1943年 中華民國三十二年
3月，國民政府採納于右任關於設立敦煌學院的建議，教育部委派高一涵、常書鴻為正副主任，負責籌備敦煌藝術研究所。
是歲，日本人鳥山喜一對吉林和龍縣西古城進行調查、發掘。
是歲，日本人大規模發掘遼祖阿保機陵寢。翌年又發掘一次。掠走阿保機夫婦的玉冊等。
1944年 中華民國三十三年
2月1日，敦煌藝術研究所正式成立，常書鴻被任命為所長，從重慶徵聘了20多位專業人員。抗戰勝利後，國民政府教育部明令撤銷研究所，工作人員紛紛離去。
10月31日，西北科學考察團歷史考古組夏作銘、閻文儒等開始對敦煌境內的漢長城遺址進行考察，並對玉門關、大方盤城、第17烽隧等作小規模發掘。
12月6日，夏作銘、閻文儒等赴甘肅安西縣南湖一帶，考察各舊城和榆林窟。
是歲，坪石淪陷，中山大學研究院1942年發掘海豐汕尾所獲古物八大箱全部遺失。
是歲，日本人挖掘遼上京城址里的瓷窯址和赤峰缸瓦窯屯的遼窯址，使窯址遭到毀壞。
1945年 中華民國三十四年
8月15日，日本無條件投降，溥儀的偽滿州國垮台。貯藏在偽皇官的名貴書畫（即所謂溥儀賞溥傑部分書畫），除有些損壞外，其餘散失，後由故宮博物院等單位收回一部分。
9月，中共膠東區委派出的幹部，在大連線收日本人開辦的遠東榨油廠期間，發現日本人劫藏的原屬羅振玉收藏的84盒1234片甲骨。經交涉，後秘密運至山東棲霞根據地保存。現為山東博物館收藏。
10月7日，國民黨第十一戰區司令長官孫連仲在故宮太和殿，主持受降典禮，接受了日本“北支”（華北）占領軍司令宮、陸軍中將根本博的投降。
10月23日，國民政府委派教育部平津地區特派員、北京大學教授沈兼士接收故宮博物院。除日偽委任的院長祝書元及少數高級職員外，故宮博物院全部職工均留原任。馬衡回平後仍任院長，沈兼士任文獻館館長。
是歲，西北科學考察團歷史考古組夏鼐在甘肅寧定縣陽窪灣發掘齊家文化墓葬，在填土中發現仰韶文化彩陶片，從地層上確認仰韶文化年代比齊家文化早。
