劇情簡介
《旗艦》劇照海軍東江基地驅逐艦艦長魯淮成率艦出海，臨走前把妻子高明艷和剛出 生不久的女兒託付給老戰友鄭冀一家照顧。鄭冀駕測量船出海，因指揮失誤導致工程師高明艷犧牲而剛剛出生的女兒也被偷走。為此，不久鄭冀轉業回鄉。十幾年後，鄭冀的兒子鄭遠海為了實現父親當年的願望，大學畢業入伍來到海軍東江基地。魯淮成沒有發覺鄭遠海就是鄭冀的兒子，對才華橫溢的他大加讚賞。為了改變鄭遠海狂傲的性格，出乎意料地安排他去豬場餵豬，鄭遠海大發其火。在魯淮成的安排下鄭遠海報考了艦艇學院研究生。鄭遠海也終因性格莽撞又一次付出代價，在八號海域差一點導致軍艦觸礁。走向成熟的鄭遠海從國外學成歸來，幾年後成長為一名護衛艦艦長。魯淮成退休了，在女兒梅杏兒的陪伴下來為即將率隊出訪的鄭遠海送行，在鄭遠海指揮的旗艦帶領下，特混編隊消失在海平線上，留下了一條永不消逝的航跡。
分集劇情
第1集戰機橫空划過，戰艦編隊航行。旗艦作戰室里的海軍東江基地少將參謀長魯淮成下達：向敵灘頭陣地實施火力突擊，為登入部隊開闢通道的命令。各艦萬炮齊鳴，灘頭陣地硝煙四起。水陸兩用坦克前導，衝鋒舟一字型排列，朝灘頭戰地衝去。衝鋒舟上的陸站隊大學生學員鄭遠海、謝庭群、於季東等在教官陳建軍的指揮下，在炸彈的爆破煙霧中，攻占海灘，朝叢林縱深搜尋。陸戰隊學員在叢林中與女兵偵察隊展開了近戰，鄭遠海在同陸戰隊女兵連一班長秦思婷的格鬥中，奪過她的匕首，戲弄地朝自己大腿刺去，沒料匕首是真的，由此受傷住院。在一系列遭遇戰中兩人不打不相識的成為了朋友。在殘酷的訓練中，“魔鬼”教官陳建軍不講情面的嚴格執教，使學員又怕他，又恨他，鄭遠海與他發生衝突，認為他是軍閥作風，沒有人道，陳建軍則讓他放下大學生的“臭架子”，在訓練中似乎跟他過不去，專給鄭遠海小灶伺候。鄭遠海倔強和頑強的個性給魯淮成深刻的印象，他囑咐秘書，回基地後調鄭遠海的檔案。大浪淘沙，在嚴格殘酷的訓練中，大學生學員於季東終於支撐不住了，他不顧老同學鄭遠海和謝庭群的勸阻，上交了離隊申請回到地方，和來接他的林雪合辦了公司，走上了經商的道路。
第2集鄭遠海的妹妹秀竹來到部隊訓練營地看望哥哥，洗衣服的謝庭群在小河邊看見了漂亮的秀竹，當他知道這是鄭遠海妹妹時，興奮地與秀竹聊了起來。三個月的新兵訓練結束了，鄭遠海豪放地宣稱自己的理想是當艦長，並認為絕不會比現任的艦長差，魯淮成喜歡這位有理想，有志氣，甚至有些狂妄的年輕大學生，他默默地看著抽屜里老戰友的照片：鄭冀啊，你的兒子來接班了！於是，他開始了對鄭遠海特殊的勵練。分配他到了基地養豬場工作。鄭遠海萬萬沒想到，自己報著當艦長的崇高理想，放棄了北大研究生來到海軍，不但沒能上艦，還成了飼養兵。一心想留在陸地機關里工作的謝庭群卻被分到了基地的旗艦180上任見習導水長。兩人都懷著不情願的心態來到了各自的崗位。養豬場的飼養兵姜喜子是個老兵，他憤怒地制止了朝豬發泄不滿的鄭遠海，兩個人從此開始了充滿矛盾衝突和相互影響的生活。謝庭群剛剛上艦，就趕上了出海值勤的任務，在波濤洶湧的大海上，他差點把苦膽吐出來。他所在的180艦接到基地指揮部的指示，命令前往公海，解救正被兩艘外國軍艦驅趕的台灣漁船，緊張的臨戰氣氛，加劇了謝庭群的恐慌，他在一旁觀察著導水長陳建軍沉著鎮定地做著戰鬥準備。這時，突然一艘不明國籍的潛艇突然從水裡冒出來，攔住了180艦航行的方向。
第3集180艦警告不明國際潛艇，這是中國海軍宣布的演習區域，請它離開，不明潛艇無視警告，繼續阻擋180的航向。在不開第一炮的原則下，為維護我海軍尊嚴，180艦朝不明潛艇衝去，較量中，不明潛艇終於在我艦逼近的威懾下下潛離去，在趕來增援的數艘艦艇的支援下，180艦解救了台灣漁船，外艦離去。基地司令陳敬國親自來到軍港，嘉獎180艦的勇敢行動，並向軍港告別，他將上調東方艦隊任副司令，臨行前他囑咐兒子陳建軍抓緊學習，迎接艦長的競爭。沮喪無奈的鄭遠海把一切不滿發泄在豬的身上，姜喜子嚴肅地譴責他這是損害軍事財產，搞得鄭遠海哭笑不得。心儀鄭遠海的秦思婷探親回到中南市，順便來到了鄭遠海家探望他的母親許欣芳，在那裡見到了也來探望的於季東。於季東對秦思婷情有獨鍾，他高興的請秦思婷吃飯。謝庭群來到豬場，向鄭遠海講述了自己第一次出海的感受，更激起鄭遠海上艦的欲望。晚上，姜喜子給鄭遠海講述了一個老兵堅守理想的故事，使他似乎悟道了魯淮成讓他到豬場是勵練自己意志的真正意圖，開始靜心地搞起了科學養豬。魯淮成看到了鄭遠海進步，開始了第二步對他的考察，讓他帶隊到深山裡維護軍事通訊線路的暢通，並不準帶錢和乾糧，考驗他野外生存的能力。
第4集鄭遠海的護線小組沿著軍用線路在深山中行進，幾天下來，負責一伙食的姜喜子用聰明才智使大家吃著野菜野果，喝著是山泉小溪，包括烤熟的大螞蟻。雖苦但沒餓著。姜喜子在山裡發現了一頭山羊，戰士們高興壞了，但鄭遠海嚴令不準把它弄死，要等老百姓上山來找。可把大家饞死了，他們只能拉著這頭羊繼續巡邏。終於在一個懸崖邊，山羊失足掉到了山澗摔死了，鄭遠海只得下令把山羊烤著吃了。大家欣喜若狂的剛吃完烤羊，一個小姑娘站在了鄭遠海身邊，她堅持說這羊是她家的，要索賠。這下難壞了鄭遠海，他好言相說沒錢，等護線任務結束了一定加倍償還，但小姑娘說什麼也不行，最後她哭著而去。一天清晨，鄭遠海在叢林巡邏中，看見一個小伙子在欺負那個小姑娘，他趕上去一頓爆打，小姑娘趕緊拉住，說是自己的男朋友，鄭遠海驚訝地停住手，小伙子連滾帶爬地逃下山。鄭遠海後來才弄清，這個小姑娘叫梅杏兒，在縣成上高中，放假回來幫她爹放羊，順便複習功課，準備明年的高考，那個小伙子叫柱子，她爹為了供她上學，找柱子家借了錢，並承諾把梅杏兒將來嫁給柱子。鄭遠海驚訝地看著梅杏兒，告訴她這事要自己做主。並勸她報考軍校，這樣很多費用可以國家負擔。梅杏兒感激地看著這個解放軍大哥。基地為了考核陳建軍，專門安排他以艦長身份指揮一次實彈演習，謝庭群為了巴結陳建軍，從基地作戰處的一個老鄉處打聽到了標靶的位置，悄悄地告訴了他，結果陳建軍準確無誤擊中目標。但最後陳建軍誠實地告訴了魯淮成，自己這次打靶算作弊，請求處分。魯淮成其實心中有數，就看陳建軍能不能自己承認錯誤，現在他不但沒有給他處分，而且同意送他到艦艇學院參加艦副長班的學習。遠海很好地完成野外護線任務，當魯淮成來接他們的時候，看見了送行的梅杏兒，他仿佛看見了自己丟失了十多年的女兒。
