神話傳說
十六年後，隨著一顆划過天際、象徵亂世之兆的神秘妖星“赤貫”的出現。尚未弱冠的陳靖仇踏上了他尋找上古神器、對抗隋朝的孤獨旅程。我們的故事就從這裡開始了，時間是《軒轅劍3》的一百三十三年前。。。
一日，陳國後裔陳靖仇及其師父一同來到伏魔山上為尋找上古神器之一的崑崙鏡，在山洞找到古鏡之後，靖仇向師父問起父親之事，於是師父向靖仇緩緩道來。原來十六年前，靖仇的師父和父親在江南召集陳國的舊臣，意圖復興陳國。當時的隋文帝便派遣了曾經滅陳國的楊素前來迎戰，而令人驚訝的是楊素卻只帶了區區的二十騎前來，那一仗由於一個擁有“陰陽妖瞳”的楊拓，而使得陳國大軍一敗塗地。也正是靖仇的師父為何要苦練鬼谷道術的原因了。師父還告訴靖仇，現在楊素已死，可楊拓還活著，並讓靖仇好好的修習鬼谷之術，將來復興陳國的重擔就靠靖仇了。說完便讓靖仇去拿崑崙古鏡，靖仇剛想拿，忽然出現一頭魔獸，可憐師父為救靖仇吐出冰絲將自己和魔獸封在洞中。一個時辰後，靖仇醒來後，師父便交待讓他去雷夏澤找自己的師兄公山先生前來救自己。回到伏魔山腳下，靖仇決心一定要找到公山先生前來救師父，並喚出師父給的符鬼。前途茫茫，靖仇一人就這樣上路了。
往東北走來到月河村。從張老伯口中得知雷夏澤應該往北走，誰知守橋的人告訴靖仇這幾天在舉行“河神祭”而不讓通過，無奈之下，靖仇只能先找家客棧落腳再說。在客棧的門口還有個乞丐。好心的靖仇幫他從井裡打了15碗水，乞丐也給了靖仇一點金瘡藥。在客棧問過賀老闆後，靖仇覺得只能在這裡住兩天了，在上樓時還遇見了天生白髮的賀小雪。睡過一晚後，早上起來就聽見房客說村裡的人在討論抽籤的事，於是靖仇出客棧到了村里。來到大夫的家中一打聽，原來月河村每年會選一個女子來獻給河神，而這次真好抽中了大夫的女兒，於是靖仇暗暗打算搭救這個女子。回到客棧中，從賀老闆口中得知那個白髮的賀小雪自願以自己一命來救大夫的女兒，靖仇聽到後非常氣憤，打算到祭神那天去阻止。又睡了一晚後，一大早靖仇就出門了，在村南面找到了賀小雪的弟弟小朔，小朔告訴他小雪被關在月河河洞中，於是靖仇向河洞出發了。往南穿過樹林通過洞中的迷宮後，在洞的盡頭看見村人將小雪推下了河神洞中，靖仇阻止不及，也一同跳了下去。這時一條閃光打來，靖仇仔細一看，原來河神是條蛟精。費盡九牛二虎之力將它打跑之後，和小雪的對話中得知她也有可憐的身世。接著就是找出洞的路了，一直往左走就出洞了。回到月河村時卻看到村民都已經死了，原來那個蛟精並沒有死，逃出來後在村里進行報復，小朔和賀老伯都已被他害死了。靖仇怒不可竭，衝上去經過一番搏鬥，終於將蛟精消滅了。但是憤怒的村民卻竭力將靖仇賀小雪趕出了村外，看到小雪孤苦無依，靖仇就決定帶小雪一起去找師伯，將來讓她也有一個安身之處。於是兩人向西北方的雷夏澤走去。
來到雷夏澤後，發現師伯已經傷病在床多時，一時也無能力解救師父。為讓師伯的病好起來，靖仇聽從了師伯夫人的意見，打算找到神農鼎。但師伯夫人說神鼎可能在法術高強的宇文太師手中，只能先到北方的鮮卑拓撥部落看看。
