1900年1月2日，孫文、李金榜等人率領農民武裝百餘人執旗抬炮，前往築路工地拆毀德寇修路的窩鋪。1月12日，孫文、李金榜等人在張家大莊(今名毛家莊)聚眾3000餘人，襲擊晾甲埠一帶修路工地“公司”，放火燒毀德寇房屋。此間，他還率眾去芝蘭莊、姚哥莊築路工地，拔路標、拆窩鋪。山東省巡撫袁世凱得知後，馬上增派軍隊進行鎮壓，並懸賞緝殺孫文、孫成書、李金榜三人。
1900年初，這支以孫文為首的農民武裝襲擊德寇更加頻繁，參與鬥爭的民眾遍及柳溝河兩岸南自葛家集北至車輞的108個村。 2月1日夜，他率抗德民眾數百人， 襲擊華德鐵路公司南流分局。2月11日下午，數百名民眾又襲擊了德國鐵路公司魯家廟分局。4月8日，又有千餘民眾聚會於繩家莊，計畫再度拆窩鋪，並準備攻城。 1900年4月20日， 袁世凱派按察司胡景桂來高密坐鎮彈壓抗德民眾。胡曾以“入城和談”為餌，誘捕孫文等人。因孫文等洞悉其奸，不墜其計，仍活動於附近各村。5月3日，因叛徒出賣，他在繩家莊被捕。 7月2日，各村抗德農民3000餘人匯聚於五龍河畔，準備攻打縣城，救出孫文。胡景桂見民氣洶湧，勢不可遏，遂於當日在縣城東門外大石橋殺害孫文。
孫文被殺後，清政府不準收屍。老舉人單昭瑾不顧殺身之禍，前往撫屍慟哭，並作祭文。祭文寫道：“古之謂殺身成仁，捨生取義，一死而重於泰山者，先生其人也!”
