歷史沿革
蒙醫藥學院2010迎新生文藝晚會原內蒙古蒙醫學院是在1958年內蒙古自治區人民政府批准建立的哲里木盟通遼衛生學校的基礎上，於1978年12月28日經國務院批准建立的首批獲得學士學位授予權的醫藥高等院校之一，並通過了1997年國家教委組織的首批本科院校教學工作合格評價的院校。
1978年學院剛成立時名稱為哲里木盟醫學院（[78]教計字1427號）。當時哲里木盟隸屬吉林省管轄。哲里木盟醫學院分大學部和中轉部，大學部設蒙醫學和臨床醫學兩個本科專業。於1979吉林省教育廳又將哲里木盟醫學院更名為哲里木醫學院（吉教字[79]43號）。1979年招收了蒙醫學和臨床醫學兩個專業首屆本科學生。中專部於1984年分離恢復了哲里木盟衛生學校原建制。
哲里木盟於1979年秋回歸內蒙古自治區管轄之後，1980年10月，內蒙政府將正在籌建中的內蒙古民族醫學院從呼和浩特市遷址到通遼市與哲里木醫學院合併組建了內蒙古民族醫學院，從此學院改名為內蒙古民族醫學院，確立以蒙醫學教育為主題的辦學方針，於1987年2月7日改為內蒙古蒙醫學院（內政發[1987]6號），於同年4月20日召開成立大會，國家副主席烏蘭夫為內蒙古蒙醫學院來電題詞：“繼承和發揚蒙醫藥優秀遺產”，原衛生部部長崔月犁題寫校名：“內蒙古蒙醫學院”。
通遼地區地處內蒙古的東部，蒙古族人口絕對數在自治區各盟市中位居首位，占全區蒙古族人口的1/3，占全國蒙古族人口的1/4。當時民族醫學院選址通遼，是自治區政府對教育的地域平衡和民族分布的主要考慮。
學院於1981年創建蒙醫系，於1987年創建了蒙藥系。
學院於1985年開始組織編寫全國蒙醫藥高等教育第一版統編教材，共出版23部，截止1993年己全部投入使用，其中6門教材獲自治區和國家獎勵。這項工作填補了蒙醫高等教育無正規教材的空白。
蒙醫學專業於1985年被評為自治區重點扶持專業、蒙醫學學科於1987年被評為自治區重點學科。
1988年招收首屆蒙藥專業專科班級。
1995年增設招收蒙醫骨傷專科專業。
2000年7月16日通遼地區三所高校合併成立內蒙古民族大學，於10月14日成立蒙醫藥學院。
學院設施
截至2011年3月28日，學院設有基礎理論教研室、蒙醫診斷教研室、蒙藥學教研室、蒙醫方劑學教研室、蒙藥化學與藥理教研室、蒙藥鑑定教研室、藥物製劑教研室7個教研室；蒙醫基礎醫學實驗室（蒙醫基礎醫學實驗室、蒙醫診斷實驗室、多功能技能訓練室）、蒙藥生藥學實驗室（藥用植物實驗室、蒙藥鑑定實驗室）、蒙藥化學實驗室（蒙藥化學實驗室、蒙藥分析實驗室）、蒙藥藥理實驗室（蒙藥藥理實驗室、蒙藥毒理實驗室）、蒙藥製藥實驗室（蒙藥製藥工程實驗室、蒙藥方劑實驗室、蒙藥藥劑實驗室、蒙藥炮製實驗室）、蒙醫養生康復實驗室、民族醫學專業實驗室（蒙醫療術實驗室、蒙醫骨傷實驗室）7個實驗室，另設蒙醫藥陳列館、蒙藥標本館（藥用動物標本室、蒙藥藥材標本室）和18個實踐教學基地。
學院還擁有蒙醫藥研發國家民委-教育部重點實驗室、內蒙古自治區蒙醫藥重點實驗室、內蒙古高校蒙醫藥研發工程重點實驗室和內蒙古醫藥衛生重點實驗室（蒙醫基礎醫學實驗室、蒙醫診斷實驗室和蒙藥學實驗室）。建設的蒙藥研發國家工程實驗室（國家發改委立項）。
師資力量
截至2011年3月28日，有教職工50人，其中教授17人、副教授13人、高級實驗師5人；專職教師中博士12人、碩士15 人；享受國務院特殊津貼專家2人、國家藥典委員會委員1人，自治區有突出貢獻中青年專家2人、全國模範教師1人、自治區模範教師1 人、內蒙古勞動模範1人、自治區名蒙醫3人、內蒙古高校科技創新標兵1人、通遼市勞動模範1 人、自治區高校優秀共產黨員2人、優秀黨務工作者1、自治區“111”和“321”人才工程一層和二層人選5人；兼職博士生導師5人、專兼職碩士生導師32人。
