1、北京東正教總會
北京東正教總會，亦稱中國東正教會、中華東正教會。1956年成立的獨立自主的中國東正教機構，由北京東正教總會更名而來，最初為俄羅斯正教在中國傳教的主要機構，即北京東正教傳教士團。1955年根據中蘇林故宮政府達成協定，兩國東正教會的代表在上海舉行會議，莫斯科和全俄東正教會同意中國東正教會取得獨立自主地位和權力。此後中國人姚福安（俄裔）大主教領導中華東正教會，1966年停止活動，1984年哈爾濱東正教會又恢復活動。
2、哈爾濱東正教會
中國東正教地方教會之一，1922年成立，信徒人數達30萬，多為俄喬。1898年東正教在哈爾濱始建尼古拉教堂，1899年再建聖尼古拉教堂，1900-1930年又陸續建教堂20座。此外還有中東鐵路沿線14座教堂、長春地區聖尼古拉教堂、大連和旅順等地的教堂和修道院。最初由北京東正教總會管轄，1922年歸屬亡國南斯拉夫的俄羅斯正教國外臨時主教公會，1945年後接受莫斯科和全俄牧首公署領導，1950年重歸北京東正教總會領導。曾任教職者有麥基都主教、梅列基大主教、以及中國人何海林、王玉林等，辦有神學院、醫院、孤兒院、學校、工廠和商店。1966年停止活動，1984年恢復。
3、天津東正教會
1920年成立，由北京東正教總會管轄，東正教在天津傳播，始於1840年鴉片戰爭以後，當時在天津從事皮毛、茶葉等貿易的俄國商人和其他信仰東正教的俄國僑民沒有教堂，為滿足教徒們過宗教生活的需要，北京東正教總會於1904年在天津海城北小關街建立第一個東正教祈禱所，並委派一名祭司在這裡主持日常宗教活動。1929年成立聖母帡幪大堂，此後又建有聖英諾肯提乙教堂、聖尼古拉教堂、聖謝拉菲姆教堂和聖眾教堂。曾有拉祖莫夫大司祭、維克托爾修士大司祭、以及中國人杜潤臣司祭和杜立昆司祭等主持教務，辦有俄國醫院、國小、圖書館，信徒多為俄喬，1956年俄僑離華後其人數銳減，1966年停止活動。
4、上海東正教會
1924年成立，由北京東正教總會管轄，東正教傳入上海後於1902年在閘北建立第一座東正教堂，1917年俄國十月革命後，隨著來上海的俄國僑民的增加，上海東正教會在多方的支援下，又陸續建造了許多教堂。1932年在新樂路又新建稱為聖母大堂的斯拉夫式大圓頂教堂。此後還建造起皋蘭路和惠民路東正教堂、紹興路東正教修道院、以及衡山路和常熟路的祈禱所。其信徒多為俄僑。中國東正教協會是上海唯一的中國東正教組織，該協會成立於1935年，其宗旨為：使中國東正教徒與俄國東正教徒團結在上海東正教會的周圍。上海東正教會與國外的東正教會的關係，1917年俄國十月革命後，東正教力量被削弱。1918年1月，蘇維埃政府發布了政教分離的法令，以吉洪牧首為首的俄羅斯東正教會反對這一法令，並公開號召教徒不與蘇維埃政權合作。因此吉洪牧首於1922年被當局逮捕。中華人民共和國成立後，1956年上海的俄國僑民教徒陸續離華，1966年“文化大革命”開始後，上海東正教會的活動全部停止，迄今仍未恢復活動。
5、漢口東正教會
漢口東正教會成立於1876年，是中國地方東正教會之一，受北京東正教總會領導，該教會要比上海等地的中國東正教會的歷史早得多。1902年後，漢口東正教會大力開展傳教活動，此外教會還在漢口創辦了俄國東正教國小和中學各一所。1917年，俄國十月革命後，漢口東正教會的經費來源靠俄國商人的資助和教徒的奉獻來解決。1956年，獨立自主的中華東正教會正式成立後，德樹志司祭任漢口東正教會負責人，積極開展東正教活動，1966年因“文化大革命”宗教活動停止至今。
6、新疆東正教會
新建東正教會成立於1925年，受北京東正教總會領導。東正教最初傳入中國是在18世紀後期，當時，一些不堪忍受沙俄帝國政府的壓迫和剝削的俄羅斯人紛紛逃到中國新疆，他們之中大多數人信仰東正教。1906年在迪化（今烏魯木齊）建立教堂，1915年在伊寧、1921年後在塔城和綏定等地也建教堂，1931年時信徒達1萬多人，主要為俄僑，曾有波克羅夫斯基大司祭、克拉索夫大司祭等主持教務，1954年俄僑回國後，在俄羅斯中仍有數千信徒。
