界排中，TOP200中有將近10所日本大學入選。日本國公立大學都設有大學院（研究生院），開設碩士、博士課程。就讀日本國立大學大學院的學生持有留學簽證，申請獎學金、享受醫療保險、就業、交通費折扣等方面較私立大學擁有更多的報銷政策和優惠補貼。
在專業方面，日本國公立大學的設定也比較齊全。其中，既有東京大學、京都大學、東北大學、大阪大學等知名度高的綜合性大學，也有東京工業大學、京都工藝纖維大學、北九州市立大學等側重某些專業的大學，更有大阪教育大學、政策研究大學院大學、奈良先端科學技術大學院大學等綜合排名不高，但在某些具體領域代表了教育最高水平的學校。
機構設定
大學裡的“大學院”是實施研究生教育的機構，有碩士（學制2年）、博士（學制3年）學位授予權。有些學校碩士課程和博士課程分別設立，有些學校是合在一起設立，分博士課程前期2年，博士課程後期3年，前期課程2年也視為碩士課程。
“學部”是實施本科教育的機構，有學士學位授予權。本科一般4年，醫科6年（含牙醫、獸醫，畢業後可直接報考4年制博士研究生課程）。
短期大學和高等專門學校只能實施大學專科教育，學制2-3年，頒發專科畢業證書，不能授予學位。
在學部和大學院裡，除攻讀學位的正規學生外，還有“旁聽生”、“履修生”和“進修生”。這三類學生都不能獲得畢業證書或學位證書，只有“履修生”修讀的學分被承認。學部不招收“研究生”。
辦學優勢
•・國公立大學的教育水平與世界排名更高。
•・費用更低廉、學費每年53萬日元（約4萬人民幣）左右；部分學校還有有學費減免，可以再次減半。 ・獎學金種類更多，申請成功幾率更大。
•・可以合法打工；
•・畢業後就業前景好；
•・部分大學提供英文授課項目。
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86所國立大學
| 日文名稱 | 中文名稱 |
| 北海道大學 | 北海道大學 |
| 北海道教育大學 | 北海道教育大學 |
| 室蘭工業大學 | 室蘭工業大學 |
| 小樽商科大學 | 小樽商科大學 |
| 帯広畜產大學 | 帶廣畜產大學 |
| 旭川醫科大學 | 旭川醫科大學 |
| 北見工業大學 | 北見工業大學 |
| 弘前大學 | 弘前大學 |
| 岩手大學 | 岩手大學 |
| 東北大學 | 東北大學 |
| 宮城教育大學 | 宮城教育大學 |
| 秋田大學 | 秋田大學 |
| 山形大學 | 山形大學 |
| 福島大學 | 福島大學 |
| 茨城大學 | 茨城大學 |
| 筑波大學 | 筑波大學 |
| 筑波技術大學 | 筑波技術大學 |
| 宇都宮大學 | 宇都宮大學 |
| 群馬大學 | 群馬大學 |
| 埼玉大學 | 埼玉大學 |
| 千葉大學 | 千葉大學 |
| 東京大學 | 東京大學 |
| 東京醫科歯科大學 | 東京醫科齒科大學 |
| 東京外國語大學 | 東京外國語大學 |
| 東京學芸大學 | 東京學藝大學 |
| 東京農工大學 | 東京農工大學 |
| 東京芸術大學 | 東京藝術大學 |
| 東京工業大學 | 東京工業大學 |
| 東京海洋大學 | 東京海洋大學 |
| お茶の水女子大學 | 御茶水女子大學 |
| 電気通信大學 | 電氣通信大學 |
| 一橋大學 | 一橋大學 |
| 橫浜國立大學 | 橫濱國立大學 |
| 新潟大學 | 新潟大學 |
| 長岡技術科學大學 | 長岡技術科學大學 |
| 上越教育大學 | 上越教育大學 |
| 富山大學 | 富山大學 |
| 金沢大學 | 金澤大學 |
| 福井大學 | 福井大學 |
| 山梨大學 | 山梨大學 |
| 信州大學 | 信州大學 |
| 岐阜大學 | 岐阜大學 |
| 靜岡大學 | 靜岡大學 |
| 浜松醫科大學 | 浜松醫科大學 |
| 名古屋大學 | 名古屋大學 |
| 愛知教育大學 | 愛知教育大學 |