課程建設
截至2011年3月28日，學院有自治區品牌專業（蒙醫學）1個，自治區示範課程（蒙藥學）1個，自治區精品課程（蒙醫基礎理論、蒙藥學、蒙醫方劑學）3個，自治區優質精品課程（蒙醫方劑學）1個，自治區實驗教學示範中心（蒙醫藥實驗教學中心）1個，自治區合格實驗室（蒙醫基礎醫學實驗室、蒙藥生藥學實驗室、蒙藥藥理實驗室、蒙藥化學實驗室、蒙藥製藥實驗室）5個；學校精品課程（蒙醫內科學、蒙醫溫病學、蒙藥化學）3個，優秀課程（蒙醫診斷學、蒙藥製劑學、分析化學、工業藥劑學）4個。
學科建設
截至2011年3月28日，學院有國家中醫藥管理局重點學科（蒙藥學科）1個，自治區重點學科（蒙醫學、蒙藥學）2個，學校重點學科2個；民族醫學、蒙藥學（一級學科）、蒙西醫結合醫學（一級學科，含基礎、臨床兩個二級學科）和專業學位碩士點2個一級學科5個二級學科碩士學位授予點和蒙醫學、藥物製劑（國家特色專業）、蒙藥學3個本科專業。每年招收本科生300餘名、碩士研究生近100餘人、留學生30餘名。
教材建設
截至2011年3月28日，學院與內蒙古醫學院等單位合作，編寫了蒙醫藥高等院校規劃教材25部，其中《蒙醫基礎理論》、《蒙醫方劑學》、《蒙醫兒科學》、《蒙醫療術學》分別獲國家教育部優秀教材一等獎、二等獎和三等獎。學院已在承擔編寫教育部和國家中醫藥管理局蒙醫藥規劃教材56部，已經出版教材20餘部。
在教學中，學院重視教學方法、教學內容和教學手段的更新和改革，不斷推進教育教學質量的進一步提高。本學科2項成果獲教育部教學成果一等獎，3項成果獲教育部教學成果二等獎，1項成果獲教育部教學成果三等獎，2項成果獲教育廳教學成果一等獎，5項成果獲自治區教育廳教學成果二等獎，23項教學成果獲校級教學成果獎。
人才培養
截至2011年3月28日，已培養出蒙醫藥高級專門人才4000餘人，在校本科生人數近1000名、碩士研究生260餘人、留學生100餘名。
科學研究
學院先後與黑龍江中醫藥大學、瀋陽藥科大學、遼寧中醫藥大學、吉林農業大學、中國藥科大學、華中科技大學、華北煤炭醫學院、內蒙古蒙藥股份有限公司、陝西步長製藥有限公司、奧特奇中蒙藥製藥有限公司等高校和企業建立了良好的協作關係。截至2011年3月28日，在蒙醫藥研究中獲國家專利8項，獲首例國家三類新蒙藥證書1項，獲國家新藥臨床研究批件5項，獲自治區科技進步二等獎1項、三等獎3項。2000年以來，學院共承擔了科研項目80餘項，其中國及科技支撐項目1項，國家自然科學基金項目3項，國家藥典項目4項，國家社科基金項目1項，教育部、國家中醫藥管理局課題5項，自治區教育廳、衛生廳、科技廳、自然科學基金項目等40餘項，學校項目50餘項。
學生工作
1999年，96級蒙醫本科班被教育部、共青團中央評為全國先進班集體；2001年，98級蒙醫本科班被教育部、共青團中央評為全國先進班集體標兵；2001年，學工辦被自治區教育廳和團委評為全區高校學生工作先進集體。2007年，在內蒙古自治區人事廳、教育廳、人民教育基金會聯合表彰中，學院獲得自治區教育系統先進集體稱號。
交流合作
學院十分重視國際交流與合作，先後與日本、韓國、加拿大、蒙古、美國等國家的相關大學建立了友好協作關係。截至2011年3月28日，學院先後派出10名教師出國攻讀學位或合作研究。通過合作、交流，提高了學院在國外的知名度，使學院教師的學術水平得到了提高，極大地推動了學院學科專業的建設與發展。
