家畜懷孕，倘若臨床用藥不慎，往往導致懷孕失敗，妊娠中斷。母畜懷孕後，五臟六腑發生一定的生理變化，對藥物的反應與未孕畜不盡相同，藥物動力學和藥物代謝也隨懷孕而改變。因此，對孕畜用藥不當，將導致死胎、流產、早產和怪胎等隱患。為了降低隱患，減少損失，提出孕畜用藥的一些基本原則。
1、孕畜患病需要用藥調治，一切從保胎原則出發，首先要考慮所用藥物對胎兒有無直接或間接的危害；其次要考慮所用的藥物對母體有無毒副作用。
2、懷孕期用藥要特別慎重，非用藥不可時，可選用不引起死胎和致發畸胎的藥物。
3、孕畜用藥劑量不宜過大，時間不宜過長，以免蓄積作用禍及胎兒。
4、孕畜慎用全麻藥、峻瀉藥、攻下藥、驅蟲藥。禁用有直接和間接影響性機能的藥物，如前列腺素、腎上腺皮質素、促腎上腺皮質激素、雌（雄）激素；又如縮宮藥物的催產素、垂體後葉素、麥角製劑、氨甲醯膽鹼、毛果芸香鹼，還有中草藥的桃仁、紅花、烏頭等。
5、母畜患病未愈前不宜輸精配種，以免影響受精率和早期胚胎髮育。
6、孕畜有病要醫，既要考慮對胎兒無害化用藥的必要，又要改變凡孕畜用藥都有害的觀點，只講胚胎安全而延誤孕畜治療是錯誤的。
