瘋牛病
動物源性飼料的同源性污染的關注源於1985年英國爆發的瘋牛病。在對瘋牛病的研究中，研究人員最終確定牛的餵養飼料——牛、羊的動物肉骨粉造成了瘋牛產生及傳播。目前該病已在歐美國家爆發，亞洲的韓國、日本也受到波及，受影響的國家達100多個。瘋牛病也可以傳染給人，引起一種病死率極高的神經退化病——新型克雅病。
瘋牛病以及人新型克雅病都是由一種全新的病毒——朊毒體（Prion Protein，PrP）引起的。朊毒體與一般病毒最大的區別在於其不含有生物通用的遺傳物質——核酸，僅由蛋白質構成。朊毒體存在朊蛋白（正常型，PrPc）和阮病毒（致病型，PrPsc）2種形式，其差別只在於蛋白質分子的3級構像不同。PrPc是存在於生物體內的正常蛋白質，但當生物體感染PrPsc時，PrPsc能“強迫”正常的PrPc變成具有致病型的PrPsc。由於朊毒體主要存在於動物的腦部、脊髓等神經細胞中，所以會引發瘋牛病等神經疾病。
人類同源性污染
同源性污染不僅存在牛、羊中，有些科學家懷疑這種情況在人類自身也出現過。在19世紀60年代之前，巴布亞紐幾內亞福爾人中的庫魯人“人吃人”現象普遍，在後來的調查中發現，庫魯人中存在一種類似瘋牛病的腦神經疾病。遠古時代的穴居人也有食用同類的現象，有人類學家認為，類似瘋牛病的疾病蔓延是穴居人滅絕的一個可能原因。
其他
2006年我國曾爆發豬高溫症，雖然並沒有證據顯示這是由動物源性飼料引起的，但調查時發現這些豬場多數都使用動物源性飼料，且包括豬血、骨粉等。
同時“泔水豬”也存在潛在的同源性污染，農戶多收集餐廚垃圾，不經任何處理直接作為豬的飼料，餐廚垃圾中存在的豬油、豬肉、豬骨都與豬存在同源性，可能會導致豬產生某種疾病，同時進入人類食物鏈，傳染我們人類。
