真菌地鞭毛有尾鞭式和茸鞭式兩種類型. ①尾鞭型鞭毛:分基部和頂部兩部分,基部堅實而較長,頂部短而有彈性(頂部短而細軟). ②茸鞭型鞭毛:呈羽毛狀地結構,有一長軸,沿主軸兩側具短毛 裸藻:1-3根茸鞭型鞭毛硅藻:營養體不具鞭毛,精子具茸鞭型鞭毛。綠藻:只具尾鞭型鞭毛褐藻:雙鞭毛。向前伸出的為茸鞭型鞭毛,向後伸出的為尾鞭型鞭毛紅藻:既無茸鞭型鞭毛,又無尾鞭型鞭毛輪藻:只有尾鞭型鞭毛