起源
據傳，該寺創建以前，在其西北方雅魯藏布江對岸的山尖有一小寺名“當嘎拉孜”，當時的住持就是多羅那他，由於地形限制當嘎拉孜寺不宜發展，多羅那他意俗移址，恰在此時有一隻烏鴉將他的盤子叨走，他緊追至現地後山頂方得到盤子，遂決定在此建寺，那現在的彭措林寺。住持多羅那他
據藏文史書記載：多羅那他是藏傳佛教覺囊派的著名高僧和佛學家，也是外蒙古（今蒙古人民共和國）最大轉世活佛哲布尊丹巴轉世系統的實際奠基人。他原名“袞噶寧波”，藏曆第十繞迥之木豬年（1575）生於衛藏交界處喀熱瓊尊地方一個佛學翻譯世家賈譯師庭。幼年在覺囊寺出家，學習顯密經論。青年時期，師從多位來藏印僧聽聞佛法、研習梵文，受益極大，成為名噪一是的知名佛學家。1608年（明萬曆三十六年）寫成《印度佛教史》，影響廣泛；1614年在覺囊寺附近興建達丹彭措林寺，弘傳自宗教法，把持“他空見”的覺囊寺附近興建達丹彭措林寺，弘傳自宗教法，把持“他空見”的覺囊派推向頂峰。同年被藏巴汗薦往喀爾部傳教弘法，行前第四世達賴喇嘛雲丹嘉措贈予“邁達理”（意為“慈氏佛”）活佛稱號。他在外蒙古弘法達二十年之久，被尊為“哲布尊丹巴”（意為“至尊聖者”）。他一生著述甚豐，除《印度佛教史》外，還有《時輪源流》、《娘地教法源流》等傳世。建成歷程
彭措林寺的建成經歷了三個階段：第一階段修建了集會殿；第二階段修建了16座小佛殿和部分僧舍；第三階段修建了山頂的土布堅拉康和山上的部分小殿堂，歷時十二年完成。以後歷年又有增修和擴建。興盛時期有喇嘛3000人，民主改革前有喇嘛350人，現有41人。寺廟建築群
彭措林寺規模宏大，上圍修有圍牆，正門北開，僅院內占地面積達37800平方米。院仙以集會殿為主體，周圍內有16座小拉康，還有印經院、宗政府遺址及僧舍。建築形式似密宗壇城（曼荼羅）。其他附屬建築多建於外圍，然後向山上發展，最後在山頂建土布堅拉康等，組成了一座龐大、宏偉、雄壯、完整的建築群體。根據寺廟建築分布的地形可分為山下建築群和山下建築群兩部分。山下建築群：由集會殿、拉康頓珠、印經院、宗政府遺址、僧舍等組成。集會殿：是彭措林寺的中心，面積為1700平方米，坐西朝東，外觀似為5層，實為3層。殿門外為庭院、講經台和影壁。影壁後為9級台階的平台，由平台攀木梯即進入集會殿底層。底層由前廊、在經堂、佛殿、依怙殿等組成。前廊面積59.4平方米（長10.8米，寬5.5米），有圓柱4根（柱徑0.8米），面闊3間進深2間；廊內壁畫內容為四大天王、十五尊地方神、八大龍王、王子、王妃、大臣、侍從等，線條流暢、色澤艷麗，堪稱壁畫精品。經堂門楣雕刻有獅子、神鳥等，形象生動。經堂面積約635平方米（長寬均25.5米），面闊7間進深7間，有柱3辜根，中間2長柱直通二層高側天窗，用於通風采光，其餘3次柱的柱頭及斗栱上分別繪有菩提薩埵34尊；堂內原供釋迦牟尼佛及弟子塑像多尊，多已殘毀，新塑有宗喀巴、十世班禪、多羅那他等塑像；四壁遍繪壁畫，內容以40尊高約2米的釋迦牟尼佛為中心，周圍間繪十六羅漢、俱種二十五氏、瑜伽母、貢欽仁布、寶帳依怙、能怖金剛、密集金剛、金剛瑜珈母及各類菩薩像，構圖嚴謹，布局合理，主次分明，用筆遒勁洗鍊，著色鮮麗合宜，充分顯示了世術嫻熟的技巧和高超的藝術才能。佛殿高出地面50厘米，內有8根長柱，面闊5間進深3間，面積151.2平方米（長16.8米，寬9米）；殿內主供確琅度瑪像，系我種物質混合鑄造；扣壁原供有7尊高大的銅像，現已毀；殿壁繪有釋迦牟尼佛、多羅那他等壁畫。依怙殿有柱2根，面闊3間進深2間，面積37.8平方米（長9米，寬4.2米）；殿內原供有貢布扎西、吉祥天母等護法神像，現殿後壁新塑有班丹拉姆護法神像；四壁皆繪壁畫，系金汁單線勾勒的護法神像，面目兇狠，姿態怪異，近看來 對畫像的面啊進行重描，更增添了神秘恐怖的氣氛。此護法神殿每年藏曆11月8日開放，供人們朝拜。集會殿右側小庫房外木梯帝邊的牆壁上亦繪有壁畫，題材似為雜技類。第二層圍繞經堂天窗設有明廊，寬2.2米，廊壁遍繪釋邊牟尼傳記壁畫。二層前端和左右兩側明廊後設有殿堂：前為加克拉康，即印度佛殿，據說此殿是當時專為從置印度贈送的佛像，後在殿內設有班禪寶座，該拉康面闊3間進深2間，有柱5根；左為乃迥貢康，面積27.36平方米（長5.7米，寬4.8米），供有佛像和繪有壁畫；右為貢康帕爾，為護法神殿。