經過30多年的辦學歷程，學校已形成了優良的校風、學風、教風。近年來，在各級領導的關懷下，校領導班子審時度勢，帶領全校教職員工順應新的教育形勢，積極轉變觀念，努力深化改革，全面推進素質教育。在“育人為本，尊重主體，最優發展，人人成才”的辦學思路的指導下，學校進一步明確了辦學目標：將南化二中辦成一所“學生高素質，教師高水平，管理高質量，適應21世紀發展需要的一流學校”。
春華秋實，學校取得了驕人的成績：學校的教育教學質量在本地區始終名列前茅；體育成績榮獲本地區“七連冠”，率先創辦了“體育特色班”，培養體育人才；師生在各級各類比賽中頻頻獲獎，捷報頻傳，令人矚目。
大膽的探索與實踐，學校積累了許多寶貴的辦學經驗。學校注重“科研興校”、“科研育師”，以“自我管理，創特色班級”為德育特色，教學特點是“自主學習，實施目標教學”，目前，學校正根據校情狠抓學生常規習慣，注重養成教育，大膽嘗試“分層次教學”，進行教學改革，積極培養學生的學習興趣，不斷提高教學質量。
2005年8月，本地區教育資源區域調整，原大廠中學國中部與南化二中整合，優勢互補，學校正式更名為“南京市南化第二中學”，校園面貌煥然一新，學校注入了新的活力，學校發展日新月異，這對全體師生都是一次機遇，更是一種挑戰，永不滿足的南化二中人正齊心協力，銳意進取，努力地凸顯辦學特色，去創造屬於南化二中的更大輝煌！
陳世錦校長簡介
陳世錦 南化第二中學校長 南京市“名校長”、南京市“勞模”、南京市教師高級職稱評審委員會委員 江蘇省心理學會發展委員會副會長、南京市中國小心理發展與指導委員會副主任 中學高級教師 中共黨員，擔任區教研室主任、校長20多年，勤於學習，筆耕不輟，教學理念新穎，辦學思想明確，有很強的前瞻性，大膽教學改革與探索，管理工作中堅持原則，善於創新，方法靈活，業績斐然，在師生中有很高的工作威信，發表教育教學論文60餘篇，在全國、省、市、區均有很高的知名度，曾獲南京市“名校長”、南京市“勞模”等光榮稱號。
國內首創“學科知識RAP”
近一年來，南化二中進行音樂課教學改革，將學科知識用rap的形式傳給學生，既琅琅上口，又便於記憶。把課本融入音樂，這是我國中學生教育的一大改革，既能讓大家學會了唱rap，又能幫助我們記憶那些難背的知識，還能激發學生的學習興趣。現全球除了德國一家學校之外，這是國內首創。
江蘇電視台城市頻道《南京零距離》、《絕對現場》欄目在2010年3月26日的開放日中對南化二中rap教學進行了特別報導。
作品展示：
物理版《青花瓷》
做太陽光的色散準備三稜鏡
紅橙黃綠藍靛紫順序要理清
紛紛色彩紅綠藍光的三原色
被光照反射吸收各一半
不透明的只反射自身的色光
而透明的只通過自身的色光
你的快瞬間不見 去到我追不上的地方
紅外線紫外線 我都看不見
光沿直線傳播 均勻介質里
平面鏡等大等距正立的虛像
只是光 的反射的套用
紅外線紫外線 我都看不見
遙控器驗鈔機 分別是套用
漫鏡面倆反射雖自顧自美麗 都遵循定律
紅外線紫外線 我都看不見
光沿直線傳播 均勻介質里
平面鏡等大等距正立的虛像
只是光 的反射的套用
紅外線紫外線 我都看不見
遙控器驗鈔機 分別是套用
漫鏡面倆反射雖自顧自美麗 都遵循定律