| 名古屋工業大學 | 名古屋工業大學 |
| 豊橋技術科學大學 | 豐橋技術科學大學 |
| 三重大學 | 三重大學 |
| 滋賀大學 | 滋賀大學 |
| 滋賀醫科大學 | 滋賀醫科大學 |
| 京都大學 | 京都大學 |
| 京都教育大學 | 京都教育大學 |
| 京都工芸繊維大學 | 京都工藝纖維大學 |
| 大阪大學 | 大阪大學 |
| 大阪教育大學 | 大阪教育大學 |
| 兵庫教育大學 | 兵庫教育大學 |
| 神戸大學 | 神戶大學 |
| 奈良教育大學 | 奈良教育大學 |
| 奈良女子大學 | 奈良女子大學 |
| 和歌山大學 | 和歌山大學 |
| 鳥取大學 | 鳥取大學 |
| 島根大學 | 島根大學 |
| 岡山大學 | 岡山大學 |
| 広島大學 | 廣島大學 |
| 山口大學 | 山口大學 |
| 徳島大學 | 德島大學 |
| 鳴門教育大學 | 鳴門教育大學 |
| 香川大學 | 香川大學 |
| 愛媛大學 | 愛媛大學 |
| 高知大學 | 高知大學 |
| 福岡教育大學 | 福岡教育大學 |
| 九州大學 | 九州大學 |
| 九州工業大學 | 九州工業大學 |
| 佐賀大學 | 佐賀大學 |
| 長崎大學 | 長崎大學 |
| 熊本大學 | 熊本大學 |
| 大分大學 | 大分大學 |
| 宮崎大學 | 宮崎大學 |
| 鹿児島大學 | 鹿兒島大學 |
| 鹿屋體育大學 | 鹿屋體育大學 |
| 琉球大學 | 琉球大學 |
| 政策研究大學院大學 | 政策研究大學院大學 |
| 総合研究大學院大學 | 綜合研究大學院大學 |
| 北陸先端科學技術大學院大學 | 北陸先端科學技術大學院大學 |
| 奈良先端科學技術大學院大學 | 奈良先端科學技術大學院大學 |
91所公立大學
北九州市立大學
宮城大學
札幌市立大學
首都大學東京
大阪市立大學
橫浜市立大學
名寄市立大學
下関市立大學
九州齒科大學
青森公立大學
札幌醫科大學
大阪府立大學
京都府立大學
神戸市外國語大學
宮崎公立大學
福岡縣立大學
福岡女子大學
長崎県立大學
熊本県立大學
釧路公立大學
岩手県立大學
秋田県立大學
國際教養大學
會津大學
埼玉県立大學
大分県立看護科學大學
宮崎県立看護大學
沖縄県立看護大學
沖縄県立芸術大學
新潟県立大學
富山県立大學
石川県立大學
公立函館未來大學
青森県立保健大學
秋田公立美術大學
山形県立保健醫療大學
山形県立米沢栄養大學
福島県立醫科大學
茨城県立醫療大學
群馬県立県民健康科學大學
群馬県立女子大學
高崎経済大學
前橋工科大學
千葉県立保健醫療大學
產業技術大學院大學
神奈川県立保健福祉大學
長岡造形大學
新潟県立看護大學
石川県立看護大學
金沢美術工芸大學
敦賀市立看護大學
名古屋市立大學
福井県立大學
山梨県立大學
靜岡県立大學
愛知県立大學
都留文科大學
長野県看護大學
岐阜県立看護大學
岐阜薬科大學
情報科學芸術大學院大學
靜岡文化芸術大學
愛知県立芸術大學
三重県立看護大學
滋賀県立大學
京都市立芸術大學
京都府立醫科大學
福知山公立大學
神戸市看護大學
兵庫県立大學
奈良県立大學
奈良県立醫科大學
和歌山県立醫科大學
香川県立保健醫療大學
愛媛県立醫療技術大學
高知工科大學
高知県立大學
名桜大學
名寄市立大學短期大學部
岩手県立大學宮古短期大學部
岩手県立大學盛岡短期大學部
山形県立米沢女子短期大學
會津大學短期大學部
川崎市立看護短期大學
大月短期大學
長野県短期大學
岐阜市立女子短期大學
靜岡県立大學短期大學部
三重短期大學
島根県立大學短期大學部
倉敷市立短期大學
新見公立短期大學
高知短期大學
大分県立芸術文化短期大學
鹿児島県立短期大學
公立鳥取環境大學
島根県立大學
岡山県立大學
新見公立大學
尾道市立大學
県立広島大學
広島市立大學
福山市立大學
山口県立大學
山口東京理科大學
