研究院遵循“章魚模式”發展，建設人才聚集高地、領銜大項目高地和做一流研究高地。 研究院的目標是以“轉化醫學”為目地，積極推動生命科學與醫學臨床、護理科學的有機結合，建立基礎科學與臨床需求的緊密聯繫。 研究院的院訓是“銘誠、卓毅、協作、拓新”。 機構設定：中國首醫研究院實行平台管理委員會領導下的首席科學家負責制，管理上遵循國際通用的PI管理模式。研究院配置了國際先進的科研設備，創建了獨特的共享體制。機制上採用靈活的方式與北京各級醫院進行共建。 研究院下設六個臨床治療與護理中心即：老年病治療中心、老年病護理中心、骨傷科疾病的臨床治療與護理中心、風濕科疾病的臨床治療與護理中心、口腔科疾病（口腔矯形）臨床治療中心、婦科疾病臨床治療與護理中心、泌尿生殖系統疾病的臨床治療中心、心腦血管疾病治療中心。 研究方向：以國家中長期科技規劃以及國家、北京的經濟建設和社會發展設計組織項目申請和團隊建設為出發點，設立的主要研究方向包括：老年性疾病、骨傷科疾病、康復醫學、口腔疾病與口腔矯形、風濕性疾病、婦科疾病、不孕不育、男科疾病、疼痛性疾病、醫療護理、創新藥物和結構生物學等。 科研隊伍：現有主任醫師、副主任醫師、博士、碩士、等高級科研人員60多名，中初級醫技人員80多名，並吸納海內外優秀博士畢業生以博士後的身份參加相關研究團隊的科研工作。 目前已形成的研究團隊包括：風濕病研究團隊，骨傷科疾病研究團隊，口腔科疾病研究團隊、老年性疾病研究團隊、婦科疾病研究團隊、泌尿生殖系統疾病研究團隊。廣大的科研人員收集了古今中外治療的方法，認真篩選、潛心研究，將深厚紮實的基礎理論與豐富的臨床經驗相結合。 研究平台：中國首醫研究院以北京十多家大中型醫院為依託，成立了生命科學與臨床醫學、臨床與護理的研究方向；目前已建成研究平台有：風濕病研究平台，骨傷科疾病研究平台，口腔科疾病研究平台、老年性疾病研究平台、婦科疾病研究平台、泌尿生殖系統疾病研究平台。現已擁有價值十萬元以上的大型儀器多台，包括螺旋CT、半導雷射治療儀。體外衝擊波、體譜儀、顯微切割儀、流式細胞儀、多功能掃瞄器、DNA合成儀等。通過開放共享的機制，研究院將為醫學研究工作者提供高水平的技術支持和服務。