往北方先到黑山鎮，卻聽得路人說北面有人的抓人辦什麼會。靖仇他們也走累了，於是走到酒樓里想吃點什麼，剛坐下，就聽得門外有人在大聲的嚷嚷。走出去一看，原來是一夥軍人為宮中的郡主強搶男童，說什麼要將男童血喝後從此養顏不老。路見不平，靖仇剛想出手，卻見一個胡人女孩先一步感到。打跑一些小兵後，那個軍官忽然變成了邪屍骷髏，打暈了胡人女孩。這時靖仇出手相救，一番打鬥之後，終於將骷髏打死。靖仇接著去扶那個女孩，但那女孩卻不領情，幸好她的姐夫即時趕來。一陣感謝後，女孩的姐夫在酒店設下酒席款待靖仇。原來此人名叫張烈，是拓撥族人拓撥月兒的丈夫，他還告訴靖仇神農鼎可能已經被朝廷得到。正在吃飯之際，忽然張烈的族人匆匆走來，告訴張烈又發現有隋朝的妖魔軍隊跟蹤他們，靖仇自告奮勇要求幫助張烈他們，於是三人向東面的樹林走去。走到樹林的深處，便看見一群小孩被綁在那裡。經過兩次激烈的戰鬥後，靖仇他們終於救出了孩子。
之後，靖仇跟隨張烈來到他們族人的集聚地大雁嶺，順便也探聽一下神農鼎下落的蛛絲馬跡。但卻沒有什麼收穫，此時張烈也派出探子幫助打聽神農鼎的下落。六天之後，張烈已經打聽到神鼎的下落，原來確實在宇文太師手中，並且他把神鼎藏在北方涿郡的一個碉堡里。由於他偷藏神鼎被皇帝知道了，於是只能將神鼎運往東都，而此行的路線已經被張烈的探子所探到。正說道這裡，拓撥月兒突然跑了進來，說玉兒不辭而別去找神鼎了，張烈又氣又急，與靖仇一起往運鼎路線趕去。
在盧家渡，靖仇發現所有的船都被韓公公包走運美女了，再和張烈、小雪商量過後，大家都認為玉兒會在船上，於是幾人想辦法混上船。此時韓公公正好帶著征來的美女上船，靖仇靈機一動，打算讓自己扮女人讓張烈扮軍官，正大光明的混上船去。先向小雪問問應該怎么扮女人，小雪告訴他首先要找到胭脂、衣裳和簪子。在左邊岸上找到胭脂，在右邊的房間裡，只要給那個小女孩一雙靴子就能得到簪子(皮靴可向賣雜貨的人買)，在上面左邊的房間裡，給那個婆婆手鐲和鐵戒指就能得到衣裳了。好了，東西齊了，靖仇來到客棧和張烈會合。瞞過守船的士兵，到達第二倉內，卻沒有玉兒的蹤影。三人打算再到船底層看看。到達底層後，不料被韓公公發現了，既然發現了，靖仇他們就打算劫船，直接開走。一路往甲板走去，打敗守衛後，善良的靖仇又回去把那些女子放了。誰知回到甲板上後，韓公公已帶著官兵來了，一場戰鬥後，從韓公公口中得知神鼎已運往龍舟了。
幾天航行後，靖仇他們來到了大梁。從城南的徐老頭那裡得知神鼎已經被皇上運到龍舟上去了。經過商議後，他們打算先想辦法溜到龍舟上再說。於是一行人先來到了碼頭。可是碼頭上有官兵守衛，怎么過去呢？靖仇仔細想過後，打算利用官兵轉身的瞬間溜過去。騙過守衛後，三人來到龍舟隊伍中，可是有好多龍舟啊，靖仇只能慢慢的找。在龍舟上可也是不能被官兵看到的喔。好不容易騙過了守衛，在一間屋子裡找到了神農鼎，誰知仔細一看原來是假的。這時正好走來一個太監，經過一番拷問，原來真的神鼎已經被一個手拿宣花大斧，身騎黃驃馬的響馬搶走了。而太監生怕皇帝責怪，假造了一個鼎。善良的靖仇將太監放了後，他卻在門外大喊大叫引來了官兵。靖仇只能另找出路，從房間地下通過後，一路往上走。走到與前一條船相同的地方，地下會有一個迷宮，出口大致在西北方。再從樑柱爬上去，經過七繞八繞的最後到了一塊田字形的樑柱邊，在右邊最中間那根，靖仇發現了一個奇怪的地方，原來這裡可以看見龍舟大廳。過了一會兒，又看見月兒裝扮的宮女前來刺殺無道昏君楊廣。正要成功時，宇文太師趕來阻止了拓撥玉兒，幸好靖仇及時用鬼谷之術施放煙霧而得以逃脫，在眾多的追兵下，靖仇幾人只能跳水而逃。在另一邊，楊廣讓宇文太師去捉拿靖仇他們，並要他保護好要求同去的寧珂郡主。
