上海市化工職業病防治院成立於1969年5月，1970年6月正式對外服務。單位成立伊始名稱為“上海市化工局職業病防治研究所”，1984年9月更名為“上海市化工職業病防治研究所”。1998年6月30日依照上海市醫療機構登記管理辦法進行補辦執業登記，並標準冠名為“上海市化工職業病防治院”。註冊地址：上海市成都北路369號。原主管部門：上海華誼（集團）公司。2006年4月本院由上海華誼（集團）公司整建制劃歸上海市安全生產監督管理局管理，成為上海市安全生產監督管理局的直屬單位之一，具備安全領域和職業衛生領域的服務資質、同時具備職業安全衛生評價、檢測、診斷、體檢、救治、化學品信息諮詢等全面綜合服務能力。是上海市衛生局批准的從事職業病防治工作的專門機構。
職業工人本院設有化學事故應急救援辦公室、職業病科、健康體檢科、職業安全衛生檢測與評價中心、上海化學毒物諮詢中心、化學品專業知識培訓部、《職業衛生與應急救援》雜誌編輯部、上海天麟安全管理諮詢有限公司等業務機構。政府在本院設定的機構有上海市化學品登記註冊辦公室等。目前本院有專業技術人員108人，其中高級職稱15人，中級職稱46人。本院主要開展職業病危害事故及突發性化學中毒事故的調查處理、職業性健康檢查和評價、職業病門診、職業病臨床診斷與治療、職業流行病學調查研究、中毒事故應急救援、化學毒物信息諮詢、化學品專業知識培訓、建設項目或生產經營單位安全評價、建設項目職業衛生評價、工作場所職業病危害因素檢測與評價、職業病防治技術指導工作等。
近5年本院參加化學事故醫療搶救市內外會診50餘次、應急救援出動13次。主要有：
2002年3月27日上海寶山倉庫燃爆事故；
2002年7月19日上海有機錫中毒事故；
2003年11月28日嘉定區某化工廠氯氣泄漏事故；
2003年12月23日重慶開縣天然氣井噴特大事故；
2004年4月17日重慶天原化工總廠氯氣泄漏爆炸事故；
2004年8月2日上海延安東路隧道氧化鋅煙霧擴散事故；
2005年滬寧高速公路江蘇淮安段氯氣泄漏事故、上海南匯氨罐泄漏事故；
2006年四川九寨溝甲苯二異氰酸酯泄漏事故、漢宜高速公路硫酸二甲酯泄漏事故等。
