助理研究員(1985.8-1989.7)，副研究員(1989.8-1997.7)，研究員（1997.7-），哈佛大學東亞語言與文化學系訪問學人(1990.9-1991.7)
自述：
明代的衛所與軍戶
長期以來，個人研究都以明代軍戶為中心，並由之發展出三項主軸。第一為有關軍戶家族的研究。由於明初規定軍戶不得分戶，正統以後又要求衛所軍人在衛落地生根，若干衛所軍戶戶丁又在衛所附近購置田產，附籍州縣，形成所謂的「附籍軍戶」，因此個人的軍戶研究也圍繞著「原籍軍戶」、「衛所軍戶」與「附籍軍戶」三部分，深入探討彼此間的家族關係與軍役分擔問題。此外，結合族譜與軍政條例，將國家規範與個別家族的實際案例做比對，藉以瞭解政策之落實程度。
第二是有關衛所及軍役的研究。由於明代衛所軍役因衛所所在位置之不同而有顯著差異，因此採取區域研究之方法，進行細部研究。自1993年始，首先鎖定腹里的江西地區，以方誌為主，大量蒐集相關史料。探討的問題包括明清時代江西地區兵制的演變、江西衛所軍役的內容、軍役執行方式的改變等，基本上已勾勒出腹里漕運地區衛所的輪廓。2002年以降，開始將研究對象轉至國都所在的華北地區，並透過「北京留守行後軍都督府」這個機構的制度變遷與規模變化，說明明代都司軍事邊界與布政司行政邊界「犬牙相制」體制之形成過程。
第三是有關軍戶戶役制的問題，包括軍戶的來源、政府對軍戶的管理方法等制度問題，以及軍戶丁的科舉、任官、婚姻、就業等社會問題。就中特別有興趣的是垛集軍與抽籍軍的性質問題，近年來並利用中國第一歷史檔案館出版的衛選簿配合族譜資料，探討垛集軍與抽籍軍的軍役繼承方式，並及明代軍戶制度中以戶名不動代役的特殊現象。
在推展此三大主軸之相關研究的同時，近年來也嘗試利用判牘、駁稿等資料，從法制史角度切入衛所軍戶問題，探討區域社會中的軍民關係與軍役糾紛。未來數年仍將一秉初衷，持續完成一直以來關注的各項課題，並全面蒐集明代政書、明人文集、檔案、族譜中散見的衛所武官與軍餘犯罪事例，期能掌握明代軍官、軍人犯罪型態，並分析不同類型犯罪之訴訟、審判程式，藉以釐清軍事審判、軍民相涉民、刑事審判之實態。
專書
《明代軍戶世襲制度》（台北：台灣學生書局，1987）。
《衛所、軍戶與軍役──以明清江西地區為中心的研究》（北京：北京大學出版社，2010.7）。
論文
〈從衛選簿看明代武官世襲制度〉，《食貨月刊》15.7/8 (1986)：30-51。
〈試論族譜中所見的明代軍戶〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》57.4 (1986)：635-667。
〈試論明代衛軍原籍與衛所分配的關係〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》60.2 (1989)：367-450。
〈明代軍戶の社會的地位について──科舉と任官において〉，《東洋學報》71.3/4 (1990)：91-131。
〈明代軍戶の社會的地位について──軍戶の婚姻をめぐつて〉，《明代史研究》18 (1990)：7-31。
〈明代軍制史研究的回顧與展望〉，收入國立台灣大學歷史學系編輯，《民國以來國史研究的回顧與展望研討會論文集》（台北：國立台灣大學出版組，1992），頁515-540。
〈再論族譜中所見的明代軍戶──幾個個案的研究〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》63.3 (1993)：639-678。
〈明代兩京建都與衛所軍戶遷徙之關係〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》64.1 (1993)：135-174。
〈日本明清史學界對「士大夫與民眾」問題之研究〉，《新史學》4.4 (1993)：141-175。
〈明代江西兵制的演變〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》66.4 (1995)：995-1074。
〈明代江西衛所的屯田〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》67.3 (1996)：655-742。
〈明代江西衛所軍役的演變〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》68.1 (1997)：1-53。
〈明武職選簿與衛所武官制的研究──記中研院史語所藏明代武職選簿殘本兼評川越泰博的選簿研究〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》69.1 (1998)：45-74。
〈明檔案的利用與明代衛所制度研究〉，《大陸雜誌》99.5 (1999)：9-26。
〈清代江西衛所的沿革與人口分布〉，《鄭欽仁教授榮退紀念論文集》（台北：稻鄉出版社，1999），頁295-327。
〈幫丁をめぐって──明代の軍戶において〉，收入西嶋定生博士追悼論文集編輯委員會編，《東アジア史の展開と日本──西嶋定生博士追悼論文集》（東京：山川出版社，2000），頁445-458。
〈明代江西衛所屯田與漕運的關係〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》72.2 (2001)：301-338。
〈明清時代江西衛所軍戶的管理與軍役糾紛〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》72.4 (2001)：833-887。
〈明清時代軍戶的家族關係──衛所軍戶與原籍軍戶之間〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》74.1 (2003)：97-140。
〈從《辭》看明末直豫晉交界地區的衛所軍戶與軍民詞訟〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》75.4 (2004)：745-795。
〈論明代的附籍軍戶與軍戶分戶〉，《顧誠先生紀念暨明清史研究文集》（鄭州：中州古籍出版社，2005），頁80-104。
〈再論垛集與抽籍〉，《鄭欽仁教授七秩壽慶論文集》（台北：稻鄉出版社，2006），頁197-237。
〈明北京行都督府考〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》79.4 (2008.12)：683-747。
〈犬牙相制──以明清時代的潼關衛為例〉，《中央研究院歷史語言研究所集刊》80.1 (2009.3)：77-135。
〈論明代垛集軍戶的軍役更代──兼論明代軍戶制度中戶名不動代役的現象〉，收入邱澎生、陳熙遠編，《明清法律運作中的權力與文化》（台北：聯經出版事業公司，2009.4），頁35-85。
書評
〈介紹小野和子編《明清時代の政治と社會》〉，《明史研究通訊》1 (1986)：31-39。
〈《森正夫明清史論集》介紹〉，《社會史研究通訊》11 (2008.7)：23-47。
翻譯
於志嘉譯，森正夫著，〈民眾反亂史研究的現狀與課題──讀小林一美之論點有感，《食貨月刊》15.11/12 (1986)：86-106。
於志嘉譯，宮崎市定著，〈宋代官制序說──宋史職官志的讀法〉，《大陸雜誌》78.1/2 (1989)：1-28。
於志嘉譯，森正夫著，〈明代江南土地制度研究史的回顧〉，《大陸雜誌》80.3 (1990)：1-16。
於志嘉譯，溝口雄三著，〈日本人為何研究中國〉，《新史學》1.2 (1990)：85-100。
於志嘉譯，森正夫著，〈民眾反亂、社會秩序與地域社會觀點──兼論日本近四十年的明清史研究〉，《歷史人類學學刊》5.2 (2007.10)：151-178。