第5集魯淮成給陳建軍下達命令，在上學之前，完成對海風飛彈的自動化指揮控制系統。陳建軍覺得自己解決這個問題難度太大，他想到了大學生鄭遠海，於是，鄭遠海興奮地來到了自己朝思慕想的艦艇上。狹窄的謝庭群對陳建軍請來鄭遠海，只讓自己負責鄭遠海生活，而心懷醋意。幾天下來鄭遠海出色的完成了控制系統的數據計算，陳建軍對他大加讚賞，並答應他跟艦實施海風飛彈的實彈射擊。在鄭遠海準確的數據提供下，海風飛彈試射成功。生意做得不錯的於季東來到東江，說是來談契約，順便看看老同學，實際上是想見見秦思婷，三個同學自分手後再次聚到了一起，喜歡秦思婷的於季東勸她復員和自己一起辦公司，鄭遠海則勸她不要離開部隊，希望她報考軍校。魯淮成暗暗地喜歡著鄭遠海，他沒有讓鄭遠海看出自己已經知道他是去世老戰友的兒子。他開始了對鄭遠海培養的第三階段，命令他讀書幾個月，報考艦艇學院的研究生，考不上永遠不許上艦。鄭遠海無奈地離開自己剛剛登上的艦艇，回到了陸地宿舍，開始了枯燥，單調的複習生活。苦盡甘來，鄭遠海終於以優異的成績考取了艦艇學院的研究生。心儀鄭遠海的秦思婷也追隨著他，報考了軍醫大學，他們又相聚到了一個城市。梅杏兒受到當年鄭遠海的鼓勵，也報考了軍醫大學，父親梅得貴得意地和柱子把她送到了省城，正好和秦思婷分到一個班，秦思婷是她的班長。
第6集艦艇學院讀研究生的鄭遠海，在一次海上測量課時，為了使水上測量數據更為準確，擅自將測量艇開出教學規定的範圍以外，結果與一條漁船相撞，致使漁船撞翻，漁民落水手臂骨折。學院對鄭遠海提出停課檢查，聽候處理的決定，鄭遠海悔恨自己的冒失，他來到醫院探望受傷漁民，但被趕出了病房，他無奈地在一個餐廳獨自喝酒，尋來的秦思婷發現了他。嚴厲制止了鄭遠海借酒消愁的行為。於季東聞訊，帶著錢趕到省城醫院，但受傷漁民不要錢，他要求艦艇學院免考招收自己兒子入學，不然就要求學院將鄭遠海除名。艦艇學院對受傷漁民的前一個要求無法接受，只能考慮把鄭遠海出名了，陳建軍緊急報告基地，魯淮成趕到艦艇學院，拜見了自己的老同學，艦院院長，強調鄭遠海是個不可多得的人才，希望學院能網開一面，並親自到醫院慰問受傷漁民，最終受傷漁民同意收回條件，事情圓滿平息。鄭遠海得以繼續自己的學業。一天，艦艇學院研究班和軍醫大學女學員一起完成一次海上救護的演練。鄭遠海和梅杏兒被分配到一艘救生艇上，兩人相見分外驚訝和興奮，以至怠慢了演練的任務，當秦思婷在另外一條救生船上招呼他們，兩人才醒過神來，這時別的學員已經將海上置放的假傷員都收到自己的艇上，只剩一具假傷員遠遠漂在海上，鄭遠海和梅杏兒決定不管多遠也要把“傷員”救上來。他們朝遠處划去。岸邊，教官對鄭遠海不放棄一個戰友，傷員的行為表示讚賞，大家休息等待。海上，那具“傷員”越漂越遠，橡皮艇上的鄭遠海和梅杏兒奮力朝“傷員”划去。岸邊，秦思婷有些不安地看著海上遠遠的小點。
第7集鄭遠海和梅杏兒終於將“傷員”抬上橡皮艇，這時，他們離海岸已經很遠了，梅杏兒有些恐懼地看著黑雲壓城的大海告訴鄭遠海，聽說有鯊魚在這一帶出現，鄭遠海告訴她，救生衣下面有防鯊裝置，可以躲避鯊魚的侵襲。岸邊，人們已經看不見海面上的橡皮艇了。秦思婷聽說今天傍晚有暴風雨，更是擔心起來。在鄭遠海和梅杏兒準備往回劃的時候，鯊魚出現了，它朝他們沖了過來。晚上，海上幾艘艦艇開著探照燈在尋找。鄭遠海和梅杏兒的失蹤，驚動了艦艇學院和軍醫大學的領導，雙方領導開始布置了緊急尋找方案。清晨，一個荒島的沙灘上，梅杏兒醒來，她看著這陌生的環境，哭了起來，鄭遠海則安慰著她，他拿出醫藥箱裡面的放大鏡，利用陽光點燃了篝火，利用針頭和鞋帶在礁石旁釣起了魚。篝火旁，兩人吃著烤魚，暢談著天上的星星，彼此都產生了喜愛。就這樣，鄭遠海開始用自己曾經野外生存過的經驗實踐了小島生存，經過經過了三天三夜，他們終於被海航的直升飛機發現。心情焦急，不吃不喝的秦思婷看見他們平安的返回時，激動地撲向鄭遠海，把他緊緊抱住，她這時才感到自己深深地愛著鄭遠海。懷才不遇的謝庭群聽說陳建軍的父親是他的老鄉，提著兩瓶藥酒，以老鄉的身份來到了陳敬國家，使得陳敬國對他頗有好感。鄭遠海兩年研究生畢業回到基地，滿心歡喜地以為可以上艦了，但魯淮成將一堆書放在他面前，命令他一年內熟練地掌握法語，鄭遠海呆了。
第8集鄭秀竹和鄭遠海的大學同學馬一凡在東江基地旁邊開了一個軍迷吧，把許欣芳也從中南市接了過來，終於一家三口團圓了。鄭秀竹把自己的男朋友潛艇學院畢業分到基地的南克江介紹給了哥哥鄭遠海，兩個年輕人發出誓言，水下水上齊頭並進，為中國海軍的強大貢獻青春。謝庭群經過鑽營，終於接替已經榮升副艦長的陳建軍當上了導水長，他來到軍迷吧，見到了心中一直喜愛的秀竹，從此這裡他成了長客。鄭遠海來到180艦上，纏著陳建軍，叫他想辦法把自己要到艦上來工作，陳建軍也希望鄭遠海來幫助全艦提高文化素質，為自己將來競爭旗艦艦長打好基礎，於是從來不求父親幫忙的陳建軍回到家，懇請陳敬國向魯淮成打招呼，終於把鄭遠海要到了180艦，擔任了航海長。欣喜若狂的鄭遠海全沒想到，迎接他的是翻江倒海的嘔吐。他清楚的意識到，要想實現自己當艦長的理想，就必須闖過這一關，倔強的鄭遠海利用各種手段和辦法，終於克服了暈船現象。在鄭遠海的鼓動下，陳建軍把姜喜子也要到了180艦上，利用業餘時間研究聲納的姜喜子終於有了用武之地。柱子來到省城，以梅得貴借錢不還為由，要求梅杏跟他回去結婚，梅杏兒不肯，於是柱子在軍醫大學的門口拿著喇叭打鬧，驚動了學校領導。梅杏兒面臨著學校的除名。
第9集秦思婷叫來了對她有求必應的於季東，幫梅杏兒還了她父親借柱子家的錢，同時求副市長的父親給學校打招呼，事情終於平息了，梅杏兒深深地感謝秦思婷，兩人成了好姐妹。186新型驅逐艦就要列裝，魯淮成要求所有候選人撰寫一篇關於海上高科技戰爭的論文，這可把不文化水平不高的陳建軍難壞了，在與鄭遠海溝通後，兩人達成默契，陳建軍出論點，鄭遠海出論據並執筆一起來寫這篇論文。論文很快地寫出來了，送論文到基地的謝庭群看見論文上有鄭遠海執筆的字樣，覺得很不妥，為了幫陳建軍競爭驅艦長，他擅自將鄭遠海的名字刪掉，並勸鄭遠海向陳建軍道歉。魯淮成看了論文很讚賞，作為樣板將論文下發全基地學習。正直的陳建軍發現後，嚴厲的斥責謝庭群，並主動向魯淮成承認，論文是和鄭遠海兩人合作，是自己一時糊塗刪去了他的名字，陳建軍的坦誠得到了魯淮成的諒解。結果，在陳建軍和鄭遠海相互道歉過程中產生了誤會，成了兩人的過節。我領海線內，再次出現不明國籍的潛艇，180艦奉命前往追趕俘獲。為了提前趕到不明潛艇前面進行攔截，最快的辦法就是穿過八號“死亡”海域，鄭遠海拿出父親留下的老海圖和當年有關的海況資料，力主穿越，陳建軍則認為這樣太危險，反對穿越。最終基地同意了鄭遠海的方案，180艦開始了對八號海域的冒險穿越。終因對海況缺乏現實的了解，180號觸礁，艦艇受損，艦隊派來調查組，了解事故情況，180艦主要幹部面臨著艦隊的處罰。征服八號“死亡”海域，成了魯淮成的一塊永遠的心病。
