目前，國際關係學院/南洋研究院下設國際關係系、外交與僑務系、亞太國際關係研究所、東南亞經濟研究所、中外關係史與華僑華人研究所、《南洋問題研究》和《南洋資料譯叢》編輯部、圖書館、辦公室。現有國際政治和外交學本科專業，世界經濟、國際關係、專門史碩士點，政治學理論、世界經濟、專門史博士點，擁有1個國家“211工程”建設子項目、1個國家“985工程”哲學社會科學創新基地、1個教育部人文社會科學重點研究基地、1個省級重點學科。2004年12月成立的馬來西亞研究所，是與馬來西亞首相阿都拉·巴達維提議建立的馬來亞大學中國研究所相對應的研究機構。2008年5月成立了蘇氏東南亞研究中心，它由新加坡國立大學資深教授蘇瑞福捐資興辦。
學院/研究院現有在職人員43人，其中專任教學教師30人。現有在職教師(不包括返聘教師)中具有博士學位的教師30人，占教師比重的100%；教授8人，其中博士生導師6人，副教授13人，副教授以上職務的教師占教師比重的70%；45歲以下青年教師17人，占教師比重的56.67%；教師中留學回國人員人數16人，占教師比重的53.33%。現任院長莊國土教授，黨委書記范麗，副院長王勤教授、李一平教授、施雪琴教授，黨委副書記黃俊清。
“十一五”期間（2006－2010年），學院/研究院教師作為第一負責人承擔的各類科研項目35項，其中省部級以上項目32項，國際（境外）合作項目3項；共出版學術專著或譯著（第一作者署名）36部，發表學術論文（第一作者署名）373篇，其中在CSSCI期刊發表的學術論文205篇；獲得省部級以上社會科學優秀成果和優秀教學成果獎9項，為外交部、中聯部、商務部、國僑辦等提供了一系列決策諮詢報告，並獲得採納。至2011年9月，在校本科生157人，研究生151人，其中碩士生95人，博士生56人（含海外留學生17人，國際碩士36人）。
近年來，學院/研究院積極實施國際化戰略，不斷擴大對外學術交流。每年接待數十批國際學者來訪，其中包括國際上從事國際問題和東南亞研究的著名學者；每年均舉辦大型的國際學術會議，舉辦數十場國外學者講座；每年教師和科研人員均在東南亞當地進行1個月以上的實地調研和研究工作，每年在國外發表的學術論文達10餘篇。
學院/研究院擁有先進的科研與教學設施，在東南亞資料信息收集方面居於國內領先地位。學院/研究院擁有獨立的圖書館，館藏圖書5.3萬冊，其中外文書籍2萬餘冊；現有報刊1160種，其中外文報刊880種。《南洋問題研究》（創刊於1974年）和《南洋資料譯叢》（創刊於1957年）是研究院向國內外公開出版的學術刊物，《南洋問題研究》為中文社會科學引文（CSSCI）選用期刊。同時，學院/研究院已建成東南亞教學實驗室和多媒體教室。
近年來，學院/研究院堅持以基礎研究為主，注重套用研究，加強學科建設和隊伍建設，提高研究生教育的水平，參與政府部門決策諮詢，加快資料信息系統建設，逐步形成了多學科和綜合性的東南亞研究與教學體系，成為國內的東南亞基礎研究、人才培養、決策諮詢和資料信息中心。進入21世紀，學院/研究院繼續以國家發展目標與重大需求為指導，瞄準國際上東南亞研究的前沿，保持和增強東南亞研究的學科特色和優勢，不斷提升東南亞研究的綜合實力和國際競爭力，努力將學院/研究院建設成國內一流和國際知名的學術機構。