在河邊的破草屋中，昏迷的靖仇和玉兒相繼醒來。靖仇打算繼續尋找神鼎，而張烈要回拓撥部落主持大局。而玉兒硬要留下來和靖仇一起去尋找神鼎的下落。
三人向北來到豆子坑，村里左邊的村民告訴靖仇確實是魔王岩的混世魔王把神鼎搶到山上去了。在上山前，靖仇他們來到酒店打算先填飽肚子再說。正吃著的時候，外面傳來一陣呵斥聲。出門一看，原來是一群士兵把運貨商人當作土匪，正要抓他們。路見不平，玉兒怎么會答應。一出手便將那個軍官打敗，而隨靖仇一起出來的兩個巨漢也將另外的士兵擺平了。彼此寒暄一陣後，原來這兩人竟是程咬金和秦叔寶，說完兩人就走了。三人怕隋朝大軍馬上會來，所以向魔王岩趕去。來到魔王岩後，這裡有嘍羅守著，為了不打草驚蛇，靖仇來到水塘邊打算潛水進去，可是玉兒不會游泳，還是小雪聰明，想出了用竹管子的方法，三人正要回村子找竹管子，忽然看見村裡的農夫在往寨中送糧，於是決定下山去扮作送糧的混進寨中。回到村中後，正好遇見一群小孩，而且他們手上正好有竹管，但小孩提出玩捉貓貓的遊戲，只要靖仇贏了，就把竹管給他(大多數的小孩都躲在山岩底下)。在找他們的時候還找到了寶物靈界指標和蟾涿香袋。再和最左邊的村人說話，原來香袋是他掉的，他還答應送靖仇偷偷進魔王岩。
這下進魔王岩有兩種辦法了。雖然方法不同，但進去之後靖仇都會遇見一個很大的迷宮，裡面可以得到青鋼劍和暗殺寶錄。在迷宮的盡頭，靖仇他們遇見了程咬金。原來程咬金就是魔王岩的大王，於是玉兒向程咬金索要神鼎，傻頭傻腦的程咬金卻不給，快要打起來的時候，嘍羅忽然來報官兵來搶神鼎了，傻老程還以為這是靖仇他們的聲東擊西之計呢。來搶神鼎的就是宇文太師，無奈他法力高強，靖仇只能眼睜睜的看著神鼎被拿走。誤會的程咬金竟然還與靖仇他們打了一架，幸好秦叔寶看破這是宇文太師的詭計。靖仇答應程咬金在十五天之內一定找到神鼎回來還一個清白。往下就出了寨子，回到村中。出村向東走到了東萊，已經過了六天了，可是一點訊息也沒有。再出東萊走到泰山上面的樹林那裡遇見了受傷的齊二郎，送他回東萊後，從他的娘子打聽到有一群士兵駐紮在了泰山，還在泰山上設立了奇怪的祭壇。於是靖仇他們馬上趕往泰山。打敗山腳下的士兵，三人衝到山頂，但山頂上空無一人。正好這時聽到有說話聲，三人就偷偷躲了起來。原來是宇文太師手下的楊碩和韓騰，他們竟然殺死了東萊城六萬條人命去煉血丹。打敗他後，他說出了事情的經過後便咬舌自盡了。靖仇在他的身上找到了一張地圖和一封信。從信里得知，宇文太師好像確實沒有得到神鼎，無奈之下，靖仇他們只能按照信上所說的再到大梁走一趟。
首先來到渡口，卻發現一條船停在那裡，十分可疑。靖仇看看時間無多了，也不管了，徑直向船上殺去。往裡走遇見一個隋軍隊長，原來他是一條鯉魚精，打敗他後(它會有三個化身，只有真身會受傷，打的時候要注意一點)，忽然寧珂郡主走了出來，告訴靖仇她實在不滿皇帝生靈塗炭，還說神鼎就在船上最底層，讓靖仇他們跟她下去拿。走到樓梯口，玉兒覺得這是一個陷阱，最後決定讓靖仇一個人先下去看看再說。靖仇下去後，寧珂見他一人前來，硬是又上去將小雪和玉兒拉了下來。在第二個房間裡果然找到了神鼎，靖仇在用煉妖壺收鼎的時候，正好給寧珂看見。回到碼頭上以後，寧珂另外找了只船走了，臨走的時候還送給小雪一根鈴鐺髮簪。在還神鼎以前，靖仇想先把為師伯治病的藥煉好，可是一看藥方靖仇的頭又大了，上面寫著各種怪藥，也不知道是什麼。和玉兒商量以後，打算先到大梁的藥鋪先看看。