第10集魯淮成為此向艦隊寫了自己承擔一切責任的報告，後經艦隊調查組核查，認為180艦的受傷情況夠不上重大責任事故，由基地自行處理。但這更加強了鄭遠海征服八號“死亡”海域，完成父親未完成的事業的決心。一艘漁船觸礁，180艦接到基地命令，前往救援。由於礁石很多，艦艇無法靠近站在礁石上等待救援的船員，只能小艇靠近，鄭遠海不顧陳建軍的命令，毅然跳上小艇，朝落海船員開去。由於小艇超員，陳建軍隻身留下，命令鄭遠海帶小艇回艦，鄭遠海又一次違反命令跳到了陳建軍身邊，兩人站在即將在漲潮中淹沒的礁石上，相互吐露真心，彼此消除了誤會。186新型驅逐艦終於停靠在東江基地的碼頭，鄭遠海接到魯淮成讓他下艦的命令，他滿以為是調到新驅上去，可沒料到魯淮成這次是讓他徹底下艦攻讀法語。鄭遠海又開始了頑強的攻讀，一個月後，在總參組織的陸海空考官面前，鄭遠海用流利的法語通過了考試，即將成為遠赴法國三軍防務大學留學的博士生。臨行前，鄭遠海很想告訴魯淮成自己是他老戰友鄭冀的兒子，魯淮成制止了，告訴他，出去好好學習，將來當了艦長，再把心裡話說出來。鄭遠海默默地向乘車離去的魯淮成行禮。鄭遠海肩負著魯淮成的希望，帶著母親的囑託飛向法國。秦思婷和梅杏兒即將畢業，她們懷著各自對鄭遠海的愛戀，都把志願填寫到了海軍東江基地。
第11集謝庭群在艦艇上默默地擦著螺絲釘，被魯淮成無意間看見，並對這個幹部產生好感，在陳建軍的力薦下，謝庭群調到了基地機關，給魯淮成當了秘書，如願以嘗離開軍艦的謝庭群得意地來到了軍迷吧向秀竹報喜，卻遇見了南克江，開始了他對這個“情敵”的較量。秦思婷和梅杏兒也如願以嘗的分配到了東江基地醫院，梅杏兒穿上了海軍軍裝，興奮地睡不找覺，她思戀著鄭大哥能快點學成歸來。鄭遠海在法國勤奮地學習著，也不時受到某些外國同學的歧視，當一名英國中校學員大肆吹噓當年他們的皇家海軍前輩曾浪漫地到過東方時，鄭遠海義正詞嚴地譴責了所謂浪漫的東方之旅不過是一此野蠻的掠奪和強盜行經。使很多外國同學了解了歷史真相。謝庭群擅自把魯淮成的家具給換了，他的能說會道引起了魯淮成的反感，第二天他拿出自己的錢交給了營房處長。魯淮成來到基地醫院例行檢查身身體，無意間看見梅杏兒，他們認出了對方，魯淮成驚訝地看著當年的放羊女，如今成了海軍戰士，倍感欣慰。季東為了能跟秦思婷在，毅然把自己公司從中南搬到了東江。可謂用心良苦，但秦思婷心裡卻深藏著鄭遠海。
第12集謝庭群把南克江請到酒館，聲言自己也喜歡秀竹，可以跟他一起展開追求，最後秀竹如果願意跟誰，她是誰的，然後舉杯豪賭，南克江賭氣地跟他乾起杯來，結果大醉，在支隊緊急集合時，竟然沒有到位。謝庭群還假傳聖旨，支隊最後無奈地決定把南克江調離潛艇，到了遠離東江的菊花島的一個觀通站工作。秀竹哭著不讓南克江離去，但倔強的南克江不原諒自己因為醉酒，耽誤了緊急集合，他決心臥薪嘗膽，毫無怨言地去了菊花島。魯淮成突擊考察潛艇支隊，但由於謝庭群的通風報信，支隊幹部全部到位迎接，在招待所的飯桌上，謝庭群擅自點了八個菜，這一切使魯淮成大為惱火，他嚴厲批評謝庭群，警告他要注意自己的身份，他只是工作秘書，不是生活秘書。梅杏兒例行給魯淮成量血壓，魯淮成覺得梅杏兒有些象自己失散的女兒，梅杏兒告訴魯淮成如果想女兒了，就叫她來。魯淮成高興的答應了。186的艦長人選迫在眉睫，陳建軍是第一人選，呼聲最高。謝庭群囑咐他最近一定要謹慎小心，不要出紕漏。
第13集基地為了考核艦長人選，組織了海上攻潛訓練。陳建軍代行艦長職務，指揮這次演練。就在攻潛行動中，突然一艘不明國籍潛艇潛入了我方對外宣布訓練戒嚴的海域進行偵察，基地命令180艦前往追擊攔截，陳建軍以為是魯淮成考驗自己，不相信真有不明潛艇的進入，為了在艦長考核中不出問題，安全起見，沒有抄有礁石危險的近海追擊，貽誤了戰機，致使不明潛艇逃出我艦的包圍。父親陳敬國聞聽這次陳建軍的失誤，大怒，他嚴厲批評他沒有實戰觀念。魯淮成認為陳建軍的這次失誤是不可饒恕的，認為186艦長不能由他擔任，起碼現在不合適，在政委王宏業召集的基地黨組會上，魯淮成沒有舉手，但陳建軍的艦長人選還是以少數服從多數地通過了。陳建軍如願以嘗地當上了186旗艦艦長。在菊花島上，南克江為救一落水女青年，挺身而出，基地接到當地民眾寄來的表揚照片，但被謝庭群截住扣壓，並經過裁剪拿到了秀竹面前，誣衊南克江在菊花島偷情被人檢舉，秀竹驚訝和痛苦的與南克江斷絕了關係。186艦奉命出訪六國，魯淮成親自帶艦出訪，秦思婷和梅杏兒隨艦保健。186艦代表中國海軍出訪，所到國家，受到了外國軍方和海外華僑的熱情歡迎。
第14集出訪的最後一站，法國某軍港。旅居法國的華僑和留學生以及外國記者紛紛登上186艦參觀，他們激動萬分，在這隻流動的國土上，莊嚴面對五星紅旗。鄭遠海興奮地登上了祖國的軍艦，當面向魯淮成匯報了在法國留學的感想。秦思婷和梅杏兒終於見到了她們朝思慕想的鄭遠海，秦思婷有些矜持地接受了鄭遠海的歐洲式的擁抱，梅杏兒則拉著鄭遠海的手歡蹦亂跳。晚上鄭遠海充當翻譯，流利地翻譯著，周旋在中法高層官員之間，秦思婷和梅杏兒用愛慕和崇拜的眼神看著鄭遠海。謝庭群以母親有病的理由請假，沒有隨魯淮成出訪，他的真正目的是利用這段時間接觸秀竹，雖然與南克江已經斷了關係，但秀竹心底始終沒有忘掉南克江。出訪歸來，魯淮成聽說潛艇支隊參謀長劉鐵鋼準備轉業回家，他親自趕到火車站挽留，並得知南克江被調到菊花島是謝庭群使的壞，他收繳了了謝庭群的鑰匙，命令他繼續休假。基地的報社刊登了南克江在菊花島勇救弱水女青年的事跡，謝庭群把報紙收藏了起來。於季東算著日子盼回了秦思婷，但秦思婷對他十分冷淡，不知情的梅杏兒勸慰秦思婷，不應該對於大哥這么冷漠，秦思婷告訴她自己根本就不喜歡東。在魯淮成的積極干預下，劉鐵鋼取消轉業，被任命為潛艇支隊長，他在潛艇碼頭迎回了從菊花島匆匆趕回的南克江。軍迷吧里熱鬧非凡，南克江站在窗外，看見裡面謝庭群親熱地和秀竹站在一起，只得默默地離去。
