為了適應民航業對安全領域系統研究和高級管理人才培養的需求,在民航總局的支持下,2002年中國民航學院集中全校從事安全管理及技術研究的優勢資源,組建了安全科學與工程學院。
安全學院開設了中國民航安全領域第一個也是目前唯一一個《安全技術及工程》碩士點,並開設了安全工程、公共事業管理本科專業,2015年增設套用心理學專業。目前,碩士點及本科專業均獲得了考生和民航企事業單位的普遍認可。特別是,安全技術及工程碩士點自開始招生以來,無論從第一志願報考人數到考生質量一直名列民航學院各碩士點之首。
2016年中國民航大學院系調整,安全學院被撤銷,下屬的公共事業管理專業調整至法學院;安全工程專業調整至經濟與管理學院;套用心理學本科專業、安全技術及工程被調整飛行技術學院。