大梁的藥店果然有這些藥，只是獨缺一種鵁肉的藥，需要到西北的山洞打這種鳥。在西北的山洞打好鳥後回到船上，煉好治師伯的藥後，靖仇就趕去魔王岩。見到程咬金才知道他已經歸順張須陀帳下，為拿神鼎三人與程咬金、秦叔寶再次戰鬥。打敗他們後三人帶著神鼎準備下山，靖仇打算先回雷夏澤為師伯治病，可玉兒硬要報答上次的救命之恩，要跟靖仇一起去，靖仇答應後，三人向雷夏澤趕去。
回到雷夏澤後，卻只看見垂釣老人，打聽之下知道師伯已經病故，想了一下後，靖仇決定回到大梁去找師伯母。乘船來到大梁後，在街上遇見師伯母的孫女，在她的帶領下來到師伯母家中。從師伯的遺書上得知要對付魔獸還有一人，就是傳說中的東海仙人。但是現有的船並不能出海，經師伯母介紹知道大梁城中有一趙姓工匠會造海船。去到隔壁的房間讓趙工匠造船。三日後，大船造好，三人向東海進發了。誰知在海上遇見了一條大魚，將船裝翻，三人也被水吹到了一個島上。在島上兜了幾圈後，遇到了氐人族的兩個人，經過一番遭遇戰後，出來一位氐人族女王。原來這裡竟是那條大魚的肚子裡，那條大魚也是上古神獸，名為巨海。說完後女王邀請三人去皇宮說話。(裡面的一間房間裡有遁形浮沙)與女王交談後，靖仇答應幫她一起對付黑龍王。坐著鯨魚向黑龍王處游去。走到龍宮的盡頭就看見黑龍王了。靖仇三人全力向黑龍王殺去。打敗他後，他卻用計讓玉兒拿下了崆峒印，使得氐人族的人都一下子變老了。雖然錯誤已經不能彌補，但玉兒還是和靖仇一起回到氐人族的王宮向女王道歉。玉兒為了表達對大家的歉意，毀了自己的容貌。幾天后，女王為此也非常後悔，表示要送靖仇他們去仙人島以緩和一下自己內疚的心情。
到了仙山島後，經過幾天的趕路，玉兒和靖仇的感情越來越好了。一天，玉兒又發高燒了，還好靖仇知道治病的藥方。於是和小雪一起來到百草澗。找回來後熬好藥，但玉兒吃了並沒好。於是靖仇拿出神農鼎，又去采了一次藥，回來弄好還是不見玉兒好轉，這時小雪將自己的肉割了下來一起熬，過了兩個時辰，玉兒終於醒了過來。第二天，三人繼續趕路，走過百草澗就看見兩個仙人在下棋，但和他們說話卻不理。靖仇一連等了三天，那老翁總算下完了。聽過靖仇的請求後，他讓靖仇他們先到天外村然翁居休息休息。到瞭然翁居，兩個仙人已經在那裡了，但不管靖仇怎么懇求，那個古月仙人就是不肯救靖仇的師父。他還告訴靖仇玉兒會有生命的危險，讓他明天去東皇嶺去采百年地捻草。睡到半夜，玉兒忽然不行了，靖仇割下自己的肉熬藥也不管用，只得去找老仙人求救。另一邊，小雪去求古月仙人救救玉兒，正在說話時，老仙人帶著奄奄一息的靖仇來。原來靖仇為采百年地捻草而失足落下了山崖。古月仙人終於被感動了，答應救靖仇和玉兒。第二天清晨，已經大好的靖仇來到院子裡，古月仙人告訴他要救玉兒還要去西母峰找到血露蟠桃才行，並給了兩人消除西母峰迷霧的火雲珠。於是靖仇火小雪向西母峰走去。從西母峰一直往上走就可以看見血露蟠桃樹了，小雪正要摘桃，突然出現了桃樹的守護刑天，一場打鬥在所難免。可是他太厲害了，靖仇和小雪不是對手，無奈只能讓刑天斬手。剛要斬下，忽然刑天變成了老仙人。原來這只是仙人為考驗他們而變幻出的幻影。因為靖仇和小雪都互相想著對方，所以通過了這場考驗。回到然翁居後，古月仙人終於將玉兒治好了。