第15集潛艇支隊碼頭086潛艇前，基地政委王宏業為魯淮成和劉鐵鋼送行，他們要隨086進行危險的深潛測試。魯淮成拒絕了梅杏兒隨艦護理的請求。在潛艇里，魯淮成鼓勵086全體官兵，他和劉鐵鋼支隊長也向組織上寫了遺書，與官兵們同生共死。身邊的謝艇群則緊張萬分。陳建軍率186艦隨行來到測試海域為086潛艇準備緊急救護。086潛艇開始下潛，280米，285米，隨著口令聲，潛艇朝海底潛去。艙里，魯淮成，劉鐵鋼平靜地神情感染著年輕的水兵。官復航海長原職的南克江穩穩站立，他盯著滿頭大汗的謝庭群。潛艇深潛到了水下300米時，潛艇內發出海水壓迫潛艇的聲音，一個年輕的水兵緊張起來，他朝鐵梯爬去，幾個老兵把他按住，使他平靜下來。魯淮成看了一眼身邊的謝庭群，提出要和他下棋，潛艇在500米深處開始自由懸停，在寧靜的潛艇里，只能聽見子落棋盤的聲響。魯淮成用他的沉著冷靜的舉動感染和鼓舞著所有官兵，成功地完成了這次深潛測試。魯淮成根據謝庭群的表現，決定讓他下基層鍛鍊，這可急壞了謝庭群，他哀求陳建軍，希望陳敬國出面來幫忙他留在機關，最終，他被調到了艦隊，成為了陳敬國的秘書。鄭遠海以優異的成績提前從法國三軍防務大學畢業回國，魯淮成為了他同陳建軍相互取長補短，任命鄭遠海為186艦副艦長，成為陳建軍的副手。
第16集於季東熱情接待剛回國的鄭遠海，並希望鄭遠海出面為他跟秦思婷說媒，當鄭遠海結結巴巴地把意思告訴秦思婷時，秦思婷狠狠地譏諷他說，留學留成了一個媒婆。弄得鄭遠海不知所措。梅杏兒省吃檢用將當年於季東還給柱子的錢，還給了於季東。並覺得於季東是個很好的大哥，她力勸秦思婷接受於季東的求婚，秦思婷煩躁地叫梅杏少管，使梅杏兒很不理解。鄭遠海得知妹妹和南克江的情況，勸秀竹要主動找南克江溝通，不能一個人憋著。被南克江救起的女青年即將出國，專程來到潛艇基地向南克江表示感謝和道別，恰巧秀竹聽從哥哥的意見來到潛艇支隊，看見南克江和照片上的那個女青年在一起，悲痛離去，誤會深了。186艦海上值勤，鄭遠海值班，他發現前方有一漂浮物體，以為是斷了錨的浮標，準備靠近打撈，陳建軍憑著經驗趕緊制止，一枚水雷擦著艦旋而過，驚得艦上官兵一陣緊張，在安全地帶，186向水雷炮擊，想將其引爆，但水雷沒有反映，鄭遠海架著小艇接近水雷，才發現是一枚外國教練水雷，虛驚一場，但鄭遠海很佩服陳建軍豐富的經驗。
第17集梅得貴來基地探親，他希望梅杏兒趕快找個有錢的人結婚，心儀鄭遠海的梅杏兒說自己要找也要找個軍人，梅得貴說那就找個大官。於季東把秦思婷帶到自己新買的別墅，希望她能接受自己的求愛，成為這幢別墅的女主人，秦思婷坦誠地告訴於季東自己不愛他，於季東問秦思婷是不是有心上人了，秦思婷矢口否認。但於季東起了疑心，他把鄭遠海拉到軍迷吧，在關公像前，把酒相拜，結成兄弟，然後攤牌，他告訴鄭遠海兄弟之妻不可欺，鄭遠海哭笑不得地告訴他，自己沒有愛秦思婷。於季東放心的來到秦思婷醫院，告訴她鄭遠海不愛她，自己有耐心能待秦思婷轉變想法。秦思婷一氣之下來到鄭遠海身邊厲聲譴責他，為了兄弟情誼，把她讓來讓去的，完全不考慮她的感受。鄭遠海很無奈地一人逃到海邊。梅杏兒送父親梅得貴回鄉，在車站看見了於季東接一個客商，這位客商一眼看中梅杏兒，提出要梅杏兒陪他喝酒，否則不簽契約，於季東堅決不同意，結果助理林雪還是把梅杏兒帶到了酒桌前，客商高興地在契約上籤了字，於季東拿起契約，拉起梅杏兒離去，使客商什麼也沒撈著。魯淮成被任命東江基地司令職務，他組織基地各艦海上實彈打靶演習，陳建軍憑著經驗在靶船還沒出現的時候，就鎖定了射擊方位，鄭遠海覺得這樣做不是按實戰要求，陳建軍不以為然，兩人產生分歧，他告訴鄭遠海還嫩，要想跟自己對話還需要十幾年的實踐經驗。結果陳建軍果然首發命中靶船。
第18集陳建軍的186艦在實戰演習中名列第一，受到了基地的嘉獎，他得意忘形在艦上大擺宴席，喝酒慶賀，鄭遠海和政委採取了相應措施，使喝酒官兵減少到最小限度。夜深人靜的軍港突然響起了戰鬥警報，魯淮成發獎狀是放煙霧彈，突然發出戰鬥警報才是真正的用意。結果陳建軍大醉昏睡，鄭遠海果斷地擔負起指揮任務，基地發來指示，對海上標靶實施飛彈攻擊，目標自行搜尋。雷達顯示，夜海上除了有兩艘漁船在航行外沒有發現靶船出現，鄭遠海警惕地意識到，打靶戒嚴區不可能有漁船出現，一定那就是標靶，當鄭遠海緊急準備鎖定兩艘漁船實施飛彈攻擊時，傳來基地停止攻擊的命令。各艦均未對活動的標靶實施攻擊，魯淮成嚴厲批評了各艦艦長，沒有實戰意識，只會打死靶，不能認清活靶，宣布所有艦艇均為烈士，特別是陳建軍的慶功喝酒，被魯淮成命令深刻檢討，聽候處理。陳建軍誤以為是鄭遠海的匯報，才使魯淮成啟動的深夜行動，由此兩人矛盾加深。鄭遠海陷入痛苦，當梅杏兒來電話希望一起看電影也被他拒絕，魯淮成看出問題，他告戒鄭遠海派他到186艦與陳建軍合作，主要是讓他豐富經驗，不能搞不團結。季東因為被秦思婷拒絕，一氣之下開車狂奔，造成車禍，住進了醫院，梅杏兒代替值班的秦思婷前去探望，深感於季東對秦思婷的深愛之情，當她再次勸慰秦思婷答應於季東時，秦思婷終於說出他心裡是鄭遠海，梅杏兒呆住了。
第19集梅杏兒萬萬沒想到自己心底相愛的人，也是秦思婷所愛的人，善良的她選擇了回鄉探親，忍痛把時空留給親如姐妹的秦思婷，她覺得自己欠她很多很多。政委王宏業北京開會回來，帶來了更新的大型驅逐艦188旗艦年底就要列裝的喜訊，魯淮成決定要提速培養年輕幹部，他搞了個“希望工程”，對鄭遠海，南克江這樣年輕有為的幹部進行強化培訓，使他們能迎接掌握更為高科技化的未來艦艇的到來。鄭遠海的母親許欣芳胃炎住院，秦思婷為了不影響鄭遠海訓練，她白天黑夜地扶持在許欣芳身邊，使得許欣芳喜愛萬分。當著探親回來的梅杏兒大談秦思婷的好，覺得與鄭遠海也般配，搞得梅杏兒很尷尬，她藉故逃出病房。為了檢查集訓效果，鄭遠海所在艦艇為Y方，與南克江所在的潛艇為S方進行對抗，他們分別的取代艦艇長職務，所在艦艇長為副長協助他們指揮。梅杏兒和一個女護士奉命來到186艦上負責醫療保護工作。鄭遠海把副長房間騰出來，讓給了她們。鄭遠海問梅杏兒為什麼探親也不告訴他一聲，梅杏兒極力迴避鄭遠海，鄭遠海不明白梅杏兒怎么突然對他冷淡，搞得鄭遠海不知所措，他希望基地更換醫護員，被魯淮成嚴厲的拒絕，鄭遠海只得命令姜喜子負責‘照顧’她們，不能讓他看到梅杏兒。海上對攻下來，雙方不分上下，最後Y方只剩下鄭遠海的186，S方剩下南克江的086。魯淮成下令取消最後一天的演習預案，雙方自由發揮，誰先擊中對方，誰將獲得勝利。
