傅朝佑字右君，江西臨川城北傅家村人。
少時即勤奮好學，師事鄒元標；善畫竹石。有孝行。萬曆四十年（1612）中解元，天啟二年（1622）中進士，授中書舍人。
崇禎三年（1630）參加“給事中”選拔考試，時值明朝收復清軍所占的永平（今河北盧龍縣）等地，他上疏陳述“善後七事”，被崇禎採納，錄為兵科給事中。四年八月，疏劾首輔周延儒有奸詐佞為之心，營救因諍言獲罪的朝臣章正宸、莊鰲獻而得罪了皇帝，調任工科給事中。他仍針對當時存在的問題，繼續勸諫皇上“納諫、恤民、擇相”，“勿以內批用輔臣，勿使中官司彈劾，勿令法外加濫刑”，要求撤消監視百官活動的錦衣衛，取締宦官練武，懲辦驕傲自滿、玩忽職守的武將，起用被埋沒的人才，責成有關部門修築城牆、儲備糧食、加強備戰等。因語言過於諍直，被剛愎自用的崇禎以“給南城益王后裔加封藩號”為藉口，將他調出。事後還歸鄉里。
崇禎九年（1636），他在家中接旨授為刑科都給事中，因延誤還朝期限被劾，貶調為地方官。行前，他又諍言直諫，痛揭當朝宰相溫體仁六大罪狀，即“得罪於天子；得罪於祖宗；得罪於天地；得罪於封疆；得罪於聖賢；得罪於心性”，懇請崇禎“大施明斷，速去體仁”。崇禎勃然大怒，將傅革職下獄。逾月，體仁亦罷。溫體仁罷相後，太監杜勛打算在皇帝面前為傅求情，要他上疏請罪。傅朝佑向來厭惡閹宦，寧肯坐牢，也不要杜為他活動復官。
崇禎十一年（1638）冬，清兵大舉進攻，邊境頻頻失守，明朝江山岌岌可危。崇禎不反躬自問，反而嫁禍於臣僚，監獄人滿為患。傅朝佑在獄中上書，要求崇禎嚴以律己，寬恤臣僚，群策群力，共扶明朝。結果再次觸怒崇禎，第二年（1639）春天，崇禎竟以“顛倒奸賢，擾亂國是，恣意訕侮”的罪名，將他廷杖六十大棍，傅朝佑傷重致死。
崇禎十七年（1644）五月，福王朱由崧即位後，察其冤情，下詔追復其原職，並以褒揚。