三天后，古月仙人終於答應去搭救靖仇的師父了。但是先要去拿到仙山島之西的盤古巨斧，而且還有盤古巨神在守護著。古月仙人還給了靖仇一個七角海笛，可以召喚到以前仙人的坐騎。到大地圖可以看見西面有棵大樹，往北走到一塊尖尖的地圖角上就可以召喚到坐騎了。到了海中建木後，一直往左走就會來到盤古神前。幫盤古“搔搔癢”後拿到盤古巨斧。回來後古月仙人讓靖仇先睡一覺。第二天，老仙人運用御劍之術飛向伏魔山。由於有古月仙人的幫助，靖仇順利的救出了師父。眾人一起回到了仙人島。在感謝老仙人的時候，才知他原來就是氐人族所說的劍俠，老仙人還答應幫氐人族重新結界。於是靖仇三人先向氐人族出發了。坐原來古月仙人的坐騎到東北海面，會看見一條大魚影子，上面就是氐人族的地方了。來到王宮見過女王后，知道結界需要的道具崆峒印已經被宇文太師給奪走了。於是靖仇他們馬上趕回老仙人處。和老仙人交談後才知道用五樣上古神器合起來會是失卻之陣，和做皇帝並沒有什麼關係。為了保險期間，靖仇想讓老仙人幫自己保存神農鼎和崑崙鏡。正要給他，忽然靖仇的師父走了出來，堅決不同意將神器交入外人之手，和老仙人爭了幾句後，一氣之下走了出去。靖仇擔心師父的安危而追了出去。來到莫支灘向一個人打聽到師父，那人告訴靖仇有一個人去了大蘑菇的地方(就是對弈亭)。來到對弈亭，師父果然在這裡，他讓靖仇和玉兒劃清界限，還說要先找到五樣神器。回到然翁居後向老仙人告別，他還送了盤古巨斧給靖仇，讓他能在仙界和人界來往。
走到南面的大禹傳送點(那個一亮一亮的就是)，傳送到人界後靖仇來到江都。聽這裡的老百姓說會稽郡的村民一下全都死光了，和上次東萊城一模一樣。回到客棧告訴師父後，靖仇提出想去會稽郡看看，但師父卻又大發雷霆。為等他氣消，靖仇在江都先逛逛。在橋上遇見四百年的白鹿精，從他口中打聽到伏羲琴在敦煌，崆峒印在長沙，而女媧石不知在哪。他還提到一個叫葉羅什的人到處在降妖伏魔。靖仇打算先到長沙找印，白鹿告訴他要去長沙要通過大禹水道，而只有西邊杏山茅屋的喬岱娘能驅除水道中的藤蔓。回去和師父說了一聲後靖仇就出發了。先到西面的杏山找喬岱娘，她二話沒說就答應幫靖仇的忙，不過她讓靖仇幫她去長沙帶瓊花種子來。從大禹水道來到長沙，先去種子店買瓊花種子。買好後小雪說看見了獨孤郡主在城裡，找到獨孤郡主後，她說了許多關於神器和宇文太師的事情，並打算和靖仇裡應外合去西北的兵營搶回崆峒印。第二日，靖仇來到兵營和宇文太師手下二虎將交手(第一仗必敗)，打敗他們之後，上官震遠從秘道逃走，但卻被郡主殺死。靖仇得到崆峒印後打算再找伏羲琴，郡主告訴他要去敦煌石窟先要經過大興(長安城)。於是靖仇先回江都接師父。
