生物分子間存在很多特異性的相互作用,它們之間都能夠專一而可逆的結合,這種結合力就稱為親和力。親和層析就是通過將具有親和力的兩個分子中一個固定在不溶性基質上,利用分子間親和力的特異性和可逆性,對另一個分子進行分離純化。被固定在基質上的分子稱為配體,配體和基質是共價結合的,構成親和層析的固定相,稱為親和吸附劑。親和層析時首先選擇與待分離的生物大分子有親和力物質作為配體,並將配體共價結合在適當的不溶性基質上。將製備的親和吸附劑裝柱平衡,當樣品溶液通過親和層析柱的時候,待分離的生物分子就與配體發生特異性的結合,從而留在固定相上;而其它雜質不能與配體結合,仍在流動相中,並隨洗脫液流出,這樣層析柱中就只有待分離的生物分子。通過適當的洗脫液將其從配體上洗脫下來,就得到了純化的待分離物質
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