獲獎情況
獲得浙江省哲學社會科學優秀成果獎、2000年中國博士後學術大會優秀論文一等獎（參加者為中國設立博士後制度15年以來在站和已出站的所有博士後，人文社會經濟管理類學科一等獎優秀論文2篇是從1214篇論文中評出）、河北省第七屆哲學社會科學優秀成果獎、浙江省高校科研成果一等獎、1990-1992年度雲南省青年哲學社會科學優秀成果獎等多項獎勵。
學術成果
已在國內外學術刊物上公開發表論文一百二十餘篇（均為獨著）,在國內國際學術會議交流論文七十餘篇，在國內外學術界產生了較大的影響。
浙江大學教授孔令宏出版個人專著六部，分別是：《宋代理學與道家、道教》、《從道家到道教》、《宋明道教思想研究》、《朱熹哲學與道家道教》、《儒道關係視野中的朱熹哲學》、《中國道教史話》，這些著作出版後，出現了十餘篇書評，對它們給予了高度評價。合著著作七部，即《丹經之祖——張伯端傳》、《中國哲學史綱要》、《宇宙全息統一論與中國傳統文化》、《文化全息論》、《宇宙全息之迷》、《全息迷宮探奇—套用全息研究新進展》。主持或參與完成《中華道藏》等國家級課題、“宋明理學與道家道教”等教育部人文社會科學基金課題、“儒道關係視野中的宋明理學”等浙江省哲學社會科學規劃重點課題、“道家道教生態倫理思想與當代生態哲學”等浙江大學曙光計畫重點課題十餘項。獲得十餘項省部級獎勵，代表性的是：《朱熹哲學與道家、道教》獲得浙江省第十一屆哲學社會科學優秀成果著作類優秀獎；《儒道關係視野中的朱熹哲學》獲得浙江省高校哲學社會科學優秀成果一等獎；《道家、道教哲學思想與生態型可持續發展》獲得2000年中國博士後學術大會優秀論文一等獎，等等。
個人活動
曾經到美國、加拿大、瑞典、丹麥、挪威、芬蘭、法國、德國、比利時、荷蘭、義大利、奧地利等國家和香港、台灣等地區進行學術訪問，在哈佛大學等二十餘所世界著名大學進行三十餘次學術演講，多次在復旦大學、浙江大學等高校用英語為外國學者授課，籌辦並成功召開了高規格、高質量、有廣泛學術影響的首屆葛洪與中國文化國際學術研討會、天台山暨浙江區域道教國際學術研討會。
主要論文
1、《思想要與歷史吻合——評李約瑟的道家科技哲學觀》，《自然辯證法研究》1997年第4期，人大複印資料《科學技術哲學》97年第7期全文轉載。
2、《讀生命之書，證生命之道》，《華夏》1996年第3期。被《新華文摘》96年第9期全文轉載。
3、《張伯端對鍾呂內丹思想的繼承與發展》，《道韻》輯刊，第一輯，（台灣）中華大道出版，1997年。
4、《傳統文化與現代化的共時性存在》，《現代哲學》1997年第3期。人大複印資料《文化研究》97年第11期全文轉載。
5、《用西方理念能揭示中國古代科技的特質嗎？》，《大自然探索》1997年第4期。人大複印資料《科學技術哲學》98年第1期全文轉載。
6、《建設性的後現代主義與莊子思想》，《求是學刊》1998年第3期。《高校文科學報文摘》1998年第4期摘登。
7、《道家道教與宋明理學的關係研究述要》，《河北學刊》1998年第3期。人大複印資料《中國哲學》1998年第7期全文轉載。
8、《試論宋代禪宗與莊子思想的關係》，《河北學刊》1999年第2期。
9、《朱熹思想對道教的影響》，《孔子研究》2000年第5期。
10、《近百年來中國大陸道教思想史研究述要》（上、下），（台灣）《三清文化》2000年第4--5期。
11、《儒家思想與商業文化研討會簡介》，《哲學動態》1998年第1期。
12、《道家、道教思維方式與生態型可持續發展》，《學術研究》1998年第3期。被中國文明建設系列叢書編委會評為優秀論文，獲得三等獎，入編《奔向2000年》（第一輯）。入編《思維變革探索》，雲南民族出版社1998年出版。
13、《周敦頤〈太極圖〉與張伯端的關係》，《中華道學》1998年第1期（99年5月出版）。
14、《從傳統文化對王道政治的源屬性談李約瑟難題》，《大自然探索》1999年第2期。入編《李約瑟研究》第一輯，上海科學普及出版社2000年9月出版。
15、《從活動作用看歷史》，《福建論壇．文史哲版》1998年第1期。
16、《試論用技術社會學方法解答李約瑟難題》，《大自然探索》1998年第3期。
17、《道教思想史研究的現狀及課題》，見《中國思想史論集》第一輯，廣西師範大學出版社2000年5月出版。
18、《論〈易〉的信息衍生機制》，《船山學刊》1997年第2期。
19、《理論體系的比較和評價》，《雲南學術探索》，1997年第2期。
研究成果
宋明道教思想研究
其他,20060128,
宋明道教思想研究
未評等級,2006-03-31,
宋明道教思想研究
一等,20050628,
從道家到道教
二等,20050328,
宋明道教思想研究
不分獎勵類型一等,2005-08-30,
從道家到道教
著作獎二等,2005-03-24,
朱熹哲學與道家、道教
20031230,
儒道關係視野中的朱熹哲學
一等,20030900,
2002-2003年度浙江大學優秀本科生導師榮譽稱號
20030700,
朱熹哲學與道家道教
其他,2003-11-01,
儒道關係視野中的朱喜哲學
一等,2002-06-01,
道家、道教哲學思想與生態型可持續發展
一等,20001020,
中國道教史話
三等,20001001,