往北過關卡後，就到了大興。先去見郡王，獨孤郡王府就在皇宮的左面。由於郡王的熱情，靖仇他們就在郡王府住了下來。這一日，師父讓靖仇去打探一下餘下神器的訊息，於是靖仇在城裡逛了起來(城裡的西市有很多好東西喔)。逛著逛著來到了宇文太師府，遇到涪陵的劉元，原來涪陵郡也已經被宇文太師所毀滅。從劉元給的地圖和信來看，相信宇文太師下一個目標就是長沙。回到郡王府和師父商議後就向長沙出發了。來到長沙上面的隋軍大營，可惜還是晚了一步，宇文太師的血祭已經完成。眾人怒不可竭向宇文太師打去。可靖仇還不是他的對手，連師父也被他打傷了，他還讓靖仇在三日之內將神農鼎和崆峒印交給他。無奈之下，靖仇打算先找老仙人和古月仙人幫忙。通過江都邊的仙界傳送點來到仙界。可是仙人一個都不在，沒有辦法，靖仇只能帶著神器回到隋軍大營見宇文太師。在無奈之下將鼎和印交給宇文太師換回師父，回到江都，因為師父受傷較重，所以靖仇讓師父在這修養，而自己趕往大興的郡主府向郡主道歉。到大興郡王府向獨孤郡主道歉後，她告訴靖仇真正的女媧石是在蜀郡的巴蜀古王墓里，還給了長壽關的令牌。
在大興的西南面就是長壽關，過關西南面就是巴蜀古王墓了。通過了迷宮、打敗斛律安後拿到了女媧石，但那個奸詐的斛律安臨死又將女媧石奪走了。另一邊，宇文太師受到了斛律安死前傳來的女媧石，但他一看便知又是假的，於是打算親自去敦煌找伏羲琴，原來他竟是崑崙鏡轉世之人。在古墓中的靖仇覺得既然神器已失，只能先回大興。回到郡王府後，師父已經到了，衝著靖仇大發脾氣，這時小雪的身體又有點不舒服，於是靖仇再到城裡去找大夫。在利人市找到宋大夫後回到郡王府，診斷好小雪。獨孤郡主又告訴靖仇宇文太師去了敦煌，而把崆峒印、神農鼎和女媧石放在了皇家財寶室。從郡主的秘道中找到藏寶室並拿回三件神器。回到郡王府，師父非常高興，而小雪卻怪怪的說宇文太師做的事情是對的，靖仇正在妨礙他。第二天，玉兒突然跑來說小雪不見了，到小雪房間裡看見只有女媧石，郡主認為小雪拿了另外兩個神器投靠宇文太師去了，並讓靖仇去玄武門和大興城門問問守衛是否見過小雪。靖仇問過兩個城門的守衛後他們都說沒有看見。回到郡主府後，郡主的丫鬟來說宇文太師已經拿到伏羲琴了，而且小雪也拿了鼎和印去投靠他了，郡主還告訴靖仇，他們手上的崑崙鏡和女媧石都是假的，說完便氣乎乎的走了。玉兒建議靖仇一起先去太師府去看看，到太師府知道宇文太師下一個要在靈武祭血靈丹，於是靖仇和玉兒趕往靈武。出長壽關往北走，通過萌霞關再往北走過一片流沙地就是靈武了。在靈武並沒有見到宇文太師，於是靖仇又出城往西北方的隋軍大營趕去，到後正看見韓騰開始血祭，馬上阻攔，打敗他後小雪忽然出現，還手持軒轅劍保護血祭順利進行。靖仇眼睜睜的看著血祭成功卻沒有辦法。
回到大興郡主府，靖仇經過此事後已經覺得心灰意冷了，不想再和宇文太師這樣的斗下去了。深夜，玉兒一人正在彈琴，獨孤郡主走來向玉兒說了小雪為何要走的原因，出於內疚玉兒打算夜探太師府找小雪回來。通過郡主安排的秘道玉兒來到太師府，在太師府見到了小雪，她把整個事件源源本本的告訴了玉兒，原來宇文太師做的才是對的。拿著小雪口述的信件回到門口。見到郡主後，玉兒將所有的事情全都告訴了她，正要回去，突然郡主對玉兒痛下殺手，原來真正的大惡人是她。奪走小雪的信後又將玉兒打成重傷，然後還用計將靖仇騙來，靖仇不知是計，誤認為殺死玉兒的就是小雪。為救治玉兒靖仇來到仙山島，可是老仙人和古月仙人都不在，等老仙人的孫女將仙人找來時，玉兒已經香消玉殞了。三天后，靖仇來到對弈亭見古月仙人，把事情經過說給他聽後，他認為宇文太師已經無人能敵了，勸靖仇死了這條心，還說在天界有一伏羲神殿中有天女白玉輪可就玉兒的性命。回到然亭居後將玉兒的水晶棺帶上，在對弈亭告別仙人後回到大興郡主府。心灰意懶的靖仇向郡主告別，打算帶著玉兒的遺體回北方，而靖仇的師父也原諒了他，同意從此不再提復國的事了。
