歷史沿革
1957年，3路開通投入運營【輪渡——火車站】。
1980年代初，蓮花小區建成，隨後3路就延伸到那裡【輪渡——蓮花小區】（存疑）。
1997年07月05日，調整3路延伸至蓮花三村始發【蓮花三村——輪渡】。
1、沿途站點：上行:蓮花三村→蓮花二村→蓮花中學→幼稚園→農行大廈→蓮坂國貿→雙涵路口→火車站→金榜公園美新→文灶→將軍祠→一中→中山公園→文化宮名匯廣場→達意商城→中醫院→海濱大廈→輪渡。下行:輪渡→和平碼頭→中醫院→第一醫院→文化宮名匯廣場→中山公園→一中→將軍祠→文灶→金榜公園美新→火車站→雙涵路口→蓮坂→蓮花路口東→海山路口→蓮花中學→蓮花二村→蓮花三村 。
2、首末班時間：蓮花三村首班06:00末班22:40，輪渡首班05:40末班23:05 。
2007年05月26日，蓮花南路原“幼稚園站”更名為“蓮花幼稚園站”。同時，蓮花南路原“農行大廈站”更名為“蓮花南路站”；廈禾路原“蓮坂站”更名為“蓮坂國貿站”；廈禾路原“金榜公園美新站”更名為“金榜公園站”；文園路原“人民保險站”更名為“文園路口站”；公園南路原“文化宮名匯廣場站”更名為“新華路口（原文化宮）站”；思明南路原“達意商城站”更名為“中山路站”；鎮海路原“中醫院站”更名為“婦幼保健院站”。
2008年11月28日，因蓮花北路(海山路口-蓮花路口)路段封閉施工，3路由輪渡往蓮花三村方向，行經嘉禾路蓮花路口，暫改為右轉經蓮花南、北路至蓮花三村，工程竣工後恢復原運行線路。返程由蓮花三村始發，經呂嶺路、嘉蓮路（台灣街路口至蓮花二村路段）、蓮花北路、蓮花南路銜接原線路運行。
2009年10月13日，第一階段：10月13日零時至31日零時，新華路（鎮海路口—中山路口）路段雙向封閉施工，禁止車輛通行；行經車輛繞行鎮海路、公園南路。3路公車，從文灶方向行至鎮海路新華路口，改為直行鎮海路，經同安路、虎園路接原線路運行，返程運行線路不變，單向減停新華路口站，原停靠公園南路的中山公園站改為臨時停靠虎園路的中山公園站。
2010年09月16日，為配合中山路東段改為步行街，廈門公交集團3路公交線路進行相應調整：往輪渡方向，經公園南路右轉新華路、思明東路、思明南路接原線路運行。增停：思東站，減停：第一醫院思明分院站。返程時運行不變。
2010年10月25日起執行，梧村汽車站（站前停靠站）實行分站停靠措施：3路島內線路停靠外側站點（靠廈禾路）。
2012年07月23日，思明南路中華城段（往思北方向）恢復公交站點“中華城”站，調整3路公交線路停靠該站。對向的思明南路“中山路”站（定安廣場前）同時更名為“中華城”站。
2012年08月12日，廈門公交集團調整延伸3路公交線路至第一碼頭始發【第一碼頭——蓮花三村總站】。
1、線路走向：往輪渡方向，經停輪渡站（輪渡郵局站）後，改經鷺江道、西堤南三路至第一碼頭站。返程第一碼頭站經廈禾路延伸段、鷺江道接原線路運行。增停站點：第一碼頭站、鷺江道站。
2013年03月05日，蓮花北路呂嶺路口的原“蓮花三村站”更名為“蓮花三村總站”。
2013年07月04日，每天夜間23:00至凌晨06:00，通行文園路一中往將軍祠方向的3路公交線路改經公園東路、廈禾路接原線路運行，返程不變。減停站點：中山公園站（廈門賓館對面）、一中站和將軍祠站；增停站點：公園東路站、公園東門站、二市站和後江埭站。
2013年08月29日，鷺江道（方位：東）原“輪渡站”更名為“輪渡公交場站”。
2014年05月05日，因軌道1號線鎮海路站施工圍擋，鎮海路（思明南路口至鷺江道段）由東往西，壽山路（鷺江道至思明南路口段）由西往東，實施車輛單向通行。原海軍基地一側的“婦幼保健院站”遷移調整至鷺江道（鷺江道往演武大橋方向，過了鎮海路口紅綠燈處）。涉及公交線路3路，具體調整方案。鷺江道往第一醫院方向，輪渡往第一醫院方向，行至鷺江道鎮海路口，改為直行鷺江道，經壽山路、思明南路、鎮海路接原線路運行，返程不變。單向減停：婦幼保健院站（海軍基地一側）。單向增停：婦幼保健院站（鷺江道）。