第三層左側為卓瑪拉康，即度母殿，面積27.54平方米（5.4米，寬5.1米），內有1柱，主供度母銅像，壁畫為覺囊派高僧像。三層右側為阿康（庫房），專門放置修補集會殿頂所用的工具。三層後面為俄門拉康，面闊5間進深3間，面積130.2平方米（長15.5米，寬8.4米），有柱8根；該拉刃壁畫最為精美，內容有釋邊牟、菩薩、密嚴剎土、毗盧遮那、阿牟伽皤賒五佛、覺囊派高僧、時輪壇城等。其中菩薩像最具特色，多為立姿，體態婀娜多姿，面容嫵媚動人，飾丁寧形腰帶，圓乳豐滿外露，披露，披帛下垂，著有短裙式螺紋褲，屬壁畫藝術中的上乘之作。
拉康頓珠：即16座佛殿。這些佛殿前三後三、左五右五對稱布局。殿之間有石砌的牆體相連，相對獨立中又保持著統一的完整性，所以殿堂的門均向集會殿。由於“十年浩劫”的毀壞，16座佛殿多已成為殘垣斷壁。近年來正在逐漸修復。
印經院：亦稱“巴爾康”。拉於集會殿右側，面積120.75平方米（長11.5米，寬10.5米）原建三層：底層為糧倉；中層為印經場和經版庫房；上層為僧舍。現僅存殘牆。
宗政府遺址；位於院子的西部。面積1500平方米，分為宗政房、糧晌庫、宿舍等建築。此外還僧舍數十幢，多成殘壁。
山上建築群：是彭措林寺的一個重要組成部分。其中最大的土布堅拉康坐落在山頂，其餘的吉傑拉康、羅漢堂、布達拉拉康，巴日拉康，卓瑪拉康、喇嘛拉康、扎謝拉康等7座小拉康與部分僧舍如眾星拱月似的散布在山脊兩邊，更增添了寺廟的偉岸雄壯氣勢。
土布堅拉康：即觀音殿，位於集會殿西南方的確康澤山頂。坐西南朝東北。其建築方法是：底部兩層利用山坡作後牆，補砌而修，到第三層時被平山頂，其上再建三層，共五層。底兩層因受地形限制，多闢為單間，一般用作庫房和僧保。第三層方為殿堂，面積152.44平方米（長14.8米，寬10.3米），層高5米，殿內原供有高大的觀音菩薩塑像，據說此像內放置有多羅那他的法身靈骨；四壁繪有勝樂金剛（高約4米）等神像。第四五層均為廊房式建築，四壁繪有壁畫。拉康左右兩側建有多羅那他的經堂、宿舍、馬廄等附屬建築。外圍修有寬3米的轉經廊，廊外用石塊砌築有護牆，曲折蜿蜒。山上建築群中，除土布堅拉康以外的殿堂規模皆不大，“文革”中亦多遭毀壞，近年來正在陸續維修。
彭措林寺不僅擁有規模宏偉的建築群和豐富多彩的壁畫藝術，寺內保存的各類文物造像亦很豐富，主要有玉器、石刻造像、金銅造像、木雕等，彌足珍貴。
玉器；主要是玉錛。原有7件，現僅存3件。通體磨光，加工精緻，是了解這一地區史前文化遺蹟的重要線索。
石刻造像：總數約150尊。主要放置於集會殿外圍一周，多取青灰色板岩，採取淺浮雕技法，刀法圓潤，線條流暢，風格渾厚。其內容主要有三世佛、五世伸縮、五方佛（中央毗盧遮那佛、東方阿閦佛、南方寶生佛、西方阿彌陀佛、北方不空成就佛）、一佛二弟子（釋迦牟尼與迦葉、阿難）、十六羅漢、度母及許多大譯師、軌範師等。此外，1990年密碼密宗殿地下挖出的大威德、空行母、勝樂金剛等像採用了半圓雕技法，刻工精細，為石刻造像中的精品。
金銅造像：總數約一百六址余尊。大部分為銅質，有的表面鎏金。內容有各類佛、菩薩、度母、金剛、護法神及祖師等，其中該寺第二代活佛等像較為別致精美。
瓷器：主要為青花瓷，數量不多，其中2件瓷碗和1件瓷壺圖案比較新穎。
木雕：主要為經書板，數量不多，但很精緻，一般是採取浮雕法，刻有釋迦牟尼傳記故事中的小情節。
寺存“四寶”
寺存“四寶”：一是堆波瓦·喜饒堅贊的打結拐杖，約1米長；一是多羅那他的手杖，據說是蒙古人所贈，手杖上雕刻有蒙文和藏文，手柄上雕刻有一龍頭，上部雕有米拉日巴（1040～1123）正在修行的形象，其下盤雕一條張牙舞爪龍，雕刻的圖案有海螺、雕工細緻，構圖巧妙，是一件珍貴的藝術品；三是多羅那他的法鈸，相傳眾生聞到其聲，便能解脫苦海；四是一對寶石，一個形似雞蛋呈白色，上面有天然形成的“嗡啊吽”咒語和字形符號。另一個形如杏仁，中間有一道明顯的白線，據說這對寶石是納木龍王贈獻給多羅那他之護法神貢布扎協的供品。彭措林寺每年藏曆12月27日要舉行跳神活動；藏曆10月8日要舉行朝拜度母儀式，熱鬧非凡。
