呼吸系統感染病原學特點
1.常見細菌感染
呼吸道感染的常見細菌有葡萄球菌、鏈球菌、流感嗜血桿菌、卡他莫拉菌、肺炎克雷伯菌等，這些細菌大多為條件致病菌，數量明顯占優勢時，可提示有感染存在。在醫院內獲得性肺炎的病原體中，革蘭陰性桿菌占60%以上，以銅綠假單胞菌最多。在社區獲得性肺炎的病原體中，以革蘭陽性球菌和流感嗜血桿菌感染為主。
2.特殊病原體感染
免疫功能缺陷或免疫功能低下患者發生的呼吸系統感染，以真菌、肺孢子菌、巨細胞病毒及結核分枝桿菌等條件致病菌感染較多。
3.其他病原體感染
軍團菌、支原體、衣原體、病毒感染比例增加。上呼吸道感染多為病毒感染，肺部感染多為細菌感染。
實驗檢查項目的選擇
1.根據發病部位，選擇適當的標本進行病原學檢查。上呼吸道感染應取咽拭子或鼻咽拭子為樣本進行檢查；難以判斷病因的下呼吸道感染，可選擇痰液或肺泡灌洗液；出現胸腔積液時，應及時抽取送檢。
2.結合臨床症狀及病情，適當選擇檢查項目，如血液學、免疫學、微生物學和臨床化學等檢查，協助判斷病變程度和病程，監測療效。
3.根據臨床症狀，判斷是細菌感染或其他病原微生物感染，可選擇全血細胞計數、白細胞分類計數、血清C反應蛋白、降鈣素原、病毒抗原或抗體及核酸、軍團菌及肺炎鏈球菌尿抗原測定進行篩查。
常見呼吸系統感染性疾病的實驗診斷
1.急性上呼吸道感染
（1）全血細胞計數與白細胞分類計數：細菌感染時，白細胞計數和中性粒細胞計數增多，重者血塗片中可見中性桿狀核粒細胞增多伴核左移現象，以及中性粒細胞中毒現象。病毒性感染時，白細胞計數正常或偏低，淋巴細胞比例增加，偶爾可見異形淋巴細胞增多。血象變化缺乏特異性。
（2）病原體檢查：可取鼻或咽拭子做病毒或細菌培養、分離或鑑定，判斷病原體的類型，區別病毒和細菌感染。當培養發現優勢菌或致病菌生長時，可鑑定細菌類型並進行藥敏試驗，指導臨床用藥。主要病毒有流感病毒、腺病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒、柯薩奇病毒等，常見細菌為溶血性鏈球菌，其次為流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌和葡萄球菌等。套用分子生物學方法檢測核酸，能更快更準確的分離到病原體。
（3）血清學診斷：可用免疫螢光法、酶聯免疫吸附法檢測血清中的病原體抗體，要注意區別抗體的類型、測定滴度，出現IgM抗體時具有診斷意義。抗病毒抗體的檢測簡便、快速，比病毒培養鑑定更有使用價值。
2.肺炎
（1）常見病原體引起肺炎的實驗診斷：①在醫院獲得性肺炎中，最常見的致病菌是銅綠假單胞菌、金黃色葡萄球菌等，對於醫院獲得性肺炎至少應從不同部位採血做2次血培養，一般情況下，陽性率為20%左右。痰塗片革蘭染色在醫院獲得性肺炎的診斷中不敏感，缺乏特異性，分枝桿菌和一些真菌可通過痰塗片染色和培養做出診斷。②在社區獲得性肺炎中，最常見的致病菌是肺炎鏈球菌及支原體，最常見的病毒為流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒等。厭氧菌感染痰塗片可見大量細菌，但普通細菌培養卻為陰性。咳出的痰因為被口腔菌群污染，不適於厭氧菌培養，所以必須採用經皮肺穿刺、胸腔穿刺或帶保護刷的支氣管鏡獲取標本，才能用於厭氧菌培養。
（2）血清學診斷：急性期和恢復期雙份血清抗體滴度4倍變化（適用於支原體、衣原體、軍團菌、病毒等感染）。
（3）抗原檢查：流感病毒抗原檢測；肺炎鏈球菌及軍團菌的尿抗原檢測。
（4）核酸檢測：流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、冠狀病毒、人偏肺病毒、鼻病毒等病毒的核酸檢測，以及支原體、衣原體、軍團菌及卡式肺孢子菌的核酸檢測等。分子生物學方法可提高肺炎病原體的檢出率。
（5）血常規檢查：細菌性肺炎可見中性粒細胞和白細胞計數增多，核左移，感染嚴重者可有明顯的中毒現象。病毒性感染及結核感染時，淋巴細胞比例多升高，白細胞計數正常或偏低。
（6）血氣分析：對於判斷疾病的嚴重性及決定是否需要氧療有意義。
（7）胸腔積液檢查：對於出現胸腔積液的患者，要進行胸腔穿刺，並對胸腔積液的一般性狀、化學成分、有形成分、胸水常規和微生物學進行檢查，對於鑑別胸腔積液的性質、查明病原體有意義。
（8）1,3-β-D葡聚糖試驗（G試驗）與半乳甘露聚糖檢測（GM試驗）：輔助診斷真菌感染。