2014年05月24日，鷺江道的“婦幼保健院站”與“和平碼頭站”整合，婦幼保健院站（鷺江道上臨時站點）取消，原“和平碼頭站”臨時更名為“婦幼保健院站”。
2015年01月19日，為方便乘客出行，廈門公交集團湖裡公司3路往第一碼頭單向增停“文園路口站”。同時，單向增停BRT第一碼頭站（第一碼頭始發方向）。
2015年02月14日，梧村街道辦一側的廈禾路“雙涵路口站”取消。
2015年07月05日，途經呂嶺路、蓮坂、湖濱南路等軌道施工路段的23路與3路整合，整合後3路延伸至蓮花五村始發【蓮花五村——第一碼頭】，23路取消，原有23路的客流由3路和45路替代承運。
1、線路走向：上行:蓮花五村始發，經龍山路、龍昌路、誼愛路、龍山中路、呂嶺路、蓮花北路接原線往第一碼頭。下行:第一碼頭始發，行至蓮花北路，經呂嶺路、龍山中路、龍山路至蓮花五村。
2、增減停站點：增停:蓮花五村站、龍華里站（往第一碼頭方向）、龍山中路站（往第一碼頭方向）、龍盛里站、龍昌里站、泰和花園站、蓮花三村站。減停:蓮花三村總站。
3、首末班時間：蓮花五村首班05:50末班23:00，第一碼頭首班05:40末班23:05。
2016年04月16日，為方便市民及遊客的出行，文園路的“文園路口站”更名為“文塔站”。同時，誼愛路的“龍山中路站”更名為“龍昌路口站”。
2017年02月26日，因軌道交通2號線江頭站二期圍擋交通組織需要，江頭片區部分公交站點及線路調整如下：龍山中路的“龍昌里站”雙向站點臨時取消，3路雙向減停“龍昌里站”。
2017年03月09日，因輪渡公交場站改造施工需要，臨時調整輪渡片區公交線路的停靠站點，原停靠“輪渡公交場站”的21條公交線路分流至三個站點：分流3路公交線路停靠“輪渡郵局站”，減停“輪渡公交場站”。
2017年07月26日，輪渡公交場站提升改造工程已竣工，3路恢復進站內停靠，減停“輪渡郵局站”。停靠“輪渡公交場站”的2站台。
2017年10月28日，往第一碼頭方向減停“雙涵路口”站。
使用車型
2016年12月03日，3路退下一台XMQ6105G4: Y7713[9061]，新增1台XMQ6106AGCHEVD51: Z6675[6146]。[5-6]此時3路配有24台XMQ6127AGN5 [4068-4090]，2台XML6125JHEV，2台XMQ6105G4，1台XMQ6106AGCHEVD51。
2019年01月15日，88路1台XMQ6127AGCHEVD51: Z5751[6036]調至3路，替換1台XMQ6106AGCHEVD51: Z6675[6146]。至此3路統一為25台12米車。
隸屬單位
2006年，廈門公交集團湖裡公司成立，3路劃撥至湖裡公司。
2016年1月16日，廈門公交集團重組，3路改由思明公司第二車隊運營。
運營模式
3路【蓮花五村——第一碼頭】
首末班
蓮花五村 05:50-23:00
第一碼頭 05:40-23:05
票價
一票制1元，E通卡8折優惠。
運營單位
廈門公交集團思明公司第二車隊
線路走向
上行：蓮花五村始發，經龍山路、龍昌路、誼愛路、龍山中路、呂嶺路、蓮花北路、蓮花南路、嘉禾路、廈禾路、文園路、虎園路、公園南路、新華路、思明東路、思明南路、鎮海路、鷺江道、西堤南三路、西堤路至第一碼頭。
下行：第一碼頭始發，經西堤路、廈禾路、鷺江道、壽山路、思明南路、鎮海路、新華路、公園南路、虎園路、文園路、廈禾路、嘉禾路、蓮花南路、蓮花北路、呂嶺路、龍山中路、龍山路至蓮花五村。
沿途站點
上行：蓮花五村站→龍華里站→龍昌路口站→龍盛里站→龍昌里站→蓮花三村站→蓮花二村站→蓮花中學站→實驗幼稚園站→蓮花南路站→蓮坂北站→蓮坂國貿站→梧村車站→金榜公園站→文灶站→文塔站站→將軍祠站→一中站→中山公園站→思東站→中華城站→婦幼保健院站→海濱大廈站→輪渡公交場站→第一碼頭站
