歷史背景
1940年，侵華日軍第731部隊和南京“榮”字1644部隊策劃實施細菌戰，在衢州上空投放帶有鼠疫桿菌的糧食、碎布、紙張等物品，其中還混有大量跳蚤。到1941年，鼠疫已蔓延衢州58條街、12個鄉鎮。1942年6月，日軍攻占衢州後，又再次空投鼠疫、傷寒疾菌。據統計，1940年至1948年，侵華日軍在衢州進行細菌戰，造成衢州各地連續8年傳染病大流行，患傳染病死亡者約4萬人。
主要展覽
展覽館
為牢記侵華日軍犯下的滔天罪行，1998年，衢州市建立侵華日軍細菌戰衢州展覽館，展覽館面積300平方米，展出內容為“731部隊的罪行”、“衢州的災難深重”、“為尊嚴而鬥爭”、“正義的呼聲”等部分，並在館內豎立了一塊“銘記牌”，控訴了當年日軍的罪惡行徑。
館區展示
展廳一角在展廳里，觀眾可以看到日軍731部隊的實驗器材實物、反映受害者痛苦命運的紀錄片以及一部3D電影。電影中有空襲警報、敵機轟鳴、炸彈呼嘯和斷壁殘垣，用現代化科技手段再現了這段悲愴歲月。
在抗戰期間，衢州機場是沒有淪陷的且離日本本土最近的中國機場之一。為了報復日軍偷襲珍珠港，1942年4月18日，美軍由杜立特中校率領16架轟炸機，從太平洋上的大黃蜂號航空母艦起飛，奇襲東京，機群計畫就選擇在衢州落地。同年秋天，日軍發起旨在奪取衢州機場等戰略要地的浙贛戰役，在當地實施三光政策，並再次施放細菌武器。
獲得榮譽
該展覽館於2010年被浙江省委、省人民政府公布為浙江省愛國主義教育基地；2011年被浙江省人民政府公布為浙江省文物保護單位。
