光電院的戰略定位是面向國家戰略需求和國際科技前沿，以光電工程、航天航空及其套用技術領域系統集成創新為主線，以前沿領域探索研究、總體共性技術攻關、綜合支撐平台建設和科技領軍人才煉成為重點，創新總體管理體制、集成綜合優勢力量、提出系統解決方案、組織重大戰略任務、發展戰略新興產業，著力提升戰略規劃引領能力、總體策劃執行能力、系統協同攻關能力，集成套用服務能力，成為可持續帶動國家光電、空天及其套用技術顯著發展的總體性科研機構。
光電系統工程部主要圍繞光電信息獲取系統、新型雷射系統及其套用，以及光電探測、測量和和套用標準等技術領域開展工作。對有關光電領域科學與套用的重大項目實施管理，建立質量標準體系和必要的技術保障條件。組織實施重大項目中開展總體設計、系統集成和運行管理並提供總體技術、專項技術、配套技術等技術支撐服務；根據任務需要，組織進行總體設計和系統集成中的關鍵技術攻關。
光電系統工程部投影光學研究室現承擔國家重大科技專項02專項、國家儀器開發專項等多項研發任務。由於項目發展需要，現面向院內外公開招聘工作人員若干名。
