1966年無產階級文化大革命開始後,兵團黨委機關被人民民眾組織奪權,原兵團黨委機關報《生產戰線》受到批判,被迫停刊。1967年7月,兵團黨委機關的民眾組織成立“新疆軍區生產建設兵團機關《主沉浮》編輯部”以《主沉浮》報取代了《生產戰線》報。1968年9月,新疆維吾爾自治區革命委員會成立後,中國人民解放軍新疆軍區生產建設兵團黨委的內部機制也逐步得以健全,在此形勢下,1969年春,兵團黨委決定取消《主沉浮》報編輯部,重新組建編輯部,出版新的機關報《軍墾戰報》,《主沉浮》報隨即停刊。
《主沉浮》報出刊期間是新疆文化大革命比較混亂的時期,該報的內容主要反映文革時期各民眾組織的奪權活動和當時國內外及新疆、兵團各地的政治形形勢,不反映兵團的工農業生產和人民民眾生活的狀況,已經偏離了兵團黨委機關報的辦報宗旨。他實際是文革特殊時期新疆軍區生產建設兵團黨委機關報《生產戰線》和《軍墾戰報》之間的過渡性報刊。