國家理科基礎科學研究和教學人才培養基地的專業點的分布如下：
數學專業12個點，分布在北京大學、北京師範大學、南開大學、吉林大學、復旦大學、華東師範大學、蘇州大學、浙江大學、中國科學技術大學、山東大學、武漢大學、四川大學。
物理學專業14個點，分布在北京大學、清華大學、北京師範大學、南開大學、山西大學、吉林大學、復旦大學、南京大學、中國科學技術大學、山東大學、華中師範大學、中山大學、西北大學、蘭州大學。
化學專業14個點，分布在北京大學、中國農業大學、南開大學、吉林大學、復旦大學、南京大學、浙江大學、廈門大學、福州大學、鄭州大學、武漢大學、中山大學、西北大學、蘭州大學。
生物學專業19個點，分布在北京大學、清華大學、中國農業大學、北京林業大學、北京師範大學、東北師範大學、內蒙古大學、復旦大學、南京大學、南京師範大學、浙江大學、廈門大學、武漢大學、華中農業大學、中山大學、四川大學、西北大學，雲南大學、陝西師範大學、蘭州大學。
地理學專業5個點，分布在北京大學、北京師範大學、華東師範大學、南京大學、蘭州大學、福建師範大學。
地質學專業4個點，分布在北京大學、南京大學、中國地質大學、西北大學。
大氣科學專業1個點，設在北京大學。
海洋科學專業2個點，設在中國海洋大學、廈門大學。
天文學專業1個點，設在南京大學。
力學專業2個點，分布在北京大學、中國科學技術大學。
心理學專業3個點，分布在北京師範大學、華東師範大學、浙江大學。
基礎醫學專業2個點，分布在北京大學、復旦大學。
中醫基礎專業2個點，分布在北京中醫藥大學、上海中醫藥大學。
基礎藥學專業1個點，設在中國藥科大學。
大理科試驗班1個點，設在南京大學。
國家文科基礎科學研究和教學人才培養基地的專業點的分布如下：
中國語言文學專業20個點：北京大學、復旦大學、南開大學、中國人民大學、北京師範大學、東北師範大學、福建師範大學、華東師範大學、浙江大學、中央民族大學、廣西師範大學、河南師範大學、湖北大學、暨南大學、南京師範大學、內蒙古師範大學、山東大學、陝西師範大學、上海師範大學、蘇州大學。
歷史學專業21個點 ：北京大學、復旦大學、南開大學、中國人民大學、吉林大學、南京大學、武漢大學、中山大學、北京師範大學、東北師範大學、華東師範大學、四川大學、西北大學、廈門大學、浙江大學、中央民族大學、湖南師範大學、華中師範大學、蘭州大學、首都師範大學、雲南大學。
哲學專業7個點：北京大學、復旦大學、南開大學、中國人民大學、吉林大學、武漢大學、中山大學。
經濟學專業13個點：北京大學、復旦大學、南開大學、中國人民大學、吉林大學、南京大學、武漢大學、福建師範大學、西北大學、 廈門大學、遼寧大學、上海財經大學、西南財經大學。