第20集鄭遠海和南克江都非常精明，雙方展開了拉鋸戰。梅杏兒和女護士相繼暈船，姜喜子希望鄭遠海去探望一下，他提醒鄭遠海做為艦長應該對每個人的戰鬥力負責，而不是應為個人感情，鄭遠海來到了梅杏兒房間，默默地看著昏睡的梅杏兒，等鄭遠海出門後，梅杏兒睜開眼睛，流出眼淚，她克制著自己的情感，努力忘掉自己的所愛。深夜，186艦接到基地報告，有一艘艦隻利用暗夜向我領海線靠近，命令演習暫停，雙方趕往八號海域實施警戒，鄭遠海建議闖過八號海域，提前接近那艘外艦，但陳建軍不同意，通知鄭遠海演習已經結束了，他的指揮權已經收回。天亮，補給船到，並通知海上將有大風浪，鄭遠海希望梅杏兒和女護士隨補給船返回基地，被梅杏兒拒絕，她告訴鄭遠海自己也是軍人，沒有理由離開戰位。鄭遠海生氣的離去。狂風大作，艦艇象一片樹葉一樣在大浪中上下起伏，很多戰士被撞傷，梅杏兒勇敢地面對，她克服著虛脫的身體堅持給受傷戰士抱扎撞傷，鄭遠海站在晃動的駕駛室里，沉著指揮著。於季東帶著秦思婷來到一艘所高級餐廳，將一輛停在窗外的寶馬轎車的鑰匙交到秦思婷手裡，希望她接受自己的愛情，秦思婷心裡掛念著與風浪搏鬥的鄭遠海，她把鑰匙退回給於季東，明確告訴他，自己的心上人是鄭遠海。186回到軍港，鄭遠海來看把自己關在屋裡幾天的於季東，當撞開門後，大醉的於季東狠狠地瞪著鄭遠海，告訴他，他們的兄弟關係已經沒有了！失去朋友的鄭遠海也喝多了，他敲開梅杏兒的門，抱住她，喃喃地叫著：梅杏兒我愛你---，梅杏兒嚇得趕緊掙開跑掉，鄭遠海突然看見了屋裡的秦思婷，兩人都很尷尬的離開了梅杏兒的房間。經魯淮成批准，鄭遠海和姜喜子架著小艇離開186艦，朝八號海域礁石區駛去，他們將深入探測八號海域礁石區域的具體數據。
第21集鄭遠海關掉發動機，用漿划行著，姜喜子仔細聽著耳機進行著聲納探測。他們不時地給深海區的186艦保持著聯繫，陳建軍隨時給基地作戰室里的魯淮成匯報著情況。黑夜臨，探測完畢，他們驚訝地發現，這片水域礁石與海面的深度潛艇是無法通過的，一定在海下礁石底下有可供潛艇通過的通道。由於天色已晚，鄭遠海決定返航，他們帶著發現八號“死亡”海域秘密的喜悅，架著小艇朝來路出發，突然小艇被漲潮後海水掩蓋的礁石撞上，小艇傾斜地飛去，羅盤落水，螺旋槳被撞斷，艙內漏水，無線電通訊短路，他們與186艦失掉了聯繫。基地魯淮成接到186的報告，立即下達命令，偵察雷達全部開機搜尋，直升機大隊緊急待命，做好天亮起飛的準備。梅杏兒等醫護人員登上救護車朝機場飛駛而去。黑暗的大海上沒有一絲亮光，天上的星星也不見了，風浪開始湧來。鄭遠海叫姜喜子停下划槳，省下力氣，準備更艱苦的時候到來，姜喜子檢討自己不該光顧高興，沒有精力集中的駕艇。這時，大雨傾盆而下，小艇在茫茫雨夜的大海上飄蕩。清晨，風力減小，梅杏兒乘坐的直升飛機與數駕直升機同時升空，朝大海飛去。陳敬國也驅車趕到基地作戰室詢問情況。熾熱的太陽照射著小艇，鄭遠海和姜喜子昏睡著，姜喜子要喝水，鄭遠海把有水聲的水壺在他耳邊搖了搖，告訴他要把水留在最困難的餓時候謝庭群把鄭遠海失蹤的訊息告訴給秀竹，無意間讓許欣芳聽見，她默默地看著牆上鄭冀的遺像，盼著兒子能平安歸來。就在鄭遠海和姜喜子快奄奄一吸的時候，一架直升偵察機從他們頭上呼嘯而過。他們終於被發現，幾艘艦艇朝他們開去。
第22集經過治療，鄭遠海基本康復，他向前來探望的南克江透露了八號海域礁石下可能有潛艇能通過的水道，勾起了南克江的探求欲望，他們兩一起向基地起草了聯合勘察的報告。秦思婷探家回來，聽說了鄭遠海的事，抑制不住自己情感，朝病房跑去。病房是空的，她默默看著窗外和南克江在一起的鄭遠海，鬆了一口氣。姜喜子還要住院觀察，鄭遠海康復出院，他被任命為588護衛艦的艦長。梅杏也心神不定的給病人看著病，由於一時疏忽，把一位急性闌尾炎當成了輕微腸痙攣來醫治，致使病人穿孔，成為一起重大的責任醫療事故，面臨開除的境地，這時，秦思婷站出來主動承擔責任，梅杏兒感激秦思婷的姐妹情誼。她找到秦思婷，告訴她自己不愛鄭遠海，希望秦思婷去追鄭遠海，秦思婷將信將疑地看著梅杏兒。為了秦思婷梅杏兒違心向鄭遠海表示了自己只是把他當大哥哥，不想跟他談戀愛，希望他能跟秦思婷好！使得鄭遠海目瞪口呆。為了秦思婷，於季東心煩意亂，公司業務每況愈下，助手林雪找到梅杏兒，希望她去勸勸。梅杏兒來到於季東公司，建議兩人一起出外旅遊，到大山名川去，散散心，消除煩惱，於季東同意了梅杏兒的建議，於是兩人一起離開了東江。於季東在梅杏兒的陪同和開導下，忘掉了煩惱，懂得了人活著還有別的意思，同時他覺得梅杏兒善解人意，非常感謝她能陪他出來。深夜，查完鋪的鄭遠海心思重重地來到甲板上，政委過來，一眼看出了他的心思，他希望鄭遠海象出海訓練一樣，不要輕言放棄，鄭遠海默默地點點頭。
第23集梅杏兒假畢歸來，在門診值班，鄭遠海拿著病歷在她身邊坐下要求看病，梅杏兒急忙問怎么了，鄭遠海說是心病！梅杏兒明白過來，她勸他別這樣，然後叫了下一個病人，鄭遠海無奈地離開。晚上，於季東將梅杏兒約出來，將一束紅色的玫瑰送給梅杏兒，向她表達了心意，他覺得這次跟梅杏兒出去，才發現她才是自己要找的最合適的人，梅杏兒驚呆了。於季東滿面春風的回到了公司，他打電話把所有朋友召集到了軍迷吧，當著鄭遠海，秦思婷，梅杏兒，謝庭群等宣布，他已經找到了最愛，這個人就是梅杏兒。所有在場的人都震驚，鄭遠海追上梅杏兒問這是怎么回事，梅杏兒為了秦思婷，為了讓鄭遠海死心，她流著淚默認了於季東的話！按基地布置，鄭遠海率領588護衛艦，陳建軍率領186驅逐艦在海上實施單艦對抗演練。鄭遠海心事重重，情緒沮喪，幾次貽誤戰機，讓陳建軍槍得先機，三戰三敗，受到了魯淮成的電話批評。鄭遠海終於理智的醒來，他重新部署了進攻路線，利用陳建軍三戰三捷的大意心理，當186艦打開雷達搜尋目標時，接收到的是鄭遠海588艦的攻擊信號。陳敬國嘲笑陳建軍，全艦隊最好的飛彈驅逐艦竟然輸給了一艘護衛艦，陳建軍表面不以為然，但心裡感到了鄭遠海給他爭當新驅艦長的挑戰和壓力。克江接受了指揮挑戰深潛極限的長航任務，他意識到這次出海危險性，他來到軍迷吧找秀竹，但秀竹不在，他讓馬一凡轉告秀竹說，自己沒有一天忘記過她，然後匆匆離去，謝庭群展開了追求秀竹的最後一搏，他拿著報紙包著的紗巾送給了剛剛回來的秀竹。南克江的潛艇出發了，秀竹突然發現了包紗巾的報紙上刊登著南克江救女青年的事跡，真相終於大白，秀竹朝潛艇碼頭跑去，可是潛艇已經遠去。
第24集潛艇在300米的水下開始了長期航行的演練，水兵們從興奮期，到煩躁期，再到最後的呆滯期，挑戰著人的生理極限。南克江的潛艇在水下克服了重重困難深潛了90天，鄭秀竹在岸邊默默為他祈禱等待了90天。潛艇終於完成我軍潛艇的有史以來最長的長航，也挑戰了外軍長航時間，當南克江撐著疲憊的身軀登出潛艇時，迎接他的是秀竹深情擁抱，兩個人終於揭開誤會，和好如初。謝庭群在愛情上失敗了，他不甘心就這樣輸給南克江，當基地將南克江提任艇長的報告上報艦隊時，他再次假傳聖旨，給壓了下來。魯淮成堅決抵制艦隊派來的關係幹部，堅持南克江代理艇長的職務，一直帶到正式任命到達為止。在精選未來旗艦艦長問題上，魯淮成別出心裁搞了個心理測試，叫秦思婷專程到中國科學院搞來一套心理測試的教材，對所有候選人進行室外高台上，邊行進邊回答問題，由此淘汰了一批候選人，最後只剩下陳建軍和鄭遠海兩人，他們經過較量，最終打成平手。