離開郡主府，出玄武門。半夜時分靖仇遇見了李世民，他向靖仇出了一個好主意後並約定在太原城相見。來到太原府正好看見張烈也在這裡，他告訴靖仇有對付宇文太師的辦法，並給了過雲崗石窟的汰玉如來給靖仇。太原的西面就是石窟了。在石窟的一間房裡把汰玉如來放在桌上會出來一條天梯。通過天梯靖仇來到通天塔，但是塔門已經被結界所封住，要用泛雲龍玉才行。三人來到洛陽，在客棧樓上看見郡主，她說要幫忙找李靖。在城門口找到李靖，眾人來到張烈的家，張烈交待了一下後便和靖仇一起向通天塔走去。從塔底走到塔中會遇見韓騰，打敗他後到達塔頂見到宇文太師，可是靖仇還不是他的對手。郡主這時也趕來了，並挾持了小雪。靖仇正當宇文太師分神之際，將他打傷，但自己也被宇文太師的力量所震暈。郡主在此時突然露出她的真面目，原來她竟是撒旦手下的魔將。
幾天后靖仇醒來，小雪將事情都告訴了靖仇。於是靖仇打算先到仙人島去找老仙人想想辦法。在然翁居找到老仙人，他說自己也無能為力，要靖仇再去找古月仙人問問。到莫支灘找到他，他讓靖仇先去找宇文太師和神器。
之後靖仇來到驚魂塔與蟄魂塔，一路走上去打敗女魔頭奪回崆峒印和神農鼎後，馬上又去通天塔救宇文拓，在塔外會遇到程咬金和秦叔寶。來到通天塔，但通天塔入口被結界封住，於是再回仙人島請老仙人想辦法，程咬金和秦叔寶也先回營部。在島上古月仙人答應和靖仇一起去通天塔。在通天塔古月仙人將結界打開後便分成三路前進，靖仇去救宇文拓，古月仙人直接至塔頂布陣，餘下的人去找伏羲琴。靖仇找到宇文拓後，郡主也出現並露出真面目和主角們打起來，擊敗郡主救了宇文拓後繼續往塔頂前進。到了塔頂，古月仙人叫宇文拓站在中間圓圈，小雪和其它神器放在六角的圓圈，經過儀式，一行人被傳送至虛空之門。
通過次元交錯空間來到了伏羲神殿，靖仇發現了天女白玉輪之陣，於是想將玉兒救活，但是這就需要用到伏羲琴和女媧石，為了阻止赤貫，無奈靖仇只能放棄，走到赤貫星內將兩道光柱關閉，陣的傳送點開啟，到布陣地方後，便開始布陣將天之痕封印，古月仙人告訴靖仇一旦封印，玉兒將從此在靖仇腦中消失。正當儀式要開始時，郡主闖入，將郡主打敗後但是又發現有人在破壞赤貫星中樞，查看之後發現竟然是師父，而他吃下撒旦魔果後，整個人便非常瘋狂，靖仇無奈只得和師父決戰。戰勝後，宇文太師和古月仙人也將天之痕修補完畢，靖仇再向他們說明事情經過後，古月仙人將一行人帶回去。通天塔終於毀了，我們的故事也將告一段落了，靖仇和小雪究竟怎么樣了，還是留待各位自己來體驗吧！
若是玉兒的好感度高於小雪,在伏羲神殿時，古月仙人會在小雪的懇求下讓玉兒復活，而小雪因耗費真氣過多，身體十分虛弱。到布陣地方後，大家開始布陣將天之痕封印，正當儀式要開始時，郡主闖入，將郡主打敗後但是又發現有人在破壞赤貫星中樞，查看之後發現竟然是師父，而他吃下撒旦魔果後，整個人便非常瘋狂，靖仇無奈只得和師父決戰。打敗魔化後的陳輔，靖仇心中悲痛莫名，但他仍打起精神，封印天之痕。在如夢似幻的空間中，靖仇看到自己的師傅，卻什麽也記不得。而小雪在用盡所有力量之後，化為女媧石，她在向靖仇道別時，說出了心中的話：和靖仇與玉兒一起旅行的那段時光，是她生命中最快樂的。
