歷史沿革
1955年2月11日，為適應人民解放軍開始進行的大規模革命化、正規化、現代化建設的需要和黨的中央局、中央分局的設定情況，國務院發布《關於全國軍區重新劃分的決定》，決定將6個大軍區改劃為12個大軍區，其中華東軍區改編為南京軍區；
1956年4月，國務院決定將原屬南京軍區建制的福建、江西兩個省軍區劃出,單獨組建福州軍區。
1985年7月，中共中央、國務院、中央軍委正式批准《軍隊體制改革、精簡整編方案》，決定將11個大軍區調整為7個大軍區，其中將福州軍區併入南京軍區；
2015年11月24日至26日，中央軍委召開改革工作會議，部署深化國防和軍隊改革任務。在這次會議上形成了軍委管總、戰區主戰、軍種主建，領導指揮體制改革的總原則。在總原則下著力構建軍委-戰區-部隊的作戰指揮體系和軍委-軍種-部隊的領導管理體系。
2016年2月1日，隨著中國人民解放軍東部、南部、西部、北部、中部五大戰區的成立，瀋陽、北京、蘭州、濟南、南京、廣州、成都等七大軍區的番號撤銷。
機構職責
南京軍區，中國人民解放軍七大軍區之一，領導和指揮江蘇、浙江、安徽、福建、江西五省和上海市境內的所屬武裝力量。
南京軍區的主要作戰使命是保衛上海、南京、杭州、蘇州等東南沿海發達的特大城市和工業區的安全。
部門設定
中國人民解放軍南京軍區是中國人民解放軍主管江蘇、安徽、浙江、江西、福建、上海五省一市軍事事務的大軍區，總部設於南京。