第25集梅得貴想娶個媳婦，但需要給媒人一些錢，為此他來到東江，想找梅杏兒要錢，但又不好意思開口，為了給自己壯膽，他喝了很多酒，當見到梅杏兒時，自己呼呼睡去，梅杏兒將父親扶到床上，突然聽到梅得貴說的胡話，他嘟囔著說梅杏兒不是檢來的，是親生的，這引起了梅杏兒的疑惑，她看著自己的照片，覺得自己與父親長的太不象了。第二天梅杏兒來到魯淮成辦公室給他量血壓，她要了魯淮成失散的女兒照片，和自己小時候的照片對照，覺得長的很象，她決定到市裡的婦幼醫院去查她母親去世時的擋案。終於證實她所謂的母親是個謊言，因為她是難產而死，這進一步證實了小時候村里人說的自己是檢來的傳言。於季東來找梅杏兒沒見著，見到了梅得貴，他高興的把梅得貴接到酒店為他接風，並給了梅得貴十萬元的見面禮。秀竹匆匆找到剛剛下艦的鄭遠海，把母親的藏著的胃癌晚期診斷書拿給哥哥看，鄭遠海驚訝。他們裝著若無其事地回到家裡，結果許欣芳給鄭遠海洗衣服時，從口袋裡摸出了那張診斷書，三人都相互知道了真情，許欣芳覺得有必要見見魯淮成，向他公開一切。魯淮成把他們接到了自己家，為兩家人團圓高興，當得知鄭遠海一家住的是租來的房子，馬上命令營房處，成立清房小組，給一線幹部都分上房子，這樣，鄭遠海一家終於住上了分配的住房。許欣芳覺得自己的日子不多了，希望鄭遠海能把婚結了，這是她對兒子的請求，鄭遠海經過思考，找到了秦思婷，向她求婚，坦言是因為母親，但會努力去愛，但遭到了秦思婷的拒絕。
第26集於季東趕到基地醫院，正碰上梅杏兒送梅得貴回鄉，於季東不由分說把梅得貴拉到了一個豪華賓館套間住了下來，梅得貴高興的決定不走了，梅杏兒無奈地只能先這樣將就著。鄭遠海和陳建軍在海上值勤，突然一架不明國際的無人偵察機在186艦上空盤旋，鄭遠海電告陳建軍應該把它擊落，陳建軍回答得請示基地，鄭遠海覺得這是對我海軍的挑釁，等基地來命令，偵察飛機早就收集完情報溜走了，他不顧政委的勸阻，毅然發射飛彈擊落無人偵察機，偵察機的殘骸落下時，險些砸到186艦的尾部，但落水的彈片還是使兩名戰士受傷。基地保衛處將鄭遠海關進了禁閉室，等候艦隊調查組的調查處理。姜喜子要求釋放鄭遠海，大鬧禁閉室，被鄭遠海呵住，姜喜子一氣之下，向陳建軍交上了請調報告，要求到鄭遠海的護衛艦上去，不願意在一個沒有骨氣艦長身邊工作，陳建軍自尊心受到損傷，大怒。梅杏兒來到魯淮成的辦公室請求幫助，魯淮成沉重地告訴梅杏兒，這件事自己已經沒有權利干預了。秦思婷來到禁閉室，向鄭遠海展示了他們的結婚申請報告，告訴他，自己同意了求婚，願意一輩子跟他在一起，鄭遠海感激地握住秦思婷的手。許欣芳無意間得知兒子犯了大錯，焦急地來到魯淮成家，求他看在一個要走的人的份上，再給兒子一個機會吧。魯淮成親自趕到艦隊，找到陳敬國請求先把鄭遠海放出禁閉室，並告之他母親已經是胃癌晚期了。鄭遠海被放出禁閉室，回到了母親身邊，大家都知道鄭遠海可能面臨著按戰士復員處理。
第27集鄭遠海來看兩個受傷的戰士，遇到了梅杏兒，告訴她自己就要跟秦思婷結婚了，梅杏兒表面向他們祝福，回到房間痛哭不止。秦思婷陪著鄭遠海在海邊散步，她依偎在鄭遠海身邊。鄭遠海希望秦思婷要知道他現在的處境，秦思婷堅定的告訴鄭遠海，不管他將來怎么樣，她都會陪在他身邊。兩人靜靜地躺在沙灘的夜光下，昏睡中的鄭遠海喃喃自語我愛你，秦思婷深情地伏向他，但鄭遠海第二句話是，梅杏兒我愛你，秦思婷怔住了，她委屈地流出了眼淚。艦隊經過慎重研究，認定鄭遠海的行為是維護我領海安全的正當防衛，但不經請示擅自開炮，還傷了兩名戰士，給予記大過處分。鄭遠海回到了艦艇上，受到了全體官兵的熱烈歡迎，陳建軍也前來祝賀，並把姜喜子帶來，說手續已經辦好，姜喜子調到了588艦工作，鄭遠海堅決不同意，他命令誰也不準姜喜子上艦，天降大雨，姜喜子站在雨中一動不動，鄭遠海感動地冒雨來到姜喜子身邊，兩人緊緊地抱在一起。雨過天晴，鄭遠海來到秦思婷身邊，秦思婷告訴他，自己不打算跟他結婚了，因為她不願意躺在一個愛著另外一個女人的男人懷裡。還是做朋友。她告訴鄭遠海梅杏兒是為了自己才遠離他的，希望鄭遠海和梅杏兒相愛，這才是最公平的。鄭遠海找到梅杏兒，問她是不是真愛於季東，梅杏兒不說話，鄭遠海站在正在漲潮的海水裡，不管梅杏兒怎么勸他都站在那裡，直到海水淹沒到頭部，梅杏兒緊張地衝到海里，大聲呼喊，鄭遠海突然從海里冒出來，一把抱住梅杏兒，兩個人站在海水裡深深地吻在一起。
第28集在軍迷吧，鄭遠海坦誠地告訴於季東，自己和梅杏相愛多年了，於季東呆呆地看著鄭遠海，覺得怎么他愛誰，誰就愛鄭遠海，一氣之下喝得大醉不歸。梅杏兒來到於季東別墅，接梅得貴回宿舍，梅得貴堅決不走，說於季東是多好的人呀，上哪兒也找不到這樣有錢的女婿。一氣之下梅得貴到了基地找到魯淮成，讓部隊給評評理，魯淮成好言相勸，表示，婚姻父母不能包辦，得梅杏兒自己做主。秦思婷專程來找於季東，告訴他梅杏兒和鄭遠海早就相愛，是自己，梅杏兒才離開鄭遠海的，彼此不相愛結婚又有什麼意思呢。於季東長嘆倒霉。許欣芳欣喜地拉著梅杏兒打量，她問鄭遠海這次不會變了吧，大家都樂了。鄭遠海和梅杏兒相依在海邊，他們盡情地跑著，歡笑著。鄭遠海要出海了，梅杏兒依依不捨得送他到軍港碼頭，他們揮手告別。梅得貴突然發病，醫生診斷是尿毒症，需要換腎，合適的供體已有，只要三十萬元一到位就可以做手術。梅杏兒傻了，她到哪裡去弄三十萬元啊！於季東得知後，趕緊張羅籌錢，但是公司的資金已經所省無幾了，於季東準備賣車也要救梅杏兒他爹，林雪制止了賣車，說由她來想辦法搞到三十萬。林雪提著三十萬找到梅杏兒，梅杏兒萬分感激，但林雪提出的條件是梅杏兒要答應嫁給於季東，梅杏兒萬萬沒想到於季東會提出這樣的條件，當即拒絕。梅得貴得知換腎需要那么多錢，拒絕治療，準備回鄉，梅杏兒央求梅得貴自己是他撫養大的，決不能見死不救，就是付出多大代價也要做這個手術。最終，走投無路的梅杏兒忍痛答應了林雪的要求，嫁給於季東。
第29集梅杏兒把一切都隱瞞著，海邊，她依偎在鄭遠海的身邊，她意識到這是他跟鄭遠海在一起的最後一個晚上了，她緊緊地抱著鄭遠海直到天亮，鄭遠海出海了，梅杏兒還久久地站在海邊，目送自己的愛人遠行。梅得貴的手術成功，於季東也操辦著自己和梅杏兒的婚事。秀竹受哥哥委託，來醫院看梅得貴，病房裡沒人，她放下水果，突然發現床上的撥浪鼓，秀竹聽大人說過這個撥浪鼓是魯淮成給自己女兒買的玩具，怎么會在這裡呢？她找到在花園散步的梅得貴，問他，這個撥浪鼓是哪來的？梅杏兒是他親生的嗎？梅得貴緊張的離去，看出破綻的秀竹趕緊給梅杏兒打電話，約好在醫院門口見，當梅杏兒趕來時，秀竹急切地朝她跑來，結果被後面開來的一輛車撞倒。醫院確診顱腦受損，神志不清，一直昏睡，可能會成植物人。許欣芳悲痛欲絕，她不能接受女兒剛才還好好的，現在就一聲不吭的躺在那裡。梅杏兒找到秦思婷，告訴她自己要和季東結婚了，秦思婷誤以為梅杏兒是看見秀竹這樣會成為將來的負擔而再次離開鄭遠海，生氣地斥責她變了，再也不是當年的梅杏兒了，梅杏兒只能委屈的跑去。鄭遠海被緊急召回，他來到妹妹身邊，秦思婷告訴他，梅杏兒這次真的要跟於季東結婚了，希望他象男人一樣挺住。鄭遠海默默地承受著眼前的一切。梅得貴懷著內疚來到秀竹的病房，他幾次欲言又止，許欣芳以為是為梅杏兒的事，大度的寬慰梅得貴不要把這事放在心上，都能理解。
