1978年,自治區科協根據本區微生物學科技隊伍的狀況和要求,決定籌備自治區微生物學會。由吳祖銀教授牽頭籌備工作。經過一年的努力,對自治區微生物科技隊伍初步摸了底,登記了第一批預備發展的會員,商定了學會的掛靠單位和推薦理事的單位,草擬了學會的章程草案。
1979年9月19 日至25日在烏魯木齊召開了新疆維吾爾自治區微生物學第一次會員代表大會,與會代表61名,批准了166名會員,選舉了由17名理事組成的首屆理事會。理事長為徐文哲,副理事長為魏柳根、吳祖銀、何國協、張延盛,秘書長為石玉瑚。會議同時進行了學術交流,收到論文30多篇。1983年8月18日至21日召開了第二次會員代表大會,與會代表80人,會員190名,交流論文46篇,修改了章程,選舉了由17名理事組成的理事會第二屆理事會。理事長為魏柳根,副理事長為吳祖銀、何國協、張延盛,秘書長為石玉瑚;1986年8月12 日至16日召開了第三次會員代表大會,與會代表91名,交流論文53篇,會員220名,選舉了第三屆理事會。選舉了由19名理事組成的第三屆理事會,理事長為石玉瑚,副理事長為楊鴻超、王飛黨、谷登豐,秘書長為黃磊。1992年10月2日至6日召開了第四屆會員代表大會,與會代表101名,交流論文72篇,會員272名,選舉了選舉了由21名理事組成的第四屆理事會。理事長由石玉瑚連任,副理事長為楊鴻超、王正黨、谷登豐,秘書長為張曉東。1998年6月20日至24日召開了第五次會員代表大會,與會代表121名,交流論文97篇,會員360名,永久會員23名,集體會員5個單位,選舉了第五屆理事會。理事長仍由石玉瑚連任, 副理事長為楊鴻超、王正黨、谷登豐、付志華,秘書長由張曉東連任。
學會成立23年來開展了多種活動,曾邀請來自澳大利亞、法國、荷蘭、烏克蘭、亞美尼亞、哈薩克等11個國家16名的教授來新疆講學,進行學術交流。還邀請了李季倫、田波、陳華癸、張樹政、范雲六、歐陽平凱等院士及26名著名教授來新疆講學,舉辦過專題學習班21次,共有2000人次參加。同時由本會組織會員進行科普活動15次,範圍遍及全疆21個地州縣,對企業諮詢服務活動19次,有28人參加,為新疆有關微生物產業發展做出了貢獻。
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