主要研究領域： 茶葉加工與貿易、茶葉食品和飲料開發，食品物流管理等
先後主講課程： 茶葉加工學、茶葉化學、食品物流學、茶葉審評與檢驗學、茶葉深加工與綜合利用、茶葉生產機械化等。
主要研究成果： 先後主持和主研了“新型花茶香氣特徵和成分研究”、“信陽毛尖炒制中物質變化規律研究”、“名茶炒制節能灶研究”、“廣安松針的研製與開發”、”黔江珍珠蘭茶生產線建設及新產品開發”等科研及科技開發項目近20項，公開發表《臘梅花精油超臨界CO2萃取及GC-MS分析》、《窨制技術在茉莉花茶農殘轉移中作用》、《窨制技術因子對蠟梅花茶品質的影響》等論文和研究報告20餘篇，獲省市級科技成果10餘項（次），獲國家發明專利4項（“一種新型茉莉花茶的加工方法”、“一種臘梅花茶及其低溫窨制方法”、“一種針形綠茶的加工方法”、“縉雲毛峰包裝”）等。主持研製和開發的“西農毛尖”、“廣安松針”、“珍珠蘭茶”等茶葉產品在全國及國際名優茶評比中榮獲“金獎”或“銀獎”20餘個次。主編或參編出版了《食品企業經營管理學》、《窨茶香花栽培》、《飲茶學問知多少》、《中國茶葉大詞典》等4本大學教材或專著。
在研項目： 省級重大科技攻關項目“薯類綜合利用加工新產品研發”、“元寶健康茶產品開發”、“貴州省三尖杉繁育及系列產品開發研究”、“德江白茶綜合加工廠建設及新產品開發”等。
司輝清同志自2005年當選重慶市茶葉商會會長，重慶市茶葉學會秘書長以來，熱心群團工作，積極組織和調動社會各方力量，大力推動重慶茶葉產業的發展。先後主持完成了重慶市茶葉地方標準的制（修）定工作，組織開辦了評茶師（員）、名優茶加工技術、茶葉標準及QS認證等的技術培訓班；倡導並成功組織了重慶十大名茶評選、重慶茶業十強企業評選、“三峽杯”名優茶評比、中國（重慶）茶葉博覽會、健康重慶全民飲茶月等活動，並將這些工作逐漸規範化，發揮了行業領導應有的作用，推動了重慶茶葉產業快速健康發展。
