分會的主要任務：堅持全國學會宗旨，根據全國學會的學術活動方針和總體計畫，依據分會業務範圍所規定的內容，在高校圖書館系統內組織會員和圖書館工作者開展國內外學術交流、促進學科發展，弘揚科學精神;反映會員和圖書館工作者的意見和要求，維護其合法權益;舉薦人才，表彰、獎勵在學術和學會工作中取得優秀成績的會員和圖書館工作者;接受委託，承擔項目評估、標準制定、成果鑑定及專業職務資格評審;組織、舉辦專業展覽，編審專業文獻，提供專業諮詢和專業服務;認定會員資格，開展對會員和圖書館工作者的繼續教育和培訓工作;舉辦為會員服務的事業和活動;利用圖書館陣地，面向社會公眾組織開展科普教育活動等。
分會的組織工作：分會秘書處與教育部全國高校圖書情報工作指導委員會秘書處一個機構兩塊牌子，實行統一領導，分工合作；分會接受全國學會和掛靠單位北京大學圖書館的領導。全國學會對分會承擔監督、管理、指導、協調、服務工作。分會的辦事機構在行政、財務、外事、人事等方面受掛靠單位領導。
2004年10月11—14日在山東威海召開了“中國圖書館學會高等學校圖書館分會”成立大會。來自教育部、文化部有關部門領導，及全國各省、自治區、直轄市高等學校系統的90多位會員代表和嘉賓出席了大會。大會採取等額不記名投票選舉方式，選舉產生了由91位委員組成的高等學校圖書館分會第一屆委員會。在第一屆委員會全體委員會議上，選舉產生了由34位常務委員組成的常務委員會，同時選舉產生了委員會的主任委員和副主任委員及秘書長。
教育部高等學校圖書情報工作指導委員會副主任、北京大學圖書館館長戴龍基擔任第一屆委員會主任委員，副主任委員由中國圖書館學會中出自高等學校圖書館的常務理事擔任，他們是：莊琦(上海交大)、薛芳渝(清華大學)、朱強(北京大學)、楊東梁(中國人民大學)、阿拉坦倉(內蒙古大學)、胡越(首都師範大學)、閻世平(南開大學)、程煥文(中山大學)，建議由教育部高等學校圖書情報工作指導委員會副主任、原北京地區高等學校圖書館學會理事長、首都師範大學圖書館館長鬍越擔任常務副主任委員，協助主任委員工作，教育部高等學校圖書情報工作指導委員會副主任兼秘書長朱強擔任副主任委員兼秘書長。會後，根據分會秘書處日常工作需要，經研究增補中央財經大學圖書館副館長顧文佳為高校分會常務副秘書長。
