大豆脂肪氧化酶在生長發育中作用
已有的研究表明大豆脂肪氧化酶同功酶隨植株發育而產生較大變化，在幼嫩快速生長的組織中通常都表現出很高的酶活性，且在某些發育階段中會產生新的大豆脂肪氧化酶同功酶。這促使相當一部分研究者認為大豆脂肪氧化酶在植物組織的生長和 (或 )發育中起某種作用。 有些研究者認為大豆脂肪氧化酶在萌發種子中的高活性加速了細胞膜的瓦解，從而有利於貯藏的營養物質向正在發育的胚中轉移。 另一方面研究認為脂肪氧化酶在種子萌發的早期階段可能參與調節或觸發細胞內各種各樣的過程，而不是主要參與不飽和脂肪酸的呼吸作用或活動化作用；他們同時認為細胞中的脂肪氧化酶是在貯藏組織中的貯藏物開始活動化作用和某些組織中葉綠體開始生物合成時才發揮功能。研究者認為在正在發育的芽尖中大豆脂肪氧化酶可能起到作為胺基酸暫時貯藏場所的重要作用。但大豆脂肪氧化酶在生長發育中的作用還遠不清楚，尚須深入研究 。
在傷害反應和抗有害生物中的作用
大豆葉片中，總有脂肪氧化酶存在但與反應底物是分開的，直到受到傷害或產生組織損傷，脂肪氧化酶方能與底物產生接觸。認為脂肪氧化酶在傷害反應和抗有害生物中起作用是緣於研究發現植物組織受到傷害後，脂肪氧化酶蛋白質及其活性會急劇增加，並會形成新的脂肪氧化酶同功酶。大豆脂肪氧化酶的直接抗性反應就是催化亞麻酸和亞油酸氧化生成脂質過氧羥自由基和一些次級氧化產物，這些物質對有害生物是有毒性的，許多研究表明脂肪氧化酶催化產物如己醛等對植物病原物有著不利的影響，研究證實氫過氧化物和己醛對害蟲有驅除作用。 同樣許多研究者也指出受到傷害後的初期階段，抗性品種比易感品種脂肪氧化酶的活性要大得多 。
大豆脂肪氧化酶酶活性變化
分光光度法對大豆中三種脂肪氧化酶(同工酶)進行檢測並測定脂肪氧化酶活性，研究表明：大豆粉碎後隨著貯存時間的延長，脂肪氧化酶活性逐漸降低，大豆發芽後脂肪氧化酶活性降低了43%。
現日本等國已選育出大豆種子單缺失、雙缺失和三缺失品系，可為大豆加工提供優質原料。利用大豆脂肪氧化酶的氧化作用，能對麵粉進行漂白，研究開發天然安全麵粉漂白劑。因此無論是大豆品種選育，還是在大豆產品加工利用、深度開發等方面，進行大豆脂肪氧化酶活性測定以及變化規律分析研究具有重要的意義 。
