地理位置
本校位於台北市文山區與台北市區交界山群之南麓，因萬芳社區位於另一側而得名。山腳下約200公尺即為木柵地區通往景美及台北市區之重要幹道興隆路。山下亦與晚於本校創立之台北市立萬芳醫院（現為台北市立聯合醫院萬芳院區）以及興華國小相鄰。山上之道路通往萬芳社區。
校內格局
全校依山而建，正門為全校最低處，而操場位於最高處。一般教室由低而高為「忠孝樓」、「仁愛樓」、「信義樓」、「和平樓」，各樓間以多達二至三層之空中走廊連線，跨越其下的車道；若由較高棟之低樓層穿越空中走廊，則會抵達較低棟之高樓層。退休體育老師蘇兆貞先生（外號老禿）曾在課堂上表示，當初他建議操場應建於最低處，也就是大門一進門處，但未被採納。以致於現在操場的使用率偏低。
除四棟主要校舍外，自然科學以及音樂、美術等專科教室則規劃位於「科學樓」，亦以空中走廊與「和平樓」相連線，與其下之校內主幹道落差約達十公尺。
「和平樓」後即為籃球場及排球場，操場（草皮及跑道）又位於更上一層，有階梯及車道連線；操場地處高於全校所有建築的位置。
歷史
年代 事件／校長
1980~1989 陳金溪校長
1980 萬芳國中籌備處成立
1982 萬芳國中開始招生
1989~1994 黃鴻章校長
1994~1998 溫怡梅校長
1998~2003 周麗玉校長
1998 萬芳高中籌備處成立
1999 萬芳高中開始招生 / 保留國中部
2003~ 黃鴻章校長
校歌
「高崗巍巍校園青青學術融古今
諄諄善誘互勉互勵精粹相期許
今朝共聚讀書學禮傳聖賢古風
奮發自強孝悌忠勇效時代英雄
敬業樂群手腦並用修德求知樂無窮
報效國家造福社會萬芳明日是先鋒」
