主要職能
大理白族自治州畜牧獸醫局主要職能：（一）大理白族自治州畜牧獸醫局認真貫徹執行有關畜牧業的法律法規。
（二）大理白族自治州畜牧獸醫局研究制定本地區發展畜牧業的政策措施。
（三）大理白族自治州畜牧獸醫局編制本地區畜牧業發展中長期規劃及年度計畫，並組織實施。
（四）大理白族自治州畜牧獸醫局負責本地區畜牧科技的推廣普及工作。
（五）大理白族自治州畜牧獸醫局負責本地區的飼料管理、種畜禽管理、遺傳資源保護、天然草場保護工作。
（六）大理白族自治州畜牧獸醫局認真貫徹執行國家動物衛生的有關法律法規、方針政策、規劃計畫。
（七）大理白族自治州畜牧獸醫局擬定全州重大動物疫病防治規劃和計畫。
（八）大理白族自治州畜牧獸醫局監督和管理動物防疫、檢疫工作。
（九）大理白族自治州畜牧獸醫局負責獸醫醫政、獸藥藥政、動物產品和獸藥安全管理工作。
（十）大理白族自治州畜牧獸醫局完成州委、州政府及上級業務部門交辦的工作。
（十一）大理白族自治州畜牧獸醫局建立重大動物疫病應急機制。
內設機構
根據上述職責，大理白族自治州畜牧獸醫局內設5個副科級職能科室：（一）大理白族自治州畜牧獸醫局辦公室
負責局機關檔案收發、傳遞、督辦、印章管理、檔案管理、信息收集整理工作。負責局機關後勤服務、車輛調派、辦公用品配發等日常管理工作。負責黨組織、工會組織、共青團組織的建設、精神文明建設、計畫生育等日常管理工作。負責行政事業經費預、決算的編制，事業經費、專項經費的開支、結算、報銷。負責上級下達的基本建設項目的財務管理、驗收等工作。負責國有資產監管、固定資產管理、採購等工作。
（二）大理白族自治州畜牧獸醫局人事教育法規科
主要負責畜牧獸醫有關政策、法規的宣傳，貫徹實施國家有關畜牧業及動物衛生的法律法規、方針政策、規劃計畫。負責組織開展畜牧獸醫行政執法。負責開展思想政治工作、黨員教育、職工培訓、法制宣傳教育、內部刊物和網際網路站信息編輯工作。負責中層領導幹部任前考察、競聘上崗、業績考核和年終述職工作。負責人事調配、勞動工資管理等工作。
（三）大理白族自治州畜牧獸醫局防疫科（加掛大理州重大動物疫病防治指揮部辦公室牌子）
負責擬定全州重大動物疫病防治規劃和計畫，做好轄區內重大動物疫情的監控、控測、信息上報等工作，監督和管理動物防疫、檢疫工作。
（四）大理白族自治州畜牧獸醫局畜牧科（加掛大理州乳業辦公室牌子）
主要負責研究制定本地區發展畜牧業的政策措施。編制本地區畜牧業發展中長期規劃及年度計畫，並組織實施。負責本地區畜牧科技的推廣普及工作。負責本地區的飼料管理、種畜禽管理、遺傳資源保護、天然草場保護工作。負責畜牧科技培訓、宣傳、推廣等工作。
（五）大理白族自治州畜牧獸醫局獸醫科
負責獸醫醫政、獸藥藥政、動物產品和獸藥安全管理工作。