第30集許欣芳又吐血了，她預感自己的時間不多了，她突然想到帶著不醒人事的秀竹離開人世，不能再拖累兒子了，她在街上買了有巨毒的草藥，回到家含淚一針一線地為秀竹縫了件新的衣裳，給她穿上，然後給她餵藥，可是怎么也餵不進嘴裡，最後她端起藥碗一口喝下。當鄭遠海趕回到床邊時，許欣芳已經離開人世，鄭遠海默默地看著把自己辛苦拉扯大的母親，雙腿下跪，長時不起。辦完母親的喪事，鄭遠海又匆匆返回軍艦，繼續完成攻潛演練。海上，先進的186艦發現右舷二海里，水下六十米一艘潛艇在懸停，陳建軍誤以為是南克江的086，怕鄭遠海再次搶得先機，趕緊獨自啟動，通報給鄭遠海後就關閉電台只身前往。鄭遠海根據基地在一個小時前發來的通報所敘，086潛艇在六號海域，不可能這么快就來到這裡，很可能是不明國籍的潛艇，如果陳建軍用模擬彈攻擊它，它就會實彈回擊，那後果不堪構想。鄭遠海緊急命令實彈做好反潛準備，並聲納核實是否是我方潛艇，姜喜子確認是塗有吸波材料的外軍潛艇，由於186關閉了電台，鄭遠海果斷命令向186艦和不明潛艇之間的空擋炮擊。陳建軍驚訝地看著前方炮擊的水柱，打開電台才知道前方水下是不明國籍潛艇。不明潛艇受到驚擾，趕緊啟動朝公海逃竄。魯淮成接到報告，命令追擊不明潛艇，一定要活捉它。鄭遠海588艦快速抄近海的八號海域準備攔截不明潛艇，陳建軍的186艦在後面緊追。基地作戰室緊張地接到海上報告，鄭遠海的588在八號海域觸礁，堵漏時多名官兵負傷。返港後鄭遠海被基地憲兵帶走，再次陷入絕境。
第31集艦隊調查組進駐基地，鄭遠海被隔離。但陳建軍的心裡一點都不輕鬆，他經過激烈的思想鬥爭，最後決定說出真相，勇敢地承擔責任。他把真實情況的報告交給謝庭群，希望他轉交給父親，因為他不敢對視父親的眼睛。庭群為保護陳建軍，私自將報告內容更改，送交了艦隊組做出處理意見，鄭遠海按戰士復員，父親當年也是在八號海域觸礁船沉，也是按戰士復員處理，歷史驚人的相似。鄭遠海來找陳建軍道別，感謝他對自己的幫助，使自己不枉穿這身軍裝，陳建軍不解，自己報告說得很清楚，怎么還處理鄭遠海？他來到父親的辦公室，陳敬國去北京開會，謝庭群承認是自己把報告更改，陳建軍狠狠給了他一拳。陳建軍闖入正在宣布鄭遠海處理決定的會場，向所有領導和官兵說出了真相。陳建軍希望魯淮成在處理決定出來之前，不要讓自己父親知道，他不願意人們說他的每一步都是在父親的庇護下走過來的。工作組重新認定了事故責任，但處理意見希望基地做出，難題甩給了魯淮成，魯淮成懷著沉痛的心情來到醫院見陳敬國，見到老首長他又欲言又止，這是他一生中第一次沒有快人快語，他一字不提地離開了醫院。魯淮成和基地黨委最後做出決定：陳建軍按戰士復員。陳敬國接到報告一句話沒說，在上面簽上了自己的名字。深夜，陳敬國請兒子陳建軍喝酒，父子倆含淚把酒，傾訴衷腸。謝庭群站在門外感動得熱淚盈眶。第二天，陳敬國親自來到基地宣布了處理決定。陳建軍向魯淮成道別，魯淮成囑咐他：不管別人怎樣評介你，記住脫下軍裝也不要忘記自己曾經是個軍人。鄭遠海問陳建軍為什麼要承認責任，陳建軍回答，你比我留在軍隊更有用。並囑咐他一定要抓住那條“鯊魚”。
第32集陳建軍整理好行李，看了看自己的艦長室，來到甲板，全體官兵向他敬禮。陳建軍含淚向軍旗行了他最後一個軍禮，轉身邁著大步離去。深受教育的謝庭群向陳敬國遞交了請調報告，他希望把他派到最基層去工作，一切從頭開始，努力使自己成為一個配穿這身軍裝的軍人。謝庭群來到基地救援船報到，擔任了副船長職務。姜喜子要退伍了，他請求鄭遠海最後讓他再隨艦出趟海，就在這次出海執行堵截武裝海盜劫持的國際貨輪的戰鬥中，獻出了自己的生命，東江基地領導根據姜喜子生前的遺囑，將他的骨灰撒向大海，鄭遠海悲痛地率艦出海，姜喜子的骨灰隨風飄落在深藍色的大海之中。樂聲中，東江基地軍港迎來了我國最新驅逐艦188旗艦，鄭遠海榮任艦長。魯淮成信任地看著鄭遠海國家把這么大的一筆財產交給我門，一定要用好它。鄭遠海表示一定不辜負領導的信任和人民的希望。深夜，梅得貴不忍梅杏兒為治自己的病而委身於季東，他終於含淚告訴了梅杏兒的身世，說出了謎底。梅杏兒堅定地要為養育自己的梅得貴治好病，並撫養終身。
第33集於季東為了給梅杏兒舉辦婚禮，找到了有黑社會背景的潭龍，向他借錢，保證過段時間，連同原來借的錢一同歸還。潭龍說只要於季東幫他的貨從海關過關，所有的錢都不用還。於季東聽說是倒賣文物，立即起身而去。不久，他就接到了潭龍催他還錢的電話。於季東被逼無奈，決定鋌而走險。他找到已經在海關緝私大隊擔任隊長的陳建軍，希望他能幫助貨物快速過關。這引起了陳建軍的注意。經過幾次較量，陳建軍終於將潭龍等倒賣文物的不法分子繩之以法。林雪拿著兩張出國機票希望於季東跟她一起出國，並告訴於季東，梅杏兒答應嫁給他是自己逼的，梅杏兒並不愛他。於季東憤怒的質問她為什麼要這樣做，林雪含淚說自己愛他，於季東驚訝。於季東和梅杏兒來到結婚登記處，由於已經下班時間已到，他們沒有辦成結婚登記手續約好明天一早來辦理。梅得貴終於將梅杏兒為治自己的病而委身於季東的事情告訴了秦思婷，真相大白，秦思婷將一切向醫院領導和魯淮成做了匯報，拿出自己三十萬的積蓄，替梅杏還給了於季東。於季東由於參與了潭德的販賣文物的罪行，被陳建軍的海關緝私隊抓獲。旗艦上，隨艦的梅杏兒手持那個從小跟隨自己的撥浪鼓，默默地看著大海。鄭遠海無意間看見，一眼認出這是小時侯自己逗魯淮成女兒的那隻撥浪鼓。魯淮成怎么也沒想到，自己尋找了二十多年的女兒竟然就在自己身邊。他終於找到了朝思慕想的女兒，梅杏兒呀終於找到了自己的親生父親，父女相認。