下行：第一碼頭站→BRT第一碼頭站→鷺江道站→輪渡站→和平碼頭站→婦幼保健院站→第一醫院站→新華路口站→中山公園站→一中站→將軍祠站→文灶站→金榜公園站→火車站→蓮坂國貿站→蓮坂北站→蓮花南路站→實驗幼稚園站→蓮花中學站→蓮花二村站→蓮花三村站→泰和花園站→龍盛里站→龍華里站→蓮花五村站[8]
配車
24台 XMQ6127AGN5 [4068-4090]
1台 XMQ6127AGCHEVD51: Z5751[6036]
站點詳情
上行
| 序號 | 站名 | 道路 | 換乘站點 | 備註 |
| 1 | 蓮花五村 | 龍山路 | ||
| 2 | 龍華里 | |||
| 3 | 龍昌路口 | 誼愛路 | 單向車站 | |
| 4 | 龍盛里 | 龍山中路 | ||
| 5 | 龍昌里 | 單向停靠 | ||
| 6 | 蓮花三村 | 蓮花北路 | ||
| 7 | 蓮花二村 | |||
| 8 | 蓮花中學 | |||
| 9 | 實驗幼稚園 | 蓮花南路 | ||
| 10 | 蓮花南路 | AMTR：蓮坂 | ||
| 11 | 蓮坂北 | 嘉禾路 | ||
| 12 | 蓮坂國貿 | 廈禾路 | AMTR：蓮坂 | |
| 13 | 梧村車站 | BRT：火車站 國鐵：廈門站 | 單向車站，停靠內道站台 | |
| 14 | 金榜公園 | BRT：文灶 | ||
| 15 | 文灶 | AMTR：文灶 | ||
| 16 | 文塔 | 文園路 | 單向車站 | |
| 17 | 將軍祠 | AMTR：將軍祠 | ||
| 18 | 一中 | |||
| 19 | 中山公園 | 公園南路 | AMTR：中山公園 | |
| 20 | 思東 | 思明東路 | 單向車站 | |
| 21 | 中華城 | 思明南路 | AMTR：中華城 | 單向停靠 |
| 22 | 婦幼保健院 | 鎮海路 | ||
| 23 | 海濱大廈 | 鷺江道 | 單向車站 | |
| 24 | 輪渡公交場站 | 單向車站，停靠第2站台 | ||
| 25 | 第一碼頭 | 西堤路 | BRT：第一碼頭 | 停靠第2站台 |
下行
| 序號 | 站名 | 道路 | 換乘站點 | 備註 |
| 1 | 第一碼頭 | 西堤路 | BRT：第一碼頭 | 停靠第2站台 |
| 2 | BRT第一碼頭 | 單向車站 | ||
| 3 | 鷺江道 | 鷺江道 | 單向停靠 | |
| 4 | 輪渡 | 單向車站 | ||
| 5 | 和平碼頭 | 單向車站 | ||
| 6 | 婦幼保健院 | 鎮海路 | ||
| 7 | 第一醫院 | AMTR：鎮海路 | ||
| 8 | 新華路口 | 公園南路 | 單向車站 | |
| 9 | 中山公園 | AMTR：中山公園 | ||
| 10 | 一中 | 文園路 | ||
| 11 | 將軍祠 | AMTR：將軍祠 | ||
| 12 | 文灶 | 廈禾路 | AMTR：文灶 | |
| 13 | 金榜公園 | BRT：文灶 | ||
| 14 | 火車站 | BRT：火車站 國鐵：廈門站 | 單向車站 | |
| 15 | 蓮坂國貿 | AMTR：蓮坂 | ||
| 16 | 蓮坂北 | 嘉禾路 | ||
| 17 | 蓮花南路 | 蓮花南路 | AMTR：蓮坂 | |
| 18 | 實驗幼稚園 | |||
| 19 | 蓮花中學 | 蓮花北路 | ||
| 20 | 蓮花二村 | |||
| 21 | 蓮花三村 | |||
| 22 | 泰和花園 | 呂嶺路 | ||
| 23 | 龍盛里 | 龍山中路 | ||
| 24 | 龍華里 | 龍山路 | ||
| 25 | 蓮花五村 |
所獲榮譽
榮譽稱號：敬老文明號