第34集深夜，一直昏睡的秀竹有了醒來的跡象，經過幾個小時的大腦手術，當太陽升起的時候，秀竹的神志終於醒了過來，她又重新看到了親人喜悅的面龐。一年後的一天，鄭遠海和梅杏兒，南克江和鄭秀竹一起舉行了婚禮。秦思婷做為梅杏兒的伴娘向他們表示了祝福。正在人們慶賀的時候，傳來南克江的潛艇在海下被不明物纏住了螺旋槳，情況十分危急，新郎南克江依然告別婚禮趕到了救援船上，前往出事海域。可是，深潛設備只夠六十米水深的救援條件，但潛艇被困在海下七十米，潛艇內已經嚴重缺揚，時間不能等待，身為救援船船長的謝庭群毅然穿上潛水服，冒險深潛到了被困的潛艇旁，他克服著氧氣管斷裂的危險，用最後一口氣堅持把纏在潛艇螺旋槳上的不明物砍斷，終於使潛艇起死回生地生到了海面。他卻因為氧氣管斷裂，窒息在海底，用行動實現了無愧於穿這身軍裝的誓言。海邊，陳敬國和魯淮成兩位將軍為謝庭群的英勇行為和成為一個真正的戰士脫帽敬。陰沉的夜海上，突然出現了不明國籍潛艇進入我領海線內，鄭遠海的旗艦和南克江潛艇奉命前後夾擊。鄭遠海率艦第三次勇闖八號死亡海域，他沉著指揮，果斷處理，成功地闖過八號海域，終於在太陽初升時，在我領海線內逼迫不明國際潛艇上浮，俘虜了多次闖入我領海偵察的“鯊魚”。魯淮成帶著找到二十多年失散的女兒和成功征服八號死亡海域的喜悅來到軍港碼頭，接受了所有艦艇站坡官兵的致敬。這位老兵看著英武成熟的鄭遠海，放心的離去。
演職員表
演員表
| 角色 | 演員 | 備註 |
| 賈一平 | 鄭遠海 | |
| 陸劍民 | 陳建軍 | |
| 王慶祥 | 魯淮成 | |
| 高 明 | 陳敬國 | |
| 傅 沖 | 秦思婷 | |
| 何 苗 | 梅杏兒 | |
| 張 笛 | 鄭秀竹 | |
| 王 靜 | 許欣芳 | |
| 丁 寧 | 南克江 | |
| 高 鑫 | 馬一凡 | |
| 馬小益 | 姜喜子 | |
| 儲智博 | 劉鐵鋼 | |
| 杜旭東 | 梅得貴 |
職員表
| 出品人 | 朱彤、張勇、蘇辰、何冰、林雄、陳潤生、賈雲峰 |
| 製作人 | 羅立平 |
| 監製 | 傅思、李洋、付岩、顧作義、黃長清、馬向陽、殷敦平、劉婷、黃海濤、趙文波、郁春豪 |
| 導演 | 巴特爾 |
| 編劇 | 段連民 |
| 攝影 | 黃巍、劉書寧 |
| 道具 | 宋華程 |
| 美術設計 | 劉陽、徐虔 |
角色介紹
![旗艦[2007年巴特爾執導電視劇]](/img/2/07f/nBnauM3X4QzM4IDM5kDM5UjM2UTM1QDN5MjM5ADMwAjMwUzL5AzLxMzLt92YucmbvRWdo5Cd0FmL0E2LvoDc0RHa.jpg) 旗艦[2007年巴特爾執導電視劇] |
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![旗艦[2007年巴特爾執導電視劇]](/img/4/d5f/nBnauM3X2gDO5kjN1ADMyAjM2UTM1QDN5MjM5ADMwAjMwUzLwAzL3UzLt92YucmbvRWdo5Cd0FmL0E2LvoDc0RHa.jpg) 旗艦[2007年巴特爾執導電視劇] |
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![旗艦[2007年巴特爾執導電視劇]](/img/6/dd9/nBnauM3X2MzM3AjM5kDM5UjM2UTM1QDN5MjM5ADMwAjMwUzL5AzL2MzLt92YucmbvRWdo5Cd0FmLxE2LvoDc0RHa.jpg) 旗艦[2007年巴特爾執導電視劇] |
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![旗艦[2007年巴特爾執導電視劇]](/img/6/e30/nBnauM3XyQjMzkDM5kDM5UjM2UTM1QDN5MjM5ADMwAjMwUzL5AzLwIzLt92YucmbvRWdo5Cd0FmLwE2LvoDc0RHa.jpg) 旗艦[2007年巴特爾執導電視劇] |
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音樂原聲
| 類型 | 曲目 | 作詞 | 作曲 | 演唱 | 演奏 |
| 主題曲、片尾曲 | 《藍色夢想》 | 陳曦 | 劉思軍 | 譚晶 | 中國愛樂交響樂團 |
幕後花絮
拍攝花絮●《旗艦》中的新時代艦長鄭遠海的是賈一平第一次扮演軍人形象。
●在拍攝過程中，因為穿著軍裝，賈一平第一次有了表演被束縛住的“不適感”。他回憶，有一場戲講的是鄭母去世，鄭遠海急急趕回，一進病房“撲通”一聲給母親跪下。然而跟組的軍事顧問立馬指出，按照部隊規定，穿軍裝是不可以跪的。
●《旗艦》是為獻禮人民解放軍建軍八十周年的影視作品，該片也是中國首部全景式大型軍事題材電視連續劇。
●在劇中傅沖扮演軍醫秦思婷，秦開始是一名受過嚴格訓練的海軍陸戰隊女戰士，為了這個形象，化妝時要把臉塗黑，來體現風裡來雨里去的女士兵。傅沖曾開玩笑說“化妝老師把我畫得那個黑啊，讓我從沒覺得自己的牙齒和白眼球有這么白過，哈哈，我可以去做牙膏廣告了”。
●該劇的所有軍艦、潛艇的場景鏡頭均在海軍艦艇部隊實景拍攝，其中壯觀震撼的海、陸、空立體軍事場面全方位展示了海軍陸戰隊、新型艦艇、飛彈、魚雷、艦載直升機、海軍陸戰隊水陸兩用坦克等高新武器，並首次用水下攝影的方式表現潛水員救助故障潛艇的緊張場面。
●《旗艦》播出的2008年，正值高考志願的填報期間，數字顯示2008年報考海軍軍事院校的考生劇增，是往年的三倍多。
獲獎記錄
| 獲獎時間 | 獎項名稱 | 備註 |
| 2009年3月 | 第21屆全軍電視劇“金星獎 ”長篇電視連續劇一等獎 | |
| 2009年9月 | 第27屆中國電視劇飛天獎提名榮譽獎 | |
| 2010年1月 | 湖北省“五個一工程獎”特等獎 |
播出信息
| 播出頻道 | 首播日期 | 播出時間 |
| CCTV1 | 2008年06月15日 | 晚間19：30分 |
劇集評價
《旗艦》是一部全方位描寫中國現代海軍的電視劇，使用“時尚偶像”的概念成功地包裝了“海軍英雄”，塑造了螢屏青春偶像，這個截然不同於“李雲龍”、“姜大牙”、“石光榮”的嶄新軍旅英雄，讓主旋律也變得青春起來，吸引了不少年輕觀眾的視線。
《旗艦》圍繞未來海軍的建設和發展，在又一次加進了“不拋棄、不放棄”的精神元素之餘，做到了戰友情與親情、愛情、友誼、理想、抱負、愛國主義的高度有機統一，真實全面立體地再現了海軍的工作、生活和學習。幾個主要人物的形象不僅是立體的豐富的，而且關鍵是對他們的前途、命運安排，符合觀眾的預期，符合時代特徵和發展要求。好的影視藝術作品不但要弘揚時代精神，反映時代要求，體現時代進步，還應該表現真實的人性，在某種程度上，《旗艦》做到了這一點。（新浪網評）